More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1719 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1719  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 281 aa  558  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.422564 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2921  HpcH/HpaI aldolase  93.57 
 
 		 280 aa  511  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  39.55 
 
 		 280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  39.55 
 
 		 280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  39.55 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  39.33 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  39.33 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  39.33 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  39.33 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  40.22 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  36.57 
 
 		 274 aa  163  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.92 
 
 		 294 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  36.26 
 
 		 302 aa  155  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  36.26 
 
 		 305 aa  155  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  36.33 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1708  citrate lyase beta chain  33.58 
 
 		 288 aa  146  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  36.23 
 
 		 301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1653  putative citrate lyase, beta subunit  41.47 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1725  putative citrate lyase, beta subunit  41.47 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1932  putative citrate lyase, beta subunit  41.47 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0608  putative citrate lyase, beta subunit  41.47 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.46771  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  36.04 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  35.92 
 
 		 291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  34.78 
 
 		 271 aa  138  7.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  35.69 
 
 		 292 aa  136  5e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0459  HpcH/HpaI aldolase  36.68 
 
 		 286 aa  136  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.255492 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  35.74 
 
 		 283 aa  135  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3027  HpcH/HpaI aldolase  34.75 
 
 		 287 aa  135  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  33.94 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  32.62 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2222  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  41.47 
 
 		 293 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0703  citrate lyase, beta subunit, putative  41.47 
 
 		 293 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  33.45 
 
 		 341 aa  129  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  31.94 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  30.47 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  31.85 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  31.6 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  28.37 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2305  hypothetical protein  40.7 
 
 		 293 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.500849  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  32.65 
 
 		 303 aa  125  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  32.18 
 
 		 318 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  32.18 
 
 		 318 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  37.69 
 
 		 285 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  33.91 
 
 		 316 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  37.31 
 
 		 285 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  36.26 
 
 		 276 aa  122  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  31.49 
 
 		 379 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3048  Citryl-CoA lyase  35.46 
 
 		 288 aa  122  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  37.5 
 
 		 304 aa  122  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  35.13 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  35.13 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  33.11 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  37 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  37.15 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  31.83 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  31.21 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  37.02 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  35.23 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  31.21 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  39.19 
 
 		 301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  33.21 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2705  citrate lyase  34.6 
 
 		 296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2184  HpcH/HpaI aldolase  39.46 
 
 		 286 aa  119  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00433365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  33.94 
 
 		 278 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  33.58 
 
 		 270 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  32.09 
 
 		 306 aa  118  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  34.8 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  29.9 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  33.1 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  30.77 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  35.11 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  32.82 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  33.22 
 
 		 293 aa  116  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  34.89 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  36.72 
 
 		 282 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  31.72 
 
 		 313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  32.47 
 
 		 312 aa  115  5e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  29.13 
 
 		 324 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5821  HpcH/HpaI aldolase  33.1 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.577572  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  32.63 
 
 		 293 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  30.48 
 
 		 323 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0199  citrate (pro-3S)-lyase  38.38 
 
 		 289 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.31113  normal  0.0340148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  36.29 
 
 		 312 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  33.07 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  29.03 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4219  Citrate (pro-3S)-lyase  35.44 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.114392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3895  Citrate (pro-3S)-lyase  35.04 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.423668  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  31.02 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  29.97 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  31.52 
 
 		 282 aa  113  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  30.22 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2882  Citryl-CoA lyase  35.14 
 
 		 282 aa  113  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  33.09 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  34.22 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  31.18 
 
 		 287 aa  113  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  30.98 
 
 		 303 aa  112  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  30.53 
 
 		 291 aa  112  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.488048 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  28.94 
 
 		 324 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  30.32 
 
 		 327 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  28.94 
 
 		 324 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>