More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0181 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0181  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 
281 aa  571  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4467  HpcH/HpaI aldolase  78.8 
 
 
307 aa  427  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.99201  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4009  HpcH/HpaI aldolase  77.46 
 
 
306 aa  424  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  decreased coverage  0.00557053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2378  HpcH/HpaI aldolase  76.41 
 
 
306 aa  421  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.0302108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5584  HpcH/HpaI aldolase  75.97 
 
 
310 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.331432  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5204  HpcH/HpaI aldolase  75.97 
 
 
310 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5292  HpcH/HpaI aldolase  75.97 
 
 
310 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  76.33 
 
 
307 aa  414  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00870  citrate lyase beta subunit  63.48 
 
 
321 aa  354  6.999999999999999e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0531316  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3032  HpcH/HpaI aldolase  48.29 
 
 
289 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2742  HpcH/HpaI aldolase  48.67 
 
 
287 aa  254  9e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00490393 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  48.85 
 
 
283 aa  244  8e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  49.43 
 
 
277 aa  243  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4282  HpcH/HpaI aldolase  46.95 
 
 
280 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.174407 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0204  HpcH/HpaI aldolase  45.69 
 
 
311 aa  216  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.446132  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19950  citrate lyase beta subunit  44.87 
 
 
281 aa  204  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.251575  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2654  HpcH/HpaI aldolase  43.7 
 
 
267 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  39.3 
 
 
270 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  34.11 
 
 
269 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  39.53 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  34.09 
 
 
279 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  37.78 
 
 
274 aa  122  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  37.78 
 
 
274 aa  122  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  33.59 
 
 
294 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  33.98 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  33.62 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  35.66 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  32.09 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  32.74 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  35.27 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  32.16 
 
 
270 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  32.83 
 
 
277 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  29.35 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  31.76 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  31.76 
 
 
274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  31.3 
 
 
291 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  32.7 
 
 
268 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  30.47 
 
 
274 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  33.92 
 
 
271 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  28.85 
 
 
276 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 
295 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  32.55 
 
 
267 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  32.55 
 
 
267 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  29.92 
 
 
278 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  30.62 
 
 
274 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  36.52 
 
 
266 aa  99.8  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  34.82 
 
 
281 aa  99.8  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  33.19 
 
 
283 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  33.97 
 
 
297 aa  95.9  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  28.2 
 
 
293 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  32.06 
 
 
273 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  31.92 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  33.47 
 
 
289 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  32.76 
 
 
286 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  30.36 
 
 
274 aa  94.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  29.46 
 
 
292 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  31.32 
 
 
275 aa  92  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  29.5 
 
 
279 aa  91.3  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  29.96 
 
 
280 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  29.96 
 
 
280 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  30.87 
 
 
289 aa  89.7  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  29.96 
 
 
280 aa  89.4  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.83 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1653  putative citrate lyase, beta subunit  30.34 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.83 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1932  putative citrate lyase, beta subunit  30.34 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  30.86 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1725  putative citrate lyase, beta subunit  30.34 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0608  putative citrate lyase, beta subunit  30.34 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.46771  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.83 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.83 
 
 
280 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  31.82 
 
 
289 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1719  HpcH/HpaI aldolase  34.6 
 
 
281 aa  84  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.422564 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0703  citrate lyase, beta subunit, putative  30.34 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  31.44 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2222  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.34 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  28.63 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  31.23 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  34.17 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  28.74 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  29.87 
 
 
292 aa  82  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1689  HpcH/HpaI aldolase  35.29 
 
 
268 aa  81.6  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.69146  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  33.07 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  28.95 
 
 
272 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  31.09 
 
 
275 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  29.54 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  31.72 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  31.72 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  33.33 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  31.46 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  29.1 
 
 
277 aa  79  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  32.16 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  30.48 
 
 
267 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2921  HpcH/HpaI aldolase  32.49 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  30.15 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  29.37 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  33.88 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  27.35 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  34.71 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2305  hypothetical protein  29.49 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.500849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>