More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3200 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 274 aa  538  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  53.16 
 
 		 275 aa  251  9.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  47.96 
 
 		 271 aa  244  8e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  50 
 
 		 275 aa  221  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  50 
 
 		 272 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  50.37 
 
 		 275 aa  214  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  38.87 
 
 		 276 aa  188  8e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  41.67 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  39.85 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  46.77 
 
 		 279 aa  175  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  43.23 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  43.23 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  39.77 
 
 		 291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  47.99 
 
 		 297 aa  169  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  39.56 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  39.77 
 
 		 291 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  40.52 
 
 		 274 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  40.75 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  38.35 
 
 		 277 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  45.22 
 
 		 273 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  39.26 
 
 		 269 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  42.75 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  42.26 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  41.26 
 
 		 270 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  40.6 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  46.55 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  43.61 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  40.07 
 
 		 278 aa  148  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  45.42 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  41.18 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  41.18 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  41.79 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  42.28 
 
 		 289 aa  142  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  41.91 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  39.86 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  37.78 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  41.6 
 
 		 289 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  36.33 
 
 		 276 aa  138  8.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  41.24 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  37.64 
 
 		 274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  34.93 
 
 		 294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  39.85 
 
 		 278 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  34.19 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  37.59 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1689  HpcH/HpaI aldolase  45.31 
 
 		 268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.69146  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  40.36 
 
 		 290 aa  132  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  41.7 
 
 		 295 aa  128  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  39.07 
 
 		 282 aa  128  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  36.79 
 
 		 290 aa  128  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  39.47 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  39.78 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  36.14 
 
 		 288 aa  126  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  37.74 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  31.94 
 
 		 293 aa  123  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.43 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  33.33 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3436  HpcH/HpaI aldolase  40.58 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.43 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.43 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.43 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  37.14 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3048  Citryl-CoA lyase  36.4 
 
 		 288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  35.15 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1313  putative citrate lyase beta subunit  39.85 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4374  HpcH/HpaI aldolase  34.19 
 
 		 278 aa  118  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3511  citrate (pro-3S)-lyase  35.59 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  33.69 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3835  putative aldolase/citrate lyase  40.74 
 
 		 276 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  34.63 
 
 		 280 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.517185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0204  HpcH/HpaI aldolase  37.87 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.446132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1039  HpcH/HpaI aldolase  38.75 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  29.97 
 
 		 330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2925  HpcH/HpaI aldolase  39.56 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.253914  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12520  citrate lyase beta subunit citE  37.31 
 
 		 273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1361  HpcH/HpaI aldolase  34.07 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  32.53 
 
 		 293 aa  112  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  29.25 
 
 		 294 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1535  Citryl-CoA lyase  35.89 
 
 		 283 aa  112  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  36.82 
 
 		 281 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  33.46 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3627  HpcH/HpaI aldolase  37.27 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858993  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00470  citrate lyase beta subunit  40.54 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3700  HpcH/HpaI aldolase  37.27 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3632  HpcH/HpaI aldolase  37.27 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  31.54 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  31.54 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4356  citrate lyase beta subunit  35.27 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  32.74 
 
 		 283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  34.19 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  31.54 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  35.76 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  28.01 
 
 		 284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  33.56 
 
 		 293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1878  HpcH/HpaI aldolase  35.62 
 
 		 279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.820651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1107  HpcH/HpaI aldolase  40.13 
 
 		 189 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  32.98 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  29.93 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  29.9 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  35.91 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  35.89 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>