More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4631 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  100 
 
 
275 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  94.91 
 
 
275 aa  471  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  66.79 
 
 
271 aa  364  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  64.6 
 
 
275 aa  309  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  63.94 
 
 
272 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  50.37 
 
 
274 aa  233  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  41.29 
 
 
276 aa  203  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  48.5 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  41.16 
 
 
293 aa  193  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  45.72 
 
 
269 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  50.74 
 
 
297 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  46.62 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  42.91 
 
 
270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  43.68 
 
 
274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  44.44 
 
 
274 aa  183  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  44.44 
 
 
274 aa  183  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  46.07 
 
 
275 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  44.89 
 
 
274 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  43.77 
 
 
277 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  48.9 
 
 
271 aa  179  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  43.23 
 
 
291 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  43.01 
 
 
291 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  41.64 
 
 
279 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  47.6 
 
 
289 aa  175  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  49.27 
 
 
290 aa  174  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  43.12 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  40.96 
 
 
270 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  47.39 
 
 
273 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  47.6 
 
 
289 aa  168  8e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  45.22 
 
 
267 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  45.22 
 
 
267 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  41.79 
 
 
270 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  42.81 
 
 
278 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  46.72 
 
 
295 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  47.23 
 
 
289 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  42.12 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  44.62 
 
 
289 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  45.49 
 
 
283 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  45.96 
 
 
290 aa  155  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  40.98 
 
 
268 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  34.72 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  37.45 
 
 
294 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1689  HpcH/HpaI aldolase  46.83 
 
 
268 aa  149  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.69146  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  41.67 
 
 
279 aa  149  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3835  putative aldolase/citrate lyase  45.26 
 
 
276 aa  149  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  36.33 
 
 
294 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  45.42 
 
 
266 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  38.27 
 
 
276 aa  143  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  37.68 
 
 
288 aa  142  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  38.49 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  38.52 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2742  HpcH/HpaI aldolase  36.4 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00490393 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  36.96 
 
 
274 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  37.69 
 
 
278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  35.58 
 
 
282 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  40.79 
 
 
281 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3032  HpcH/HpaI aldolase  36.53 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  33.45 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  37.05 
 
 
280 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  38.99 
 
 
286 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  36.3 
 
 
275 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  36.49 
 
 
293 aa  126  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  37.05 
 
 
280 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  37.05 
 
 
280 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  37.05 
 
 
280 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12520  citrate lyase beta subunit citE  41.04 
 
 
273 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3511  citrate (pro-3S)-lyase  36.88 
 
 
292 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  39.19 
 
 
271 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  35.89 
 
 
290 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4374  HpcH/HpaI aldolase  37.32 
 
 
278 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  35.14 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  35.14 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  35.14 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  36.62 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.18 
 
 
294 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  35.21 
 
 
280 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.517185  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  29.67 
 
 
269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  34.85 
 
 
277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  36.5 
 
 
302 aa  119  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0204  HpcH/HpaI aldolase  34.3 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.446132  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  36.5 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  34.66 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  34.31 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  37.23 
 
 
277 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  36.6 
 
 
267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1708  citrate lyase beta chain  30.91 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  32.65 
 
 
289 aa  114  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  38.55 
 
 
277 aa  112  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  36.36 
 
 
285 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  35.04 
 
 
285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  31.27 
 
 
296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2324  Citrate (pro-3S)-lyase  36.65 
 
 
347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4282  HpcH/HpaI aldolase  34.81 
 
 
280 aa  109  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.174407 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  35.32 
 
 
307 aa  109  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  33.8 
 
 
291 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1107  HpcH/HpaI aldolase  40.88 
 
 
189 aa  108  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  36.59 
 
 
285 aa  109  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  39.47 
 
 
281 aa  108  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  32.01 
 
 
271 aa  108  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3632  HpcH/HpaI aldolase  36.86 
 
 
272 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>