More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6652 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 275 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  96.6 
 
 		 267 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  96.6 
 
 		 267 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  70.15 
 
 		 270 aa  358  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  66.67 
 
 		 278 aa  349  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  52.69 
 
 		 269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  47.39 
 
 		 277 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  50.76 
 
 		 291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  50 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  50.58 
 
 		 274 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  46.95 
 
 		 270 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  48.28 
 
 		 270 aa  216  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  51.25 
 
 		 290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  50.35 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  50 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  49.22 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  48.67 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  48.67 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  48.28 
 
 		 274 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  42.65 
 
 		 282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  51.71 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  47.78 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  48.48 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  50.53 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  48.03 
 
 		 283 aa  195  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  44.96 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  45.35 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  45.96 
 
 		 289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  44.84 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  48.12 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  46.1 
 
 		 290 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  41.7 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  38.19 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  47.19 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  49.43 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  43.02 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  45.49 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  45.32 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  45.35 
 
 		 289 aa  158  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  34.72 
 
 		 276 aa  156  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  34.56 
 
 		 293 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  43.02 
 
 		 275 aa  155  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  40.52 
 
 		 286 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  36.5 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  38.49 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  37.82 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3835  putative aldolase/citrate lyase  45.05 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  37.69 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  43.24 
 
 		 278 aa  148  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  42.11 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  42.29 
 
 		 287 aa  146  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1039  HpcH/HpaI aldolase  43.77 
 
 		 271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  36.17 
 
 		 293 aa  145  5e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1689  HpcH/HpaI aldolase  47.47 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.69146  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  32.86 
 
 		 306 aa  142  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1107  HpcH/HpaI aldolase  50.32 
 
 		 189 aa  142  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  38.04 
 
 		 277 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  35.77 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0204  HpcH/HpaI aldolase  36.13 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.446132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3032  HpcH/HpaI aldolase  34.35 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  38.17 
 
 		 277 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2742  HpcH/HpaI aldolase  34.07 
 
 		 287 aa  139  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00490393 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  37.23 
 
 		 292 aa  139  6e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  37.23 
 
 		 292 aa  139  6e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0400  citrate lyase  33.69 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.726359  normal  0.0212977 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19950  citrate lyase beta subunit  36.54 
 
 		 281 aa  135  5e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.251575  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  39.01 
 
 		 282 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  36.23 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.14 
 
 		 294 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  35.54 
 
 		 295 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  35.93 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  36.16 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  39.01 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  31.09 
 
 		 269 aa  130  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  32.74 
 
 		 296 aa  129  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  37.96 
 
 		 285 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  32.14 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  31.79 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  31.79 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5204  HpcH/HpaI aldolase  35.74 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5584  HpcH/HpaI aldolase  35.74 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.331432  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5292  HpcH/HpaI aldolase  35.74 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  32.27 
 
 		 290 aa  125  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  38.11 
 
 		 281 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4009  HpcH/HpaI aldolase  34.98 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  decreased coverage  0.00557053 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  36.03 
 
 		 278 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  38.35 
 
 		 267 aa  122  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  34.69 
 
 		 287 aa  122  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  34.64 
 
 		 310 aa  122  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  37.59 
 
 		 281 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  35.45 
 
 		 284 aa  122  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  29.39 
 
 		 284 aa  122  7e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12520  citrate lyase beta subunit citE  41.76 
 
 		 273 aa  122  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2235  citrate lyase, beta subunit  34.77 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  37.01 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  36.36 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3048  Citryl-CoA lyase  40.14 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7288  citrate lyase  31.56 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.380781 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2641  Citryl-CoA lyase  31.36 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  35.69 
 
 		 274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>