More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2184 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2184  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 
286 aa  530  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00433365  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  37.23 
 
 
275 aa  178  9e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  39.86 
 
 
280 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  39.86 
 
 
280 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  39.86 
 
 
280 aa  176  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  38.21 
 
 
302 aa  168  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  37.86 
 
 
305 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  37.19 
 
 
280 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  37.19 
 
 
280 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  37.19 
 
 
280 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.84 
 
 
280 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  36.3 
 
 
274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2921  HpcH/HpaI aldolase  38.73 
 
 
280 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1719  HpcH/HpaI aldolase  38.38 
 
 
281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.422564 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  38.97 
 
 
281 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  39.46 
 
 
286 aa  132  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1653  putative citrate lyase, beta subunit  39.78 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  40.83 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0608  putative citrate lyase, beta subunit  39.78 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.46771  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1725  putative citrate lyase, beta subunit  39.78 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1932  putative citrate lyase, beta subunit  39.78 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  35.02 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  29.25 
 
 
294 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  37.18 
 
 
268 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2222  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  40.14 
 
 
293 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  36.3 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2305  hypothetical protein  39.78 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.500849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0703  citrate lyase, beta subunit, putative  40.14 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  36.43 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  37.46 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  27.95 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1708  citrate lyase beta chain  27.18 
 
 
288 aa  117  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  34.27 
 
 
282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  33.79 
 
 
282 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  40.58 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  35.64 
 
 
271 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  34.51 
 
 
278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1285  citryl-CoA lyase  35.47 
 
 
302 aa  112  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  32.63 
 
 
294 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  33.45 
 
 
282 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  35.66 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  31.93 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  35.66 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  35.87 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  34.56 
 
 
310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0268  Citryl-CoA lyase  30.36 
 
 
292 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283754  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  29.66 
 
 
306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3436  HpcH/HpaI aldolase  37.76 
 
 
278 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3632  HpcH/HpaI aldolase  36.04 
 
 
272 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5821  HpcH/HpaI aldolase  34.56 
 
 
297 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.577572  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3627  HpcH/HpaI aldolase  36.04 
 
 
272 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3700  HpcH/HpaI aldolase  36.04 
 
 
272 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  34.32 
 
 
293 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0293  HpcH/HpaI aldolase  38.13 
 
 
291 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  30.69 
 
 
306 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  37.11 
 
 
288 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  31.62 
 
 
282 aa  106  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  30.99 
 
 
318 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  30.99 
 
 
318 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  35.86 
 
 
278 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  34.53 
 
 
274 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  34.38 
 
 
279 aa  105  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  29.76 
 
 
289 aa  104  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  31.96 
 
 
292 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  33.21 
 
 
275 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  38.13 
 
 
289 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  37.32 
 
 
270 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  29.43 
 
 
304 aa  104  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  30.67 
 
 
379 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  30.35 
 
 
318 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  30 
 
 
306 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  31.96 
 
 
292 aa  103  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1878  HpcH/HpaI aldolase  37.11 
 
 
279 aa  102  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.820651  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1361  HpcH/HpaI aldolase  32.53 
 
 
295 aa  102  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  37.05 
 
 
277 aa  102  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  31.79 
 
 
269 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  29.39 
 
 
320 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  31.21 
 
 
341 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2925  HpcH/HpaI aldolase  37.63 
 
 
310 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.253914  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  30.95 
 
 
293 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4374  HpcH/HpaI aldolase  34.49 
 
 
278 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  38.28 
 
 
290 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  30.85 
 
 
302 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  30.85 
 
 
302 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2705  citrate lyase  34.22 
 
 
296 aa  99.8  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  30.85 
 
 
302 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  28.71 
 
 
293 aa  99.8  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  30.51 
 
 
302 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  35.59 
 
 
273 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  31.1 
 
 
301 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  32.98 
 
 
270 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  32.65 
 
 
277 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2314  citrate (pro-3S)-lyase  36.96 
 
 
289 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  27.22 
 
 
324 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  27.22 
 
 
324 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06890  citrate lyase beta subunit  38.81 
 
 
292 aa  98.2  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  31.47 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  27.22 
 
 
324 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  35.69 
 
 
274 aa  97.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  38.27 
 
 
266 aa  97.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>