More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3027 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3027  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 287 aa  580  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0459  HpcH/HpaI aldolase  64.54 
 
 		 286 aa  351  7e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.255492 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1708  citrate lyase beta chain  32.37 
 
 		 288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1719  HpcH/HpaI aldolase  34.46 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.422564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  32.84 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  32.84 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  32.84 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  32.03 
 
 		 280 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  32.03 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  32.03 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  32.03 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2921  HpcH/HpaI aldolase  32.82 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  31.09 
 
 		 274 aa  122  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  32.18 
 
 		 293 aa  119  6e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  28.68 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  31.64 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1653  putative citrate lyase, beta subunit  33.45 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1725  putative citrate lyase, beta subunit  33.45 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0608  putative citrate lyase, beta subunit  33.45 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.46771  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1932  putative citrate lyase, beta subunit  33.45 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  31.15 
 
 		 281 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  32.99 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  29.86 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0703  citrate lyase, beta subunit, putative  33.45 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2222  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  33.45 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2305  hypothetical protein  33.45 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.500849  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  30.39 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  31.91 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  27.9 
 
 		 305 aa  99.4  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  31.62 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  27.9 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0268  Citryl-CoA lyase  30.1 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  29.03 
 
 		 286 aa  95.9  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  31.6 
 
 		 308 aa  95.9  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  29.03 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  29.15 
 
 		 288 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5821  HpcH/HpaI aldolase  30.74 
 
 		 297 aa  93.6  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.577572  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  30.71 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  32.73 
 
 		 285 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  30.65 
 
 		 292 aa  92.4  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  29.12 
 
 		 292 aa  92.4  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  29.82 
 
 		 271 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  31.15 
 
 		 270 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  31.02 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  29.12 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  31.71 
 
 		 282 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  30.74 
 
 		 275 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  28.27 
 
 		 292 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  30.04 
 
 		 330 aa  87.4  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  29.18 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  31.91 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  29.37 
 
 		 296 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  29.07 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  28.11 
 
 		 306 aa  87  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  30.5 
 
 		 282 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  29.76 
 
 		 296 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  30.14 
 
 		 286 aa  86.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2214  HpcH/HpaI aldolase  35.04 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0660288  normal  0.0595234 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  29.76 
 
 		 296 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  27.73 
 
 		 271 aa  85.5  8e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03577  citrate lyase beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13030)  30.14 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1361  HpcH/HpaI aldolase  27.86 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2184  HpcH/HpaI aldolase  27.76 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00433365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  31.46 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  27.82 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  30.66 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  29.46 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  30.37 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  28.08 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  29.52 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  29.52 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  27.68 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3511  citrate (pro-3S)-lyase  29.74 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5949  HpcH/HpaI aldolase  29.26 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  24 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  27.92 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  28.84 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.368833 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  28.52 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  28.62 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  30.5 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  27.96 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  29.08 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  26.62 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  29.18 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  30.11 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  29.78 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  27.57 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  27.6 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  27.24 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  28.29 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  28.01 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  23.97 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  33.83 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  30.48 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  34.16 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  28.47 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  29.83 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  28.83 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  31.41 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  29.63 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>