More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5292 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5584  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 310 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.331432  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5204  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 310 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5292  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 310 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  83.87 
 
 		 307 aa  521  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4467  HpcH/HpaI aldolase  81.47 
 
 		 307 aa  509  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.99201  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4009  HpcH/HpaI aldolase  81.41 
 
 		 306 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  decreased coverage  0.00557053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2378  HpcH/HpaI aldolase  84.41 
 
 		 306 aa  503  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.0302108 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0181  HpcH/HpaI aldolase  75.97 
 
 		 281 aa  415  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00870  citrate lyase beta subunit  65.23 
 
 		 321 aa  399  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0531316  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3032  HpcH/HpaI aldolase  50.76 
 
 		 289 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2742  HpcH/HpaI aldolase  51.14 
 
 		 287 aa  269  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00490393 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  51.3 
 
 		 283 aa  268  7e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  53.33 
 
 		 277 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4282  HpcH/HpaI aldolase  50.37 
 
 		 280 aa  248  9e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.174407 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0204  HpcH/HpaI aldolase  46.04 
 
 		 311 aa  229  5e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.446132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19950  citrate lyase beta subunit  48.69 
 
 		 281 aa  225  7e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.251575  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2654  HpcH/HpaI aldolase  45.28 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  40.07 
 
 		 270 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  40.15 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  34.6 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  35.06 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  38.82 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  35.23 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  40.6 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  40.6 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  35.27 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  34.72 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  33.58 
 
 		 274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  33.96 
 
 		 294 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  34.33 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  35.74 
 
 		 275 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  34.98 
 
 		 270 aa  125  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  35.74 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  34.03 
 
 		 274 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  32.61 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  32.85 
 
 		 279 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  29.93 
 
 		 293 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  36.55 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  33.84 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  35.38 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  35.38 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  37.98 
 
 		 266 aa  113  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  33.33 
 
 		 278 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  36.13 
 
 		 289 aa  112  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  29.92 
 
 		 276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  36.55 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  34.87 
 
 		 286 aa  109  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  35.58 
 
 		 273 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  35.08 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  31.99 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  34.87 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  33.73 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  35.51 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  31.44 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  31.84 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  35.16 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  31.03 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  30.92 
 
 		 275 aa  99.8  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  33.61 
 
 		 292 aa  99.4  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  27.24 
 
 		 293 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  32.68 
 
 		 289 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1689  HpcH/HpaI aldolase  36.36 
 
 		 268 aa  97.4  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.69146  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  31.35 
 
 		 292 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  32.59 
 
 		 272 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  31.65 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  31.38 
 
 		 285 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  30 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  29.27 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30 
 
 		 280 aa  92.8  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  32.02 
 
 		 277 aa  92.4  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  33.6 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1653  putative citrate lyase, beta subunit  31.54 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0608  putative citrate lyase, beta subunit  31.54 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.46771  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1932  putative citrate lyase, beta subunit  31.54 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1725  putative citrate lyase, beta subunit  31.54 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  31.97 
 
 		 290 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  32.01 
 
 		 289 aa  90.5  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1361  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 		 295 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1719  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.422564 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  31.14 
 
 		 289 aa  87.4  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  29.06 
 
 		 267 aa  87  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2222  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  31.54 
 
 		 293 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0703  citrate lyase, beta subunit, putative  31.54 
 
 		 293 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3835  putative aldolase/citrate lyase  34.91 
 
 		 276 aa  86.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2921  HpcH/HpaI aldolase  32.13 
 
 		 280 aa  85.9  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  32.47 
 
 		 280 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  29.2 
 
 		 341 aa  85.9  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00470  citrate lyase beta subunit  34.84 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  32.47 
 
 		 280 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  32.47 
 
 		 280 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  32.47 
 
 		 280 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  30.86 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  31.5 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2226  citrate lyase beta subunit  32.91 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.709952  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  34.07 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  32.74 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  30.71 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  30.88 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  33.94 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>