More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0580 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 
297 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  68.16 
 
 
295 aa  308  9e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  65.72 
 
 
290 aa  306  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  60.73 
 
 
289 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  58.82 
 
 
289 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  58.24 
 
 
289 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  58.15 
 
 
290 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  56.41 
 
 
283 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  46.82 
 
 
282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  48.16 
 
 
269 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  50.35 
 
 
275 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  48.13 
 
 
270 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  46.29 
 
 
291 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  48.13 
 
 
270 aa  215  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  46.86 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  47.39 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  51.69 
 
 
276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  49.43 
 
 
279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  50 
 
 
267 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  50 
 
 
267 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  49.26 
 
 
271 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  46.74 
 
 
278 aa  205  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  46.47 
 
 
274 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  45.56 
 
 
274 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  46.32 
 
 
270 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  47.83 
 
 
274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  47.83 
 
 
274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  53.14 
 
 
271 aa  192  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  51.11 
 
 
275 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  51.11 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  45.59 
 
 
274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  51.85 
 
 
275 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  46.72 
 
 
273 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  51.12 
 
 
266 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  43.45 
 
 
268 aa  178  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  48.72 
 
 
272 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  45.45 
 
 
279 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  45.42 
 
 
279 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  46.49 
 
 
274 aa  176  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  38.46 
 
 
294 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  38.83 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  48.01 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  37.05 
 
 
293 aa  169  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  37.94 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  34.02 
 
 
293 aa  157  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1107  HpcH/HpaI aldolase  48.73 
 
 
189 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3835  putative aldolase/citrate lyase  50.55 
 
 
276 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  40.83 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  36.97 
 
 
288 aa  149  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1689  HpcH/HpaI aldolase  50 
 
 
268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.69146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  40.65 
 
 
277 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  38.71 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  38.83 
 
 
280 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  38.83 
 
 
280 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  38.83 
 
 
280 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  38.46 
 
 
280 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4374  HpcH/HpaI aldolase  38.3 
 
 
278 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  37.5 
 
 
278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  40.73 
 
 
278 aa  136  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  30.85 
 
 
294 aa  136  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  36.88 
 
 
280 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.517185  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  36.4 
 
 
282 aa  135  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  38.41 
 
 
287 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  39.79 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  36.2 
 
 
292 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1313  putative citrate lyase beta subunit  39.42 
 
 
275 aa  132  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  35.87 
 
 
286 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  35.56 
 
 
275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  38.18 
 
 
282 aa  128  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  35.53 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  36.96 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  36.04 
 
 
406 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  30.6 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  36.56 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  33.83 
 
 
292 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  38.71 
 
 
281 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4079  HpcH/HpaI aldolase  39.51 
 
 
283 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  38.04 
 
 
271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  35.53 
 
 
285 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  32.88 
 
 
306 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  35.4 
 
 
284 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  31.27 
 
 
306 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  32.88 
 
 
306 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  38.22 
 
 
279 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  36.77 
 
 
293 aa  123  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  34.07 
 
 
285 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  30.63 
 
 
289 aa  123  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2742  HpcH/HpaI aldolase  33.7 
 
 
287 aa  122  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00490393 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3436  HpcH/HpaI aldolase  39.01 
 
 
278 aa  122  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3048  Citryl-CoA lyase  39.93 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1653  putative citrate lyase, beta subunit  40.58 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0608  putative citrate lyase, beta subunit  40.58 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.46771  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1932  putative citrate lyase, beta subunit  40.58 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  36.15 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1725  putative citrate lyase, beta subunit  40.58 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00470  citrate lyase beta subunit  37.97 
 
 
296 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1255  Citrate (pro-3S)-lyase  34.39 
 
 
289 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327749  normal  0.0181011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  38.18 
 
 
285 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0204  HpcH/HpaI aldolase  34.81 
 
 
311 aa  120  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.446132  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3032  HpcH/HpaI aldolase  32.97 
 
 
289 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>