More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6108 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 268 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  51.56 
 
 		 276 aa  225  7e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  49.81 
 
 		 274 aa  223  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  49.81 
 
 		 274 aa  223  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  44.66 
 
 		 270 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  45.25 
 
 		 269 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  44.96 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  45.8 
 
 		 291 aa  204  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  42.8 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  45.56 
 
 		 291 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  44.44 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  44.44 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  45.02 
 
 		 295 aa  195  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  46.36 
 
 		 270 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  44.87 
 
 		 274 aa  195  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  46.49 
 
 		 273 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  43.45 
 
 		 270 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  43.82 
 
 		 278 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  41.2 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  40.22 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  40.77 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  44.14 
 
 		 279 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  41.63 
 
 		 274 aa  181  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  46.44 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  43.87 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  49.24 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1689  HpcH/HpaI aldolase  52 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.69146  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  43.45 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  43.12 
 
 		 290 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  39.7 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  45.9 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  37.64 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  39.1 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  38.01 
 
 		 274 aa  158  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  38.35 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  41.26 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  41.04 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  41.04 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  42.16 
 
 		 289 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  41.06 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  35.45 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  41.35 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  35.19 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  39.41 
 
 		 267 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  39.02 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  37.59 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  41.79 
 
 		 274 aa  145  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1361  HpcH/HpaI aldolase  35.29 
 
 		 295 aa  145  9e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  40.23 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  36.74 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  35.42 
 
 		 310 aa  142  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3317  Citrate (pro-3S)-lyase  37.08 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  38.81 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3835  putative aldolase/citrate lyase  42.59 
 
 		 276 aa  138  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  37.09 
 
 		 286 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  35.4 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1391  HpcH/HpaI aldolase  38.97 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375922  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1107  HpcH/HpaI aldolase  44.24 
 
 		 189 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1409  HpcH/HpaI aldolase  40.59 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000390566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  38.66 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  36.12 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00470  citrate lyase beta subunit  40.62 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06890  citrate lyase beta subunit  35.64 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2925  HpcH/HpaI aldolase  40.53 
 
 		 310 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.253914  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3032  HpcH/HpaI aldolase  32.58 
 
 		 289 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  34.92 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2742  HpcH/HpaI aldolase  31.82 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00490393 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0204  HpcH/HpaI aldolase  31.95 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.446132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  32.53 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  28.88 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  31.43 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4374  HpcH/HpaI aldolase  35.38 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  35.51 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  34.31 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  39.33 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  32.85 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1039  HpcH/HpaI aldolase  35.93 
 
 		 271 aa  126  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  31.77 
 
 		 294 aa  125  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  34.88 
 
 		 280 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.517185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  33.45 
 
 		 304 aa  125  7e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2378  HpcH/HpaI aldolase  34.98 
 
 		 306 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.0302108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4282  HpcH/HpaI aldolase  34.09 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.174407 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3632  HpcH/HpaI aldolase  35.47 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3627  HpcH/HpaI aldolase  35.47 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3700  HpcH/HpaI aldolase  35.47 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  30.8 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  33.69 
 
 		 277 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  33.92 
 
 		 278 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  35.42 
 
 		 280 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  35.42 
 
 		 280 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1313  putative citrate lyase beta subunit  36.98 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4009  HpcH/HpaI aldolase  34.6 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  decreased coverage  0.00557053 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4467  HpcH/HpaI aldolase  33.21 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.99201  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19950  citrate lyase beta subunit  33.33 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.251575  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  30.11 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  32.45 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  35.06 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  31.34 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00870  citrate lyase beta subunit  33.45 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0531316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  31.34 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>