More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1039 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1039  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 
271 aa  523  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  43.77 
 
 
275 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  44.15 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  44.15 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  40.44 
 
 
278 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  41.48 
 
 
278 aa  156  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  40.3 
 
 
270 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  42.34 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  37.83 
 
 
269 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  39.34 
 
 
270 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  40.22 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  40.68 
 
 
276 aa  142  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  41.89 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  39.85 
 
 
270 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  40.43 
 
 
279 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  40.31 
 
 
279 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  36.33 
 
 
282 aa  139  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  38.06 
 
 
291 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  36.84 
 
 
268 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  38.26 
 
 
291 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  42.96 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  39.34 
 
 
279 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  31.42 
 
 
293 aa  132  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  37.08 
 
 
274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  37.45 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  37.79 
 
 
274 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  37.79 
 
 
274 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  31.67 
 
 
282 aa  125  5e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  40 
 
 
283 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  38.69 
 
 
289 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  39.03 
 
 
289 aa  123  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  35.09 
 
 
274 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  37.14 
 
 
280 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.517185  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  39.11 
 
 
274 aa  122  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  33.69 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  38.46 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  33.33 
 
 
275 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  33.83 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  38.66 
 
 
289 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  30.22 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  39.13 
 
 
272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  36.63 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  31.82 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  36.24 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  35.48 
 
 
277 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  34.56 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  36.63 
 
 
276 aa  112  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  35.27 
 
 
277 aa  112  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  30.6 
 
 
306 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  34.56 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  38.55 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  35.92 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  41.54 
 
 
271 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  29.78 
 
 
294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  29.93 
 
 
304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  38.78 
 
 
285 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  29.41 
 
 
294 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  38.18 
 
 
275 aa  108  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  36.76 
 
 
277 aa  108  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0064  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  31.14 
 
 
289 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  29.3 
 
 
276 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  30.5 
 
 
296 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2742  HpcH/HpaI aldolase  31.7 
 
 
287 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00490393 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19950  citrate lyase beta subunit  32.96 
 
 
281 aa  108  9.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.251575  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3032  HpcH/HpaI aldolase  32.83 
 
 
289 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  35.02 
 
 
278 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  33.68 
 
 
292 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  38.55 
 
 
275 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  38.83 
 
 
297 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  38.72 
 
 
289 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  34.04 
 
 
292 aa  106  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0065  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  29.76 
 
 
289 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0067  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  29.76 
 
 
289 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0066  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  29.76 
 
 
289 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0065  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  29.76 
 
 
289 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  39.93 
 
 
281 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0204  HpcH/HpaI aldolase  32.83 
 
 
311 aa  104  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.446132  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  30.47 
 
 
289 aa  104  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  33.8 
 
 
293 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0400  citrate lyase  29.93 
 
 
298 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.726359  normal  0.0212977 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4079  HpcH/HpaI aldolase  36.3 
 
 
283 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  30.68 
 
 
271 aa  102  7e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  26.07 
 
 
284 aa  102  9e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  34.71 
 
 
285 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  32.44 
 
 
330 aa  101  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  34.83 
 
 
307 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  34.71 
 
 
285 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2378  HpcH/HpaI aldolase  34.69 
 
 
306 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.0302108 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  32.59 
 
 
305 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  32.59 
 
 
302 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1719  HpcH/HpaI aldolase  36.58 
 
 
281 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.422564 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4009  HpcH/HpaI aldolase  35.06 
 
 
306 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  decreased coverage  0.00557053 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  27.14 
 
 
269 aa  99  7e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  31.88 
 
 
280 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  31.88 
 
 
280 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  31.88 
 
 
280 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1621  HpcH/HpaI aldolase  37.23 
 
 
362 aa  99  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0115166  decreased coverage  0.0000000158082 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  31.88 
 
 
280 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  29.68 
 
 
291 aa  99  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.488048 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  32.59 
 
 
280 aa  99  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.397559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>