More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2417 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 271 aa  520  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  55.39 
 
 		 274 aa  248  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  57.25 
 
 		 279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  51.48 
 
 		 279 aa  231  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  47.76 
 
 		 282 aa  229  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  47.25 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  47.15 
 
 		 291 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  49.81 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  49.25 
 
 		 279 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  48.52 
 
 		 278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  45.86 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  46.39 
 
 		 291 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  43.61 
 
 		 274 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  51.14 
 
 		 273 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  42.91 
 
 		 277 aa  201  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  48.31 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  52.77 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  49.07 
 
 		 289 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  47.37 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  52.03 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  44.28 
 
 		 271 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  39.02 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  48.09 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  48.31 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  48.31 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  44.53 
 
 		 276 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  45.9 
 
 		 268 aa  185  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  43.61 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  43.61 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  49.08 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  46.47 
 
 		 289 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  41.97 
 
 		 274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  46.1 
 
 		 289 aa  179  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  46.59 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  47.79 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  39.93 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  39.85 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  46.79 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  45.72 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3835  putative aldolase/citrate lyase  50 
 
 		 276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  46.3 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  43.54 
 
 		 275 aa  155  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  36.13 
 
 		 293 aa  152  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  44.28 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1689  HpcH/HpaI aldolase  47.04 
 
 		 268 aa  148  9e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.69146  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  36.9 
 
 		 275 aa  145  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  40.3 
 
 		 283 aa  145  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  36.7 
 
 		 307 aa  142  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  39.58 
 
 		 276 aa  142  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  41.3 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  38.66 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  38.87 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5584  HpcH/HpaI aldolase  35.58 
 
 		 310 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.331432  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5204  HpcH/HpaI aldolase  35.58 
 
 		 310 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5292  HpcH/HpaI aldolase  35.58 
 
 		 310 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1107  HpcH/HpaI aldolase  47.13 
 
 		 189 aa  135  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  38.27 
 
 		 274 aa  135  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  34.33 
 
 		 276 aa  135  8e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2378  HpcH/HpaI aldolase  35.32 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.0302108 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  33.22 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4009  HpcH/HpaI aldolase  33.71 
 
 		 306 aa  129  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  decreased coverage  0.00557053 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2320  citrate lyase, beta subunit  32.75 
 
 		 301 aa  128  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4467  HpcH/HpaI aldolase  34.08 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.99201  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  34.93 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3317  Citrate (pro-3S)-lyase  38.95 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1754  citrate lyase, beta subunit  32.75 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42542  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  33.1 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  35.36 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  35.21 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  32.75 
 
 		 291 aa  125  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0181  HpcH/HpaI aldolase  35.09 
 
 		 281 aa  125  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00870  citrate lyase beta subunit  35.38 
 
 		 321 aa  125  8.000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0531316  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  34.03 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.488048 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1313  putative citrate lyase beta subunit  38.43 
 
 		 275 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  37.96 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  31.03 
 
 		 304 aa  124  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1409  HpcH/HpaI aldolase  41.97 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000390566 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2742  HpcH/HpaI aldolase  34.33 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00490393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  35.02 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0204  HpcH/HpaI aldolase  35.44 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.446132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  30.14 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  36.97 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1932  putative citrate lyase, beta subunit  37.91 
 
 		 293 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1653  putative citrate lyase, beta subunit  37.91 
 
 		 293 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1725  putative citrate lyase, beta subunit  37.91 
 
 		 293 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  40.6 
 
 		 281 aa  123  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0608  putative citrate lyase, beta subunit  37.91 
 
 		 293 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.46771  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19950  citrate lyase beta subunit  35.98 
 
 		 281 aa  122  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.251575  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2027  citrate lyase, beta subunit  32.04 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  35.06 
 
 		 271 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3032  HpcH/HpaI aldolase  32.97 
 
 		 289 aa  122  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  34.81 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1708  citrate lyase beta chain  32 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  34.19 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  35.69 
 
 		 280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.517185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4374  HpcH/HpaI aldolase  34.64 
 
 		 278 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  35.92 
 
 		 287 aa  117  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  34.64 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  34.64 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  34.05 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>