More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4467 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4467  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 
307 aa  622  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.99201  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5204  HpcH/HpaI aldolase  81.47 
 
 
310 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5584  HpcH/HpaI aldolase  81.47 
 
 
310 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.331432  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5292  HpcH/HpaI aldolase  81.47 
 
 
310 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  81.76 
 
 
307 aa  500  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2378  HpcH/HpaI aldolase  81.88 
 
 
306 aa  500  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.0302108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4009  HpcH/HpaI aldolase  80.26 
 
 
306 aa  489  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  decreased coverage  0.00557053 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0181  HpcH/HpaI aldolase  78.8 
 
 
281 aa  427  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00870  citrate lyase beta subunit  63.81 
 
 
321 aa  395  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0531316  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  52.03 
 
 
283 aa  267  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2742  HpcH/HpaI aldolase  50.19 
 
 
287 aa  259  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00490393 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3032  HpcH/HpaI aldolase  49.44 
 
 
289 aa  256  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  51.29 
 
 
277 aa  252  7e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4282  HpcH/HpaI aldolase  49.82 
 
 
280 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.174407 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0204  HpcH/HpaI aldolase  48.34 
 
 
311 aa  235  7e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.446132  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19950  citrate lyase beta subunit  46.84 
 
 
281 aa  214  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.251575  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2654  HpcH/HpaI aldolase  45.32 
 
 
267 aa  188  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  40.07 
 
 
270 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  41.29 
 
 
270 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  35.34 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  32.45 
 
 
269 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  35.34 
 
 
294 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  38.14 
 
 
274 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  38.14 
 
 
274 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  32.23 
 
 
291 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  33.7 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  34.85 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  35.94 
 
 
276 aa  125  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  32.01 
 
 
279 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  32.33 
 
 
291 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  33.58 
 
 
277 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  33.08 
 
 
270 aa  122  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  37.75 
 
 
290 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  29.12 
 
 
293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  33.96 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  34.03 
 
 
274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  31.4 
 
 
282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  37.25 
 
 
281 aa  115  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  33.21 
 
 
268 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  36 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  34.45 
 
 
286 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  32.2 
 
 
274 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  37.69 
 
 
266 aa  112  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  28.03 
 
 
276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  35.37 
 
 
283 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  34.7 
 
 
267 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  34.7 
 
 
267 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  31.3 
 
 
292 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  34.04 
 
 
271 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  35.14 
 
 
273 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  32.94 
 
 
274 aa  107  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  33.58 
 
 
271 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  31.11 
 
 
278 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  34.45 
 
 
289 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  30.97 
 
 
279 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  33.88 
 
 
292 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  34.42 
 
 
297 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1719  HpcH/HpaI aldolase  35.34 
 
 
281 aa  99.8  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.422564 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  29.44 
 
 
292 aa  99  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  33.6 
 
 
277 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  29.96 
 
 
292 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  32.7 
 
 
289 aa  96.7  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1689  HpcH/HpaI aldolase  35.12 
 
 
268 aa  95.9  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.69146  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2921  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 
280 aa  95.5  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  29.32 
 
 
280 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  29.32 
 
 
280 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  29.32 
 
 
280 aa  94  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  28.21 
 
 
293 aa  92.4  9e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  31.02 
 
 
379 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  31.88 
 
 
310 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  31.14 
 
 
341 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  33.7 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  35.17 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  31.67 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  32.92 
 
 
278 aa  90.1  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  31.11 
 
 
272 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  30.41 
 
 
318 aa  89  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  30.41 
 
 
318 aa  89  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  31.23 
 
 
290 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  31.38 
 
 
285 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  32.13 
 
 
292 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1725  putative citrate lyase, beta subunit  30.89 
 
 
293 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1653  putative citrate lyase, beta subunit  30.89 
 
 
293 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  30.26 
 
 
267 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  31.38 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1932  putative citrate lyase, beta subunit  30.89 
 
 
293 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0608  putative citrate lyase, beta subunit  30.89 
 
 
293 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.46771  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4079  HpcH/HpaI aldolase  32.56 
 
 
283 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  32.6 
 
 
275 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  28.35 
 
 
295 aa  87.4  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  30.86 
 
 
285 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  28.97 
 
 
289 aa  86.3  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  31.09 
 
 
313 aa  86.3  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  30.71 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  32.31 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  30.26 
 
 
275 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1974  Citryl-CoA lyase  32.78 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.74 
 
 
280 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  30.28 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.74 
 
 
280 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.820787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>