More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6127 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 294 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  95.92 
 
 		 294 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  38.27 
 
 		 279 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  42.26 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  41.04 
 
 		 270 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  38.38 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  39.54 
 
 		 279 aa  169  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  38.72 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  35.93 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  38.46 
 
 		 297 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  36.23 
 
 		 270 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  37.26 
 
 		 295 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  37.97 
 
 		 277 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  36.5 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  36.9 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  33 
 
 		 293 aa  152  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  39.1 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  36.79 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  37.12 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  36.98 
 
 		 274 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  35.45 
 
 		 271 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  36.98 
 
 		 274 aa  150  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  37.83 
 
 		 275 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  36.07 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  38.35 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  36.84 
 
 		 283 aa  149  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  34.44 
 
 		 278 aa  146  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  39.48 
 
 		 271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  38.58 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  36.36 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  34.91 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  37.94 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  37.74 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  37.74 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  36.02 
 
 		 276 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  36.5 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  34.96 
 
 		 307 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  32.49 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4467  HpcH/HpaI aldolase  35.34 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.99201  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  32.85 
 
 		 286 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  37 
 
 		 283 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4009  HpcH/HpaI aldolase  34.96 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  decreased coverage  0.00557053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  33.08 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  36.96 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2378  HpcH/HpaI aldolase  34.21 
 
 		 306 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.0302108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5204  HpcH/HpaI aldolase  33.96 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5584  HpcH/HpaI aldolase  33.96 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.331432  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5292  HpcH/HpaI aldolase  33.96 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  37.08 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  37.93 
 
 		 266 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  35.87 
 
 		 275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  32.58 
 
 		 278 aa  125  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  36.53 
 
 		 275 aa  125  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4282  HpcH/HpaI aldolase  32.57 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.174407 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  32.97 
 
 		 274 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00870  citrate lyase beta subunit  32.32 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0531316  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  31.62 
 
 		 282 aa  122  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0181  HpcH/HpaI aldolase  33.59 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  34.19 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  27.72 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  31.65 
 
 		 277 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1708  citrate lyase beta chain  29.56 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0204  HpcH/HpaI aldolase  31.6 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.446132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3032  HpcH/HpaI aldolase  30.34 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2654  HpcH/HpaI aldolase  33.21 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  29.41 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2742  HpcH/HpaI aldolase  29.96 
 
 		 287 aa  112  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00490393 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3835  putative aldolase/citrate lyase  33.96 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  33.93 
 
 		 281 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  32.01 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  30.8 
 
 		 287 aa  109  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1107  HpcH/HpaI aldolase  38.85 
 
 		 189 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  31.99 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  31.99 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.88 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  30.88 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  31.99 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19950  citrate lyase beta subunit  30.42 
 
 		 281 aa  108  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.251575  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  30.91 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  32.51 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  30.91 
 
 		 305 aa  106  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.88 
 
 		 280 aa  106  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  31.62 
 
 		 280 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  32.75 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1689  HpcH/HpaI aldolase  36.22 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.69146  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4079  HpcH/HpaI aldolase  29.93 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  30.08 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1719  HpcH/HpaI aldolase  31.6 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.422564 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2921  HpcH/HpaI aldolase  31.23 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  30.82 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3511  citrate (pro-3S)-lyase  30.88 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3048  Citryl-CoA lyase  30.53 
 
 		 288 aa  102  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  30.47 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  31.36 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3436  HpcH/HpaI aldolase  33.81 
 
 		 278 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  30.47 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  27.5 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  31.27 
 
 		 271 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7154  HpcH/HpaI aldolase  31.38 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  29.18 
 
 		 282 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>