More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_52850 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  100 
 
 
275 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  94.91 
 
 
275 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  67.16 
 
 
271 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  65.57 
 
 
275 aa  312  4.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  63.24 
 
 
272 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  50 
 
 
274 aa  232  6e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  42.8 
 
 
276 aa  207  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  47.74 
 
 
279 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  41.16 
 
 
293 aa  193  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  44.61 
 
 
269 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  46.38 
 
 
274 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  43.23 
 
 
270 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  51.11 
 
 
297 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  45.19 
 
 
274 aa  185  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  44.19 
 
 
291 aa  185  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  45.19 
 
 
274 aa  185  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  44.4 
 
 
274 aa  185  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  43.96 
 
 
291 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  46.24 
 
 
275 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  44.15 
 
 
277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  43.87 
 
 
282 aa  182  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  45.86 
 
 
276 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  48.51 
 
 
273 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  41.09 
 
 
270 aa  175  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  42.01 
 
 
279 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  47.81 
 
 
295 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  43.27 
 
 
274 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  46.86 
 
 
289 aa  172  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  45.59 
 
 
267 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  45.59 
 
 
267 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  41.73 
 
 
270 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  47.62 
 
 
290 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  42.45 
 
 
278 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  46.72 
 
 
271 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  47.23 
 
 
289 aa  166  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  44.23 
 
 
289 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  46.86 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  46.24 
 
 
283 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  42.11 
 
 
268 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  38.58 
 
 
294 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  46.32 
 
 
290 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  35.76 
 
 
293 aa  155  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  37.45 
 
 
294 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3835  putative aldolase/citrate lyase  45.26 
 
 
276 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  43.53 
 
 
279 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1689  HpcH/HpaI aldolase  48.82 
 
 
268 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.69146  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  45.56 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  37.24 
 
 
288 aa  143  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  39.21 
 
 
276 aa  142  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  38.49 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  38.79 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  36.33 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3511  citrate (pro-3S)-lyase  37.59 
 
 
292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  39.43 
 
 
286 aa  129  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  35.51 
 
 
274 aa  128  8.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  33.81 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  35.56 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  35.93 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2742  HpcH/HpaI aldolase  35.42 
 
 
287 aa  125  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00490393 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.87 
 
 
294 aa  125  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4374  HpcH/HpaI aldolase  37.32 
 
 
278 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12520  citrate lyase beta subunit citE  42.16 
 
 
273 aa  125  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  37.69 
 
 
278 aa  125  8.000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  39.19 
 
 
271 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  39.02 
 
 
281 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  36.93 
 
 
290 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3032  HpcH/HpaI aldolase  35.42 
 
 
289 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.33 
 
 
280 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  35.38 
 
 
284 aa  122  9e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.33 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.33 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.33 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  35.69 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  30.26 
 
 
269 aa  119  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  36.36 
 
 
285 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.78 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.78 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  33.94 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  34.78 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0204  HpcH/HpaI aldolase  34.66 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.446132  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  38.3 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  36.73 
 
 
285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  32.99 
 
 
289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  34.74 
 
 
292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  34.74 
 
 
292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  34.6 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1708  citrate lyase beta chain  31.27 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4282  HpcH/HpaI aldolase  35.19 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.174407 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2925  HpcH/HpaI aldolase  38.55 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.253914  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1107  HpcH/HpaI aldolase  42.14 
 
 
189 aa  113  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  35.85 
 
 
267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  35.4 
 
 
302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  35.4 
 
 
305 aa  112  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  34.86 
 
 
280 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.517185  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  35.87 
 
 
285 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  35.32 
 
 
307 aa  112  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  31.14 
 
 
296 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  37.09 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  32.73 
 
 
271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  34.4 
 
 
308 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>