More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3835 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3835  putative aldolase/citrate lyase  100 
 
 		 276 aa  532  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  47.39 
 
 		 291 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  50.88 
 
 		 278 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  47.39 
 
 		 291 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  50.55 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  47.97 
 
 		 274 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  46.62 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  47.92 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  51.89 
 
 		 273 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  46.62 
 
 		 274 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  44.07 
 
 		 277 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  48.34 
 
 		 274 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  45.77 
 
 		 275 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  50.92 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  46.99 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  50.37 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  51.49 
 
 		 271 aa  192  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  49.26 
 
 		 289 aa  191  8e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  47.74 
 
 		 279 aa  191  9e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  45.79 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  46.18 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  46.18 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  48.06 
 
 		 289 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  39.41 
 
 		 282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  42.59 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  45.76 
 
 		 283 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  42.59 
 
 		 268 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  43.94 
 
 		 274 aa  168  9e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  43.94 
 
 		 274 aa  168  9e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  44.61 
 
 		 279 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  45.19 
 
 		 275 aa  165  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  45.45 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  45.02 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  34.72 
 
 		 293 aa  159  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  45.09 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  43.18 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  45.09 
 
 		 275 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  42.18 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  41.82 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  42.59 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  33.95 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  42.03 
 
 		 290 aa  148  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  34.06 
 
 		 293 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  40.44 
 
 		 278 aa  146  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  35.45 
 
 		 294 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  34.57 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  44.74 
 
 		 266 aa  142  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  38.75 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19950  citrate lyase beta subunit  36.67 
 
 		 281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.251575  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0204  HpcH/HpaI aldolase  36.3 
 
 		 311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.446132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  37.91 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  36.01 
 
 		 287 aa  129  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1689  HpcH/HpaI aldolase  46.88 
 
 		 268 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.69146  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  37.68 
 
 		 276 aa  126  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  35.77 
 
 		 282 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  38.15 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  37.04 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1107  HpcH/HpaI aldolase  42.41 
 
 		 189 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  37.13 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  38.97 
 
 		 281 aa  123  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  36.4 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  37.13 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  36.36 
 
 		 284 aa  122  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  37.89 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  37.1 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  32.17 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4079  HpcH/HpaI aldolase  36.49 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  36.92 
 
 		 278 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  29.97 
 
 		 294 aa  118  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  32.27 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  31.74 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.67 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.67 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.67 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  33.92 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  34.28 
 
 		 285 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.31 
 
 		 280 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  34.28 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  33.33 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  34.69 
 
 		 307 aa  116  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  38.63 
 
 		 285 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  33.33 
 
 		 280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1039  HpcH/HpaI aldolase  40.14 
 
 		 271 aa  115  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1653  putative citrate lyase, beta subunit  39.86 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1932  putative citrate lyase, beta subunit  39.86 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0608  putative citrate lyase, beta subunit  39.86 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.46771  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1725  putative citrate lyase, beta subunit  39.86 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4467  HpcH/HpaI aldolase  32.33 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.99201  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  34.44 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  32.97 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  33.33 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  33.7 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  31.27 
 
 		 275 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  35.59 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  36.3 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4009  HpcH/HpaI aldolase  35.74 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  decreased coverage  0.00557053 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  33.8 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  32.99 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5584  HpcH/HpaI aldolase  33.09 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.331432  normal  0.321338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>