262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2654 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2654  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 
267 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  46.69 
 
 
283 aa  209  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2378  HpcH/HpaI aldolase  45.83 
 
 
306 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.0302108 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3032  HpcH/HpaI aldolase  43.98 
 
 
289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4009  HpcH/HpaI aldolase  45.08 
 
 
306 aa  193  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  decreased coverage  0.00557053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  46.99 
 
 
277 aa  192  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2742  HpcH/HpaI aldolase  42.42 
 
 
287 aa  191  8e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00490393 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  45.08 
 
 
307 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5584  HpcH/HpaI aldolase  45.28 
 
 
310 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.331432  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5204  HpcH/HpaI aldolase  45.28 
 
 
310 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5292  HpcH/HpaI aldolase  45.28 
 
 
310 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4467  HpcH/HpaI aldolase  45.32 
 
 
307 aa  188  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.99201  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19950  citrate lyase beta subunit  42.32 
 
 
281 aa  180  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.251575  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0204  HpcH/HpaI aldolase  42.65 
 
 
311 aa  179  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.446132  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00870  citrate lyase beta subunit  41.37 
 
 
321 aa  177  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0531316  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0181  HpcH/HpaI aldolase  43.7 
 
 
281 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4282  HpcH/HpaI aldolase  44.36 
 
 
280 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.174407 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  36.73 
 
 
269 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  39.18 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  39.51 
 
 
270 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  34.57 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  35.93 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  33.21 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  34.33 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  38.68 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  38.78 
 
 
276 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  34.36 
 
 
277 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  36.63 
 
 
275 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  38.59 
 
 
279 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  33.8 
 
 
274 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  40.16 
 
 
290 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  35.83 
 
 
278 aa  99  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  37.25 
 
 
281 aa  98.6  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  38.46 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  36.36 
 
 
270 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  37.3 
 
 
274 aa  92.4  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  37.3 
 
 
274 aa  92.4  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  34.8 
 
 
279 aa  92.4  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  36.1 
 
 
267 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  36.1 
 
 
267 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  37 
 
 
289 aa  91.3  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  36.76 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  32.87 
 
 
282 aa  90.1  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  36.56 
 
 
289 aa  89.7  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  32.16 
 
 
274 aa  90.1  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  33.73 
 
 
278 aa  89  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  37.55 
 
 
271 aa  89  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  27.91 
 
 
293 aa  89  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  28.15 
 
 
276 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  35.25 
 
 
289 aa  87  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  33.18 
 
 
275 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  32.73 
 
 
275 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  32.22 
 
 
268 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  37.72 
 
 
283 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  34 
 
 
277 aa  82  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  38.64 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  30.6 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  31.87 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  31.87 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  33.9 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  31.87 
 
 
280 aa  79  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  32.55 
 
 
274 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  35.63 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1653  putative citrate lyase, beta subunit  35.74 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  34.91 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0608  putative citrate lyase, beta subunit  35.74 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.46771  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1932  putative citrate lyase, beta subunit  35.74 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1725  putative citrate lyase, beta subunit  35.74 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  31.03 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  28.02 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.96 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.96 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.96 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  27.69 
 
 
284 aa  75.5  0.0000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2226  citrate lyase beta subunit  36.87 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.709952  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.54 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  30.71 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  29.39 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  34.09 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  33.64 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  27.73 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2305  hypothetical protein  33.88 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.500849  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  32.72 
 
 
271 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  28.8 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  29.58 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2222  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  33.33 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0703  citrate lyase, beta subunit, putative  33.33 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  29.82 
 
 
295 aa  68.9  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  29.06 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  29.44 
 
 
282 aa  68.6  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  29.87 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  31.47 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3029  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.82 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  28.57 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1261  putative citrate lyase  36.82 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1719  HpcH/HpaI aldolase  30.33 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.422564 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  29.04 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4079  HpcH/HpaI aldolase  32.14 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12520  citrate lyase beta subunit citE  35.92 
 
 
273 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  29.46 
 
 
325 aa  67  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>