More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4374 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4374  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 
278 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  86.69 
 
 
278 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3436  HpcH/HpaI aldolase  60 
 
 
278 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  58.99 
 
 
281 aa  296  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1878  HpcH/HpaI aldolase  60.07 
 
 
279 aa  289  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.820651  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1535  Citryl-CoA lyase  61.62 
 
 
283 aa  287  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  46.48 
 
 
291 aa  229  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0268  Citryl-CoA lyase  44.84 
 
 
292 aa  227  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283754  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  43.34 
 
 
293 aa  222  4e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  45.39 
 
 
283 aa  219  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2705  citrate lyase  42.47 
 
 
296 aa  215  8e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  43.42 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  43.11 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0092  HpcH/HpaI aldolase  42.16 
 
 
293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5821  HpcH/HpaI aldolase  39.65 
 
 
297 aa  195  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.577572  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0293  HpcH/HpaI aldolase  47.57 
 
 
291 aa  192  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2314  citrate (pro-3S)-lyase  47.04 
 
 
289 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  38.52 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  38.69 
 
 
282 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1255  Citrate (pro-3S)-lyase  38.46 
 
 
289 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327749  normal  0.0181011 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2758  putative citrate lyase beta chain (acyl lyase subunit)  37.89 
 
 
290 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1313  putative citrate lyase beta subunit  41.91 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  37.41 
 
 
267 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1391  HpcH/HpaI aldolase  39.22 
 
 
277 aa  142  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375922  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  36.64 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  36.9 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2104  HpcH/HpaI aldolase  41.76 
 
 
285 aa  140  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.87307  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  36.33 
 
 
275 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1409  HpcH/HpaI aldolase  38.35 
 
 
279 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000390566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2925  HpcH/HpaI aldolase  39.78 
 
 
310 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.253914  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3632  HpcH/HpaI aldolase  37.31 
 
 
272 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3627  HpcH/HpaI aldolase  37.31 
 
 
272 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3700  HpcH/HpaI aldolase  37.31 
 
 
272 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.17 
 
 
294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1361  HpcH/HpaI aldolase  34.91 
 
 
295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  33.8 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1188  Citryl-CoA lyase  36.62 
 
 
292 aa  133  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  35.17 
 
 
292 aa  133  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  34.55 
 
 
274 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  39.03 
 
 
281 aa  133  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1285  citryl-CoA lyase  34.93 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  35.17 
 
 
292 aa  132  6e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  37.62 
 
 
293 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00470  citrate lyase beta subunit  40.38 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  39.93 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  35.06 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12520  citrate lyase beta subunit citE  37.13 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  34.69 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  32.87 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  37.09 
 
 
270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  38.3 
 
 
297 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  34.93 
 
 
277 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  32.17 
 
 
306 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.4 
 
 
280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.4 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  32.17 
 
 
306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  37.5 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.4 
 
 
280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.4 
 
 
280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  37.41 
 
 
295 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4219  Citrate (pro-3S)-lyase  36.99 
 
 
311 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.114392 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  33.57 
 
 
269 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.14 
 
 
280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  36.14 
 
 
280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.14 
 
 
280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  37.11 
 
 
406 aa  126  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  36.62 
 
 
275 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  31.5 
 
 
270 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  35.15 
 
 
290 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  34.88 
 
 
282 aa  122  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  34.74 
 
 
271 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  36.5 
 
 
278 aa  122  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  37.06 
 
 
278 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  37.59 
 
 
275 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  32.03 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3317  Citrate (pro-3S)-lyase  37.36 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  33.45 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  35.47 
 
 
279 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  29.14 
 
 
269 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  32.87 
 
 
293 aa  120  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  34.42 
 
 
279 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  35.04 
 
 
275 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  34.67 
 
 
292 aa  119  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  33.8 
 
 
295 aa  119  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  30.07 
 
 
276 aa  118  9e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  30.26 
 
 
293 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  33.68 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  35 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  29.67 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  35.82 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  34.62 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  31.8 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  35.38 
 
 
268 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  35.34 
 
 
294 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  31.36 
 
 
285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  33.1 
 
 
286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  28.27 
 
 
284 aa  116  5e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  32.51 
 
 
292 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  32.39 
 
 
298 aa  115  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  32.6 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>