More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4082 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  100 
 
 
270 aa  534  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  86.25 
 
 
270 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  47.15 
 
 
291 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  47.15 
 
 
291 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  46.69 
 
 
279 aa  230  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  46.79 
 
 
269 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  46.95 
 
 
275 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  46.33 
 
 
274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  46.15 
 
 
277 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  45.63 
 
 
274 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  46.15 
 
 
270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  50.75 
 
 
283 aa  211  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  43.56 
 
 
282 aa  210  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  49.81 
 
 
290 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  48.05 
 
 
276 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  45.21 
 
 
267 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  45.21 
 
 
267 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  48.13 
 
 
297 aa  205  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  44.65 
 
 
278 aa  205  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  45.35 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  45.59 
 
 
274 aa  199  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  45.59 
 
 
274 aa  199  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  45.9 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  44.66 
 
 
268 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  44.49 
 
 
295 aa  191  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  41.73 
 
 
274 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  43.07 
 
 
279 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  45.02 
 
 
273 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  42.05 
 
 
271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  49.43 
 
 
266 aa  182  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  45.49 
 
 
271 aa  181  9.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  43.66 
 
 
290 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  41.89 
 
 
294 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  44.15 
 
 
289 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  44.03 
 
 
289 aa  176  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  42.86 
 
 
275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  41.04 
 
 
294 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  36.49 
 
 
293 aa  168  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  42.54 
 
 
275 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  41.67 
 
 
274 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1689  HpcH/HpaI aldolase  45.82 
 
 
268 aa  163  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.69146  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  41.95 
 
 
307 aa  161  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  40.61 
 
 
283 aa  159  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4467  HpcH/HpaI aldolase  40.07 
 
 
307 aa  159  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.99201  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5584  HpcH/HpaI aldolase  40.07 
 
 
310 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.331432  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3835  putative aldolase/citrate lyase  46.42 
 
 
276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5204  HpcH/HpaI aldolase  40.07 
 
 
310 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5292  HpcH/HpaI aldolase  40.07 
 
 
310 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  40.15 
 
 
275 aa  153  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4009  HpcH/HpaI aldolase  40.45 
 
 
306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  decreased coverage  0.00557053 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  40.5 
 
 
288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  41.92 
 
 
289 aa  152  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.3 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  38.24 
 
 
276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2378  HpcH/HpaI aldolase  39.02 
 
 
306 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.0302108 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0181  HpcH/HpaI aldolase  39.3 
 
 
281 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  41.13 
 
 
272 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1313  putative citrate lyase beta subunit  39.25 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  37.31 
 
 
271 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  37.74 
 
 
286 aa  139  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  35.85 
 
 
267 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  29.7 
 
 
276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  36.05 
 
 
275 aa  135  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  36.81 
 
 
293 aa  133  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00870  citrate lyase beta subunit  36.59 
 
 
321 aa  132  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0531316  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  33.7 
 
 
278 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12520  citrate lyase beta subunit citE  38.64 
 
 
273 aa  132  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  32.71 
 
 
293 aa  132  5e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  36.82 
 
 
281 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1708  citrate lyase beta chain  32.71 
 
 
288 aa  131  9e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  32.99 
 
 
330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  34.04 
 
 
304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  38.31 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  35.61 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  33.7 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0204  HpcH/HpaI aldolase  33.21 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.446132  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  35.59 
 
 
282 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  35.56 
 
 
285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  36.26 
 
 
277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0066  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.33 
 
 
289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0064  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  33.33 
 
 
289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0065  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  33.33 
 
 
289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0065  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.33 
 
 
289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0067  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.33 
 
 
289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  36.96 
 
 
287 aa  129  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19950  citrate lyase beta subunit  34.56 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.251575  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2925  HpcH/HpaI aldolase  38.26 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.253914  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3317  Citrate (pro-3S)-lyase  39.02 
 
 
280 aa  126  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  36.73 
 
 
286 aa  126  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  36.59 
 
 
292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1039  HpcH/HpaI aldolase  39.71 
 
 
271 aa  126  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  34.46 
 
 
282 aa  126  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  32.61 
 
 
291 aa  125  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  37.77 
 
 
285 aa  125  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1107  HpcH/HpaI aldolase  43.87 
 
 
189 aa  125  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  37.5 
 
 
278 aa  125  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3436  HpcH/HpaI aldolase  35.36 
 
 
278 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  32.37 
 
 
290 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  35.94 
 
 
282 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  31.18 
 
 
296 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>