More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0618 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  100 
 
 
270 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  86.25 
 
 
270 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  47.55 
 
 
269 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  48.28 
 
 
275 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  46.39 
 
 
291 aa  228  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  46.04 
 
 
291 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  46.3 
 
 
279 aa  225  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  47.88 
 
 
274 aa  225  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  46.01 
 
 
274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  47.69 
 
 
270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  46.33 
 
 
277 aa  218  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  47.13 
 
 
267 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  47.13 
 
 
267 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  46.27 
 
 
295 aa  208  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  44.98 
 
 
278 aa  208  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  49.44 
 
 
290 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  48.88 
 
 
283 aa  205  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  42.75 
 
 
282 aa  205  8e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  48.13 
 
 
297 aa  204  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  46.04 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  46.64 
 
 
289 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  45.59 
 
 
274 aa  199  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  45.59 
 
 
274 aa  199  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  43.98 
 
 
274 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  43.45 
 
 
268 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  45.7 
 
 
276 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  43.82 
 
 
279 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  43.4 
 
 
294 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  45.42 
 
 
273 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  49.04 
 
 
266 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  42.26 
 
 
294 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  44.03 
 
 
290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  46.99 
 
 
271 aa  182  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  41.29 
 
 
271 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  43.4 
 
 
289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  43.28 
 
 
289 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4467  HpcH/HpaI aldolase  41.29 
 
 
307 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.99201  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  41 
 
 
283 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  41.2 
 
 
307 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1689  HpcH/HpaI aldolase  46.61 
 
 
268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.69146  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5584  HpcH/HpaI aldolase  40.15 
 
 
310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.331432  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5204  HpcH/HpaI aldolase  40.15 
 
 
310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5292  HpcH/HpaI aldolase  40.15 
 
 
310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4009  HpcH/HpaI aldolase  40.07 
 
 
306 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  decreased coverage  0.00557053 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  36.36 
 
 
293 aa  161  9e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  41.35 
 
 
275 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  41.42 
 
 
275 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  40.75 
 
 
274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2378  HpcH/HpaI aldolase  38.64 
 
 
306 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.0302108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  41.98 
 
 
289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3835  putative aldolase/citrate lyase  46.79 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  40.23 
 
 
286 aa  152  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1313  putative citrate lyase beta subunit  40.38 
 
 
275 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  40.86 
 
 
288 aa  148  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  38.55 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0181  HpcH/HpaI aldolase  39.53 
 
 
281 aa  147  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  37.27 
 
 
276 aa  146  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  38.43 
 
 
271 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00870  citrate lyase beta subunit  37.32 
 
 
321 aa  144  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0531316  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  38.64 
 
 
275 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.49 
 
 
294 aa  143  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  31.2 
 
 
276 aa  143  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  40.38 
 
 
272 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  38.18 
 
 
287 aa  142  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  33.21 
 
 
293 aa  139  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  35.53 
 
 
278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  36.6 
 
 
267 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0204  HpcH/HpaI aldolase  35.79 
 
 
311 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.446132  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  38.22 
 
 
281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  36.3 
 
 
292 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  34.7 
 
 
280 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.7 
 
 
280 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3032  HpcH/HpaI aldolase  32.46 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.7 
 
 
280 aa  133  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  36.24 
 
 
293 aa  133  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  37.18 
 
 
281 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  36.9 
 
 
286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19950  citrate lyase beta subunit  34.85 
 
 
281 aa  132  9e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.251575  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  32.28 
 
 
330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1039  HpcH/HpaI aldolase  39.63 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.08 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  35.36 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.08 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12520  citrate lyase beta subunit citE  38.7 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.08 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.08 
 
 
280 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  33.33 
 
 
292 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  37.79 
 
 
278 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  33.93 
 
 
290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  35.38 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  34.83 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06890  citrate lyase beta subunit  37.59 
 
 
292 aa  127  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  37.5 
 
 
285 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  32.06 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  37.01 
 
 
282 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  34.62 
 
 
292 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2654  HpcH/HpaI aldolase  39.51 
 
 
267 aa  125  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  35.79 
 
 
280 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.517185  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2320  citrate lyase, beta subunit  30.94 
 
 
301 aa  125  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  32.37 
 
 
291 aa  125  9e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.488048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>