More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1409 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1409  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 279 aa  556  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000390566 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1391  HpcH/HpaI aldolase  81.23 
 
 		 277 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375922  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2925  HpcH/HpaI aldolase  59.55 
 
 		 310 aa  280  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.253914  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  53.48 
 
 		 282 aa  274  9e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  53.31 
 
 		 271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3317  Citrate (pro-3S)-lyase  56.04 
 
 		 280 aa  268  7e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  51.1 
 
 		 267 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3632  HpcH/HpaI aldolase  53.56 
 
 		 272 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3627  HpcH/HpaI aldolase  53.56 
 
 		 272 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3700  HpcH/HpaI aldolase  53.56 
 
 		 272 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00470  citrate lyase beta subunit  56.55 
 
 		 296 aa  255  6e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12520  citrate lyase beta subunit citE  54.78 
 
 		 273 aa  254  9e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1361  HpcH/HpaI aldolase  49.82 
 
 		 295 aa  249  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2104  HpcH/HpaI aldolase  55.52 
 
 		 285 aa  238  6.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.87307  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1313  putative citrate lyase beta subunit  52.59 
 
 		 275 aa  237  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06890  citrate lyase beta subunit  52.31 
 
 		 292 aa  225  5.0000000000000005e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3848  HpcH/HpaI aldolase  57.09 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  40.5 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  39.07 
 
 		 278 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  39.48 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4374  HpcH/HpaI aldolase  38.71 
 
 		 278 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  36.3 
 
 		 282 aa  139  7e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  38.6 
 
 		 291 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  40.56 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.06 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  38.24 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  40.22 
 
 		 276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  38.06 
 
 		 275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3436  HpcH/HpaI aldolase  38.93 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  34.8 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  34.19 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  40.54 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  34.38 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  34.38 
 
 		 292 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  38.52 
 
 		 273 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  35.66 
 
 		 274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  38.55 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  38.55 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  38.21 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  38.87 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2324  Citrate (pro-3S)-lyase  44.04 
 
 		 347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  37.45 
 
 		 275 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1535  Citryl-CoA lyase  38.06 
 
 		 283 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  34.86 
 
 		 283 aa  126  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  34.11 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  42.34 
 
 		 271 aa  125  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  39.16 
 
 		 279 aa  125  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  37.63 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  35.13 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.88 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  33.46 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  35.13 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  35.13 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  34.38 
 
 		 406 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  40.43 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  39.35 
 
 		 275 aa  122  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  33.1 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  36.9 
 
 		 271 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  31.96 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  34.66 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  34.66 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  36.4 
 
 		 277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  30.26 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  36.59 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  32.18 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  31.01 
 
 		 304 aa  119  3.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  35.53 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  36.59 
 
 		 274 aa  118  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  34.4 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  32.62 
 
 		 287 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  37.27 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  36.17 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  36.17 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  33.57 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0268  Citryl-CoA lyase  30.28 
 
 		 292 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  28.42 
 
 		 296 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  32.73 
 
 		 282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  31.77 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  33.22 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2705  citrate lyase  30.85 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  33.22 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  30.95 
 
 		 306 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  35.92 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  31.6 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  35.93 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  36.82 
 
 		 289 aa  113  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  31.69 
 
 		 282 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2027  citrate lyase, beta subunit  31.6 
 
 		 291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  33.22 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  36.82 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  28.62 
 
 		 289 aa  112  5e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  34.55 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  35.92 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2320  citrate lyase, beta subunit  31.25 
 
 		 301 aa  112  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  39.49 
 
 		 289 aa  112  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  31.69 
 
 		 282 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1878  HpcH/HpaI aldolase  37.68 
 
 		 279 aa  112  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.820651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  38.65 
 
 		 290 aa  112  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0293  HpcH/HpaI aldolase  36.46 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  31.23 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.488048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>