More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0989 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  100 
 
 		 274 aa  541  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  47.29 
 
 		 278 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  47.6 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  45.79 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  45.32 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  43.98 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  45.35 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  41.13 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  40.75 
 
 		 291 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  39.11 
 
 		 282 aa  188  8e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  41.73 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  44.78 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  39.03 
 
 		 277 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  40.23 
 
 		 274 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  42.75 
 
 		 279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  45.76 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  45.76 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  43.59 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  40.3 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  40.3 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  44.65 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3835  putative aldolase/citrate lyase  48.33 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  45.39 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  45.59 
 
 		 297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  43.32 
 
 		 275 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  43.75 
 
 		 266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  43.32 
 
 		 275 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  41.63 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  43.62 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  42.8 
 
 		 283 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  41.06 
 
 		 279 aa  156  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1689  HpcH/HpaI aldolase  44.23 
 
 		 268 aa  155  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.69146  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  42.6 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  42.6 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  40.66 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  43.54 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  37.45 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  40.07 
 
 		 272 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  38.01 
 
 		 268 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  43.73 
 
 		 290 aa  145  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  40.22 
 
 		 279 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  36.92 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  35.23 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  35.09 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  35.23 
 
 		 285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1725  putative citrate lyase, beta subunit  40.21 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1653  putative citrate lyase, beta subunit  40.21 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1932  putative citrate lyase, beta subunit  40.21 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0608  putative citrate lyase, beta subunit  40.21 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.46771  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  31.49 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  33.93 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  37.27 
 
 		 274 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  36.07 
 
 		 287 aa  126  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  36.5 
 
 		 271 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  32.97 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.55 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  35.69 
 
 		 282 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  34.55 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1039  HpcH/HpaI aldolase  40.22 
 
 		 271 aa  122  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.55 
 
 		 280 aa  122  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  36.79 
 
 		 285 aa  122  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.42 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.42 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.42 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  32.61 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.06 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  32.86 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  34.64 
 
 		 278 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  30.85 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  37.86 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  32.18 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  33.81 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  32.51 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  32.51 
 
 		 292 aa  116  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  30.74 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  33.33 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  35.71 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  32.63 
 
 		 282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  34.86 
 
 		 287 aa  115  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1107  HpcH/HpaI aldolase  41.77 
 
 		 189 aa  115  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  33.33 
 
 		 282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  29.07 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  34.31 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0703  citrate lyase, beta subunit, putative  40.21 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2222  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  40.21 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  33.57 
 
 		 302 aa  112  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4467  HpcH/HpaI aldolase  32.2 
 
 		 307 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.99201  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  33.45 
 
 		 305 aa  112  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  27.72 
 
 		 289 aa  112  7.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2305  hypothetical protein  38.95 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.500849  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3632  HpcH/HpaI aldolase  35.4 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3627  HpcH/HpaI aldolase  35.4 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3700  HpcH/HpaI aldolase  35.4 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  31.12 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3511  citrate (pro-3S)-lyase  35.64 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  33.94 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5821  HpcH/HpaI aldolase  31.38 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.577572  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00870  citrate lyase beta subunit  32.29 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0531316  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  30.47 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  35.21 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>