More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1313 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1313  putative citrate lyase beta subunit  100 
 
 		 275 aa  533  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00470  citrate lyase beta subunit  58.85 
 
 		 296 aa  253  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1391  HpcH/HpaI aldolase  52.94 
 
 		 277 aa  241  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375922  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  52.27 
 
 		 282 aa  241  7.999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1409  HpcH/HpaI aldolase  52.59 
 
 		 279 aa  238  9e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000390566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2925  HpcH/HpaI aldolase  51.5 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.253914  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3317  Citrate (pro-3S)-lyase  49.44 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12520  citrate lyase beta subunit citE  50.38 
 
 		 273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2104  HpcH/HpaI aldolase  57.46 
 
 		 285 aa  218  7.999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.87307  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  47.71 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1361  HpcH/HpaI aldolase  46.47 
 
 		 295 aa  216  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06890  citrate lyase beta subunit  51.97 
 
 		 292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  47.37 
 
 		 271 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3848  HpcH/HpaI aldolase  56.46 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3632  HpcH/HpaI aldolase  46.01 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3627  HpcH/HpaI aldolase  46.01 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3700  HpcH/HpaI aldolase  46.01 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  42.59 
 
 		 278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  40 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  45.73 
 
 		 293 aa  167  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  41.13 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4374  HpcH/HpaI aldolase  42.65 
 
 		 278 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3436  HpcH/HpaI aldolase  44.28 
 
 		 278 aa  156  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  40.5 
 
 		 282 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  40.14 
 
 		 282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  41.88 
 
 		 276 aa  155  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  42.28 
 
 		 281 aa  155  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  39.58 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  37.69 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  38.63 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  43.82 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  37.92 
 
 		 274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  41.9 
 
 		 288 aa  145  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  43.77 
 
 		 289 aa  145  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.52 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  36.57 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  39.1 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1535  Citryl-CoA lyase  40.86 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  40 
 
 		 274 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  40 
 
 		 274 aa  140  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  37.36 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0092  HpcH/HpaI aldolase  38.91 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  33.45 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  33.71 
 
 		 282 aa  139  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  33.7 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  39.69 
 
 		 289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  35.09 
 
 		 292 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  36.6 
 
 		 268 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2324  Citrate (pro-3S)-lyase  43.75 
 
 		 347 aa  135  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  41.09 
 
 		 297 aa  136  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  35.09 
 
 		 292 aa  135  8e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  38.43 
 
 		 279 aa  135  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  38.65 
 
 		 286 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  40.6 
 
 		 276 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  35.93 
 
 		 269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  43.98 
 
 		 266 aa  133  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2705  citrate lyase  37.23 
 
 		 296 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  39.85 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  36.65 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0268  Citryl-CoA lyase  35.94 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  39.85 
 
 		 274 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1878  HpcH/HpaI aldolase  41.01 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.820651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  38.3 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  31.23 
 
 		 296 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  38.72 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  36.19 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  30.63 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  37.06 
 
 		 287 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  38.81 
 
 		 271 aa  125  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  37.69 
 
 		 277 aa  125  8.000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.67 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  34.67 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.67 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  36.36 
 
 		 274 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  40 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  35.92 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  33.59 
 
 		 275 aa  123  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  31.34 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  34.75 
 
 		 305 aa  122  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  34.75 
 
 		 302 aa  122  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  33.83 
 
 		 276 aa  122  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  37.91 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  35.21 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  35.14 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  37.91 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  35.56 
 
 		 406 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  37.55 
 
 		 277 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  38.01 
 
 		 278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  29.96 
 
 		 269 aa  119  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  35.27 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  33.57 
 
 		 292 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  35.02 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  37 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1255  Citrate (pro-3S)-lyase  36.46 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327749  normal  0.0181011 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  37.07 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  32.04 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  32.04 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  32.04 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  34.31 
 
 		 278 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  36.23 
 
 		 267 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>