More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2305 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2305  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.500849  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2222  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  98.63 
 
 		 293 aa  547  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1653  putative citrate lyase, beta subunit  98.29 
 
 		 293 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1725  putative citrate lyase, beta subunit  98.29 
 
 		 293 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0703  citrate lyase, beta subunit, putative  98.29 
 
 		 293 aa  544  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1932  putative citrate lyase, beta subunit  98.29 
 
 		 293 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0608  putative citrate lyase, beta subunit  98.29 
 
 		 293 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.46771  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  45.93 
 
 		 280 aa  212  7e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  45.56 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  45.56 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  46.3 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  44.04 
 
 		 280 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  44.04 
 
 		 280 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  44.04 
 
 		 280 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  43.68 
 
 		 280 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2921  HpcH/HpaI aldolase  39.63 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1719  HpcH/HpaI aldolase  40.7 
 
 		 281 aa  143  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.422564 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  33.93 
 
 		 275 aa  143  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  33.7 
 
 		 305 aa  136  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  33.7 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1708  citrate lyase beta chain  31.87 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  37.68 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  38.95 
 
 		 274 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  39.7 
 
 		 281 aa  132  7.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.28 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  37.09 
 
 		 269 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  37.68 
 
 		 276 aa  126  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  36.92 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  34.69 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1255  Citrate (pro-3S)-lyase  37.06 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327749  normal  0.0181011 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  34.86 
 
 		 286 aa  116  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  36.59 
 
 		 288 aa  115  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  36.69 
 
 		 270 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  40.58 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  40.71 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  37.23 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  34.81 
 
 		 270 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2184  HpcH/HpaI aldolase  39.26 
 
 		 286 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00433365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  33.57 
 
 		 282 aa  114  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  37.23 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  34.87 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  36.18 
 
 		 275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  33.45 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  35.74 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  36.23 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  31.65 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3027  HpcH/HpaI aldolase  33.45 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  39.86 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  36.4 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  32.17 
 
 		 282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  31 
 
 		 327 aa  109  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  25.96 
 
 		 284 aa  109  5e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  39.29 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  32.49 
 
 		 307 aa  109  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0459  HpcH/HpaI aldolase  35.29 
 
 		 286 aa  109  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.255492 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  35 
 
 		 286 aa  109  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  32.75 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  36.88 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  35.74 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  37.55 
 
 		 289 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  33.55 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  34.55 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  29.82 
 
 		 289 aa  106  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  35.27 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0204  HpcH/HpaI aldolase  34.5 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.446132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  36 
 
 		 276 aa  106  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  29.43 
 
 		 325 aa  106  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  36.27 
 
 		 283 aa  105  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  28.72 
 
 		 293 aa  105  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  36.27 
 
 		 271 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  33.57 
 
 		 277 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  32 
 
 		 310 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5821  HpcH/HpaI aldolase  34.27 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.577572  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  29.25 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  31.35 
 
 		 318 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  34.02 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  31.82 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  34.52 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  28.88 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  32.87 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  36.88 
 
 		 281 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  31.35 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  28.93 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  30.7 
 
 		 320 aa  103  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  32.86 
 
 		 292 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0268  Citryl-CoA lyase  31.36 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  34.98 
 
 		 278 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1535  Citryl-CoA lyase  37.15 
 
 		 283 aa  102  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  33.58 
 
 		 268 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  29.93 
 
 		 306 aa  102  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  34.75 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  30.74 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  28.72 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19950  citrate lyase beta subunit  34.9 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.251575  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  30.74 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  28.22 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  32.86 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3511  citrate (pro-3S)-lyase  33.46 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  38.97 
 
 		 266 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4079  HpcH/HpaI aldolase  35.49 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>