More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_19950 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_19950  citrate lyase beta subunit  100 
 
 
281 aa  559  1e-158  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.251575  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0204  HpcH/HpaI aldolase  68.2 
 
 
311 aa  396  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.446132  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3032  HpcH/HpaI aldolase  48.39 
 
 
289 aa  248  5e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2742  HpcH/HpaI aldolase  48.03 
 
 
287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00490393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  51.5 
 
 
277 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4282  HpcH/HpaI aldolase  47.1 
 
 
280 aa  230  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.174407 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  49.06 
 
 
307 aa  226  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00870  citrate lyase beta subunit  46.55 
 
 
321 aa  226  4e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0531316  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5584  HpcH/HpaI aldolase  48.69 
 
 
310 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.331432  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5204  HpcH/HpaI aldolase  48.69 
 
 
310 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5292  HpcH/HpaI aldolase  48.69 
 
 
310 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4009  HpcH/HpaI aldolase  48.31 
 
 
306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  decreased coverage  0.00557053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2378  HpcH/HpaI aldolase  47.19 
 
 
306 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.0302108 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  44.74 
 
 
283 aa  215  7e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4467  HpcH/HpaI aldolase  46.84 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.99201  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0181  HpcH/HpaI aldolase  44.87 
 
 
281 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2654  HpcH/HpaI aldolase  42.32 
 
 
267 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  37.26 
 
 
291 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  37.17 
 
 
291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  36.36 
 
 
278 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  36.54 
 
 
275 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  37.55 
 
 
274 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  34.22 
 
 
269 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  35.74 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  34.96 
 
 
270 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  34.56 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  36.99 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  37.55 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  38.49 
 
 
274 aa  125  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  38.49 
 
 
274 aa  125  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  34.85 
 
 
270 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  36.29 
 
 
267 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  36.29 
 
 
267 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  36.61 
 
 
276 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  38.81 
 
 
273 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  28.23 
 
 
293 aa  116  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  36.33 
 
 
279 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  31.56 
 
 
294 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  35.66 
 
 
283 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  30.14 
 
 
289 aa  108  8.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  39.69 
 
 
266 aa  108  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  30.42 
 
 
294 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  37.65 
 
 
289 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  32.03 
 
 
282 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  28.37 
 
 
294 aa  106  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  33.07 
 
 
308 aa  106  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  34.75 
 
 
279 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  30.3 
 
 
274 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3835  putative aldolase/citrate lyase  33.33 
 
 
276 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  26.1 
 
 
269 aa  101  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  35.74 
 
 
295 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  28.63 
 
 
276 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  34.85 
 
 
271 aa  99.8  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  36.55 
 
 
277 aa  98.6  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  35.17 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  28.08 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  32.5 
 
 
285 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  28.57 
 
 
291 aa  95.9  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  31.03 
 
 
324 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  31.3 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.488048 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  30.31 
 
 
324 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  30.31 
 
 
324 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  30.74 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2320  citrate lyase, beta subunit  28.03 
 
 
301 aa  94.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  30.74 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  34.1 
 
 
289 aa  94  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2305  hypothetical protein  34.9 
 
 
293 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.500849  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  34.66 
 
 
291 aa  93.2  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  31.58 
 
 
295 aa  93.2  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  33.7 
 
 
304 aa  93.6  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  33.96 
 
 
297 aa  93.2  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  29.45 
 
 
310 aa  92.4  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  34.51 
 
 
289 aa  92.4  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  32.69 
 
 
274 aa  92.4  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2226  citrate lyase beta subunit  33.76 
 
 
290 aa  92.4  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.709952  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  30.47 
 
 
275 aa  92  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  28.9 
 
 
306 aa  91.3  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  30.58 
 
 
323 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  26.05 
 
 
284 aa  91.3  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  30.24 
 
 
324 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  33.74 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  30.11 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1039  HpcH/HpaI aldolase  32.96 
 
 
271 aa  90.5  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  32.22 
 
 
276 aa  90.1  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  34.78 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  31.62 
 
 
325 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  30.5 
 
 
292 aa  90.1  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  30.69 
 
 
325 aa  90.1  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  34.96 
 
 
275 aa  89.7  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  32.97 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  30.34 
 
 
323 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  27.31 
 
 
293 aa  90.1  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  30.77 
 
 
292 aa  89.7  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  29.43 
 
 
304 aa  89.4  6e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1689  HpcH/HpaI aldolase  36.73 
 
 
268 aa  89  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.69146  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  30.48 
 
 
290 aa  89  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1725  putative citrate lyase, beta subunit  33.73 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0608  putative citrate lyase, beta subunit  33.73 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.46771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>