More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0204 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0204  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 311 aa  635    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.446132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19950  citrate lyase beta subunit  68.2 
 
 		 281 aa  396  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.251575  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3032  HpcH/HpaI aldolase  50.89 
 
 		 289 aa  265  5e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2742  HpcH/HpaI aldolase  50.18 
 
 		 287 aa  256  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00490393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  48.92 
 
 		 277 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4467  HpcH/HpaI aldolase  48.34 
 
 		 307 aa  235  7e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.99201  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  46.01 
 
 		 283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4282  HpcH/HpaI aldolase  47.39 
 
 		 280 aa  233  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.174407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2378  HpcH/HpaI aldolase  46.04 
 
 		 306 aa  232  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.0302108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4009  HpcH/HpaI aldolase  45.52 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  decreased coverage  0.00557053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5584  HpcH/HpaI aldolase  46.04 
 
 		 310 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.331432  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5204  HpcH/HpaI aldolase  46.04 
 
 		 310 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5292  HpcH/HpaI aldolase  46.04 
 
 		 310 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00870  citrate lyase beta subunit  45.26 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0531316  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  46.47 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0181  HpcH/HpaI aldolase  45.69 
 
 		 281 aa  216  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2654  HpcH/HpaI aldolase  42.65 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  38.1 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  36.13 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  33.94 
 
 		 278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  33.58 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  33.21 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  35.45 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  35.79 
 
 		 270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  33.96 
 
 		 267 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  33.96 
 
 		 267 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  34.75 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  32.22 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  35.53 
 
 		 271 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  32.58 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  36.74 
 
 		 276 aa  125  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  37.76 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  31.95 
 
 		 268 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  36.48 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  37.5 
 
 		 274 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  37.5 
 
 		 274 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  34.08 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  36.88 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  29.66 
 
 		 293 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  31.97 
 
 		 294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  31.6 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  38.43 
 
 		 266 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  32.79 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  35.9 
 
 		 273 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  35.59 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  37.5 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  34.88 
 
 		 279 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  34.81 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  37.87 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  34.3 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  29.66 
 
 		 296 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  33.21 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  30.5 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  35.96 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  34.2 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  36.96 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  29.12 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  37.1 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  33.94 
 
 		 275 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  37.41 
 
 		 289 aa  103  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  30.9 
 
 		 289 aa  102  7e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  34.8 
 
 		 275 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  30.04 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  34.55 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  32.31 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  34.87 
 
 		 272 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  30.53 
 
 		 274 aa  98.6  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  31.66 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  32.37 
 
 		 279 aa  97.1  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  31.66 
 
 		 285 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  29.85 
 
 		 274 aa  96.3  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  32.78 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2305  hypothetical protein  34.5 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.500849  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  29.9 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  32.43 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  31.62 
 
 		 274 aa  93.6  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3835  putative aldolase/citrate lyase  33.09 
 
 		 276 aa  92.8  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  31.85 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  31.16 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  28.23 
 
 		 269 aa  92  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  29.11 
 
 		 324 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.86 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  29.11 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  29.11 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  30.86 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  31.4 
 
 		 406 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  29.93 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.86 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  30.47 
 
 		 287 aa  90.5  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1653  putative citrate lyase, beta subunit  33.46 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1932  putative citrate lyase, beta subunit  33.46 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  33.6 
 
 		 281 aa  90.1  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0608  putative citrate lyase, beta subunit  33.46 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.46771  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1725  putative citrate lyase, beta subunit  33.46 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  30.45 
 
 		 310 aa  90.1  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  27.11 
 
 		 284 aa  89.4  8e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  28.23 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  28.57 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1689  HpcH/HpaI aldolase  36.8 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.69146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>