More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1878 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1878  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 279 aa  537  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.820651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  59.71 
 
 		 278 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3436  HpcH/HpaI aldolase  61.15 
 
 		 278 aa  288  6e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4374  HpcH/HpaI aldolase  60.07 
 
 		 278 aa  288  9e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  61.37 
 
 		 281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1535  Citryl-CoA lyase  59.15 
 
 		 283 aa  269  5e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  46.67 
 
 		 291 aa  218  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2705  citrate lyase  45.61 
 
 		 296 aa  212  7e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  47.52 
 
 		 283 aa  208  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  44.33 
 
 		 282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0092  HpcH/HpaI aldolase  44.56 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  42.91 
 
 		 282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  42.86 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0268  Citryl-CoA lyase  40.21 
 
 		 292 aa  191  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0293  HpcH/HpaI aldolase  51.23 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2314  citrate (pro-3S)-lyase  50.88 
 
 		 289 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1255  Citrate (pro-3S)-lyase  39.58 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327749  normal  0.0181011 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  34.59 
 
 		 282 aa  145  8.000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5821  HpcH/HpaI aldolase  35.74 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.577572  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  39.27 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  38.04 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  36.33 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  38.28 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.52 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  35.04 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.97 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1285  citryl-CoA lyase  36.43 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  34.01 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  36.62 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.62 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  34.97 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  34.01 
 
 		 292 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  35.94 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  37.82 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2758  putative citrate lyase beta chain (acyl lyase subunit)  38.95 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  32.98 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  37.04 
 
 		 271 aa  125  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  31.8 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1361  HpcH/HpaI aldolase  35.4 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  31.8 
 
 		 306 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  35.02 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2925  HpcH/HpaI aldolase  40.65 
 
 		 310 aa  122  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.253914  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  39.19 
 
 		 281 aa  123  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  36.56 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  37.28 
 
 		 291 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  34.89 
 
 		 270 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  35.56 
 
 		 292 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  34.66 
 
 		 275 aa  122  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  37.59 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  38.41 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  36.36 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  34.95 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  36.36 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  34.91 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3632  HpcH/HpaI aldolase  37.64 
 
 		 272 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3627  HpcH/HpaI aldolase  37.64 
 
 		 272 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3700  HpcH/HpaI aldolase  37.64 
 
 		 272 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  31.21 
 
 		 296 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2104  HpcH/HpaI aldolase  39.65 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.87307  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  36.7 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  31.01 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  35.11 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  35.11 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  35.11 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  35.11 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  37.5 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  34.04 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1313  putative citrate lyase beta subunit  39.93 
 
 		 275 aa  115  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  37.12 
 
 		 286 aa  115  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  35.23 
 
 		 274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  38.89 
 
 		 331 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  36.69 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  36.69 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  40.35 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  29.89 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  34.15 
 
 		 292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  36.01 
 
 		 310 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1391  HpcH/HpaI aldolase  37 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375922  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  32.07 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  34.04 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  34.66 
 
 		 313 aa  112  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  36.88 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  39.07 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1951  putative citrate lyase, beta subunit  38.7 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.778867  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12520  citrate lyase beta subunit citE  37.37 
 
 		 273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1273  citrate lyase beta subunit  38.7 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  38.63 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0968  putative citrate lyase, beta subunit  38.7 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2229  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  38.7 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2916  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  38.7 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  35.71 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2882  Citryl-CoA lyase  36.75 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  36.2 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1254  putative citrate lyase, beta subunit  38.7 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  38.63 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3026  citrate (pro-3S)-lyase  32.28 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  35.25 
 
 		 270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3040  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  38.7 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  29.43 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4394  Citryl-CoA lyase  33.33 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>