More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1932 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1932  putative citrate lyase, beta subunit  100 
 
 		 293 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1653  putative citrate lyase, beta subunit  100 
 
 		 293 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0608  putative citrate lyase, beta subunit  100 
 
 		 293 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.46771  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1725  putative citrate lyase, beta subunit  100 
 
 		 293 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0703  citrate lyase, beta subunit, putative  99.32 
 
 		 293 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2222  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  98.98 
 
 		 293 aa  554  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2305  hypothetical protein  98.29 
 
 		 293 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.500849  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  46.3 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  45.93 
 
 		 280 aa  211  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  45.93 
 
 		 280 aa  211  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  44.84 
 
 		 280 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  44.84 
 
 		 280 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  44.84 
 
 		 280 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  44.48 
 
 		 280 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  46.3 
 
 		 274 aa  206  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1719  HpcH/HpaI aldolase  41.47 
 
 		 281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.422564 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2921  HpcH/HpaI aldolase  40.37 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  34.29 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  33.7 
 
 		 302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  33.7 
 
 		 305 aa  135  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  40.21 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  37.68 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1708  citrate lyase beta chain  32.23 
 
 		 288 aa  132  5e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  40.07 
 
 		 281 aa  132  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.57 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  36.73 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  36.82 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  37.23 
 
 		 276 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  41.16 
 
 		 290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  34.55 
 
 		 282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  34.69 
 
 		 270 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  38.64 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  40.88 
 
 		 297 aa  115  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  37.04 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  36.86 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  32.85 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  37.87 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  36.86 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  39.71 
 
 		 283 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  36.46 
 
 		 270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  34.51 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  37.07 
 
 		 275 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  35.06 
 
 		 270 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2184  HpcH/HpaI aldolase  39.26 
 
 		 286 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00433365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3027  HpcH/HpaI aldolase  33.45 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1255  Citrate (pro-3S)-lyase  35.66 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327749  normal  0.0181011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  36.23 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  26.67 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  32.98 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  32.17 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  39.29 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  30.89 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  30.5 
 
 		 289 aa  109  5e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  35.74 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  34.29 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  28.97 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  33.78 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  37.55 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  31.56 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  35 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  31.29 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  29.3 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5821  HpcH/HpaI aldolase  33.57 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.577572  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  32.4 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  36 
 
 		 276 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  31.01 
 
 		 320 aa  105  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  34.55 
 
 		 291 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  35.64 
 
 		 278 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  36.3 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  35.02 
 
 		 293 aa  105  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  32.53 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1535  Citryl-CoA lyase  37.28 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  34.45 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  34.16 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  28.75 
 
 		 325 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  29.11 
 
 		 323 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0268  Citryl-CoA lyase  31.71 
 
 		 292 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  30.2 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0459  HpcH/HpaI aldolase  35.06 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.255492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  33.79 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  32.87 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  35.92 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4009  HpcH/HpaI aldolase  32.37 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  decreased coverage  0.00557053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  28.8 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  32.86 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  34.63 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  30.07 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  30.98 
 
 		 318 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  30.98 
 
 		 318 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  34.16 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  28.72 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  37.23 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  32.87 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  31.58 
 
 		 379 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  33.1 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  30.28 
 
 		 295 aa  102  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2705  citrate lyase  34.77 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  34.77 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  30.04 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4079  HpcH/HpaI aldolase  36.77 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>