More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0511 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 
293 aa  595  1e-169  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  43.17 
 
 
276 aa  230  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  42.45 
 
 
271 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  41.33 
 
 
275 aa  175  9e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  40.88 
 
 
272 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  41.16 
 
 
275 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  41.16 
 
 
275 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  39.48 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  34.56 
 
 
275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  37.05 
 
 
297 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  37.5 
 
 
289 aa  149  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  33.22 
 
 
269 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  37.13 
 
 
289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  33.82 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  34.31 
 
 
267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  33.82 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  34.31 
 
 
267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  31.62 
 
 
274 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  32.36 
 
 
279 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  34.59 
 
 
295 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  37.05 
 
 
290 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  36.16 
 
 
273 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  34.43 
 
 
282 aa  143  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  35.56 
 
 
276 aa  142  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  36.57 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  33.45 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  34.26 
 
 
289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  35.16 
 
 
283 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  36.13 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  31.99 
 
 
291 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  33.21 
 
 
270 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  31.99 
 
 
291 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  32.98 
 
 
286 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  32.32 
 
 
293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  35.19 
 
 
268 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  32.59 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  36.13 
 
 
271 aa  133  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  32.13 
 
 
278 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  32.71 
 
 
270 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  32.13 
 
 
294 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  32.5 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  33.21 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  33.21 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  33.57 
 
 
283 aa  129  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0092  HpcH/HpaI aldolase  34.01 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  31.9 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00470  citrate lyase beta subunit  36.26 
 
 
296 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  31.9 
 
 
281 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  30.96 
 
 
280 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.517185  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  31.21 
 
 
274 aa  123  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  32.84 
 
 
290 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  35.36 
 
 
279 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  32.4 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3436  HpcH/HpaI aldolase  30.25 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  33.46 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  31.05 
 
 
278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0406501 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  30.92 
 
 
269 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12520  citrate lyase beta subunit citE  34.07 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  30.85 
 
 
274 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  31.39 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  31.16 
 
 
280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  31.16 
 
 
280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  30.11 
 
 
283 aa  116  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  31.69 
 
 
285 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  29.58 
 
 
306 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  30.03 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2921  HpcH/HpaI aldolase  31.39 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.8 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  29.23 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  34.69 
 
 
281 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  31.05 
 
 
280 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  29.43 
 
 
277 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  29.58 
 
 
292 aa  113  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  31.11 
 
 
271 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  27.97 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1708  citrate lyase beta chain  30.14 
 
 
288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3835  putative aldolase/citrate lyase  33.82 
 
 
276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  30.25 
 
 
323 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  29.58 
 
 
292 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1719  HpcH/HpaI aldolase  31.02 
 
 
281 aa  112  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.422564 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4374  HpcH/HpaI aldolase  29.63 
 
 
278 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  29.94 
 
 
324 aa  112  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.69 
 
 
280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.69 
 
 
280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  30.74 
 
 
282 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  29.3 
 
 
324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  30.89 
 
 
324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.69 
 
 
280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  30.89 
 
 
324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  30.57 
 
 
323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  30.63 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  28.92 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  30.55 
 
 
327 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1361  HpcH/HpaI aldolase  29.56 
 
 
295 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  28.47 
 
 
282 aa  109  5e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  29.15 
 
 
293 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4079  HpcH/HpaI aldolase  28.62 
 
 
283 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1689  HpcH/HpaI aldolase  34.46 
 
 
268 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.69146  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  29.02 
 
 
293 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00870  citrate lyase beta subunit  30.59 
 
 
321 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0531316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>