More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2378 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2378  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 
306 aa  625  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.0302108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4009  HpcH/HpaI aldolase  91.83 
 
 
306 aa  581  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  decreased coverage  0.00557053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  82.35 
 
 
307 aa  511  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5204  HpcH/HpaI aldolase  84.41 
 
 
310 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5584  HpcH/HpaI aldolase  84.41 
 
 
310 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.331432  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5292  HpcH/HpaI aldolase  84.41 
 
 
310 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4467  HpcH/HpaI aldolase  81.88 
 
 
307 aa  500  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.99201  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0181  HpcH/HpaI aldolase  76.41 
 
 
281 aa  421  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00870  citrate lyase beta subunit  65.79 
 
 
321 aa  402  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0531316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  51.82 
 
 
277 aa  266  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2742  HpcH/HpaI aldolase  49.81 
 
 
287 aa  267  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00490393 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  49.63 
 
 
283 aa  263  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3032  HpcH/HpaI aldolase  49.44 
 
 
289 aa  263  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4282  HpcH/HpaI aldolase  49.26 
 
 
280 aa  249  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.174407 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0204  HpcH/HpaI aldolase  46.04 
 
 
311 aa  232  5e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.446132  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19950  citrate lyase beta subunit  47.19 
 
 
281 aa  218  8.999999999999998e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.251575  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2654  HpcH/HpaI aldolase  45.83 
 
 
267 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  39.02 
 
 
270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  38.64 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  33.46 
 
 
269 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  38.96 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  38.96 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  32.59 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  32.95 
 
 
291 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  34.21 
 
 
294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  35.27 
 
 
279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  33.45 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  32.69 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  34.21 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  36.86 
 
 
276 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  33.91 
 
 
282 aa  123  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  33.61 
 
 
274 aa  122  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  30.18 
 
 
293 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  31.56 
 
 
277 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  29.17 
 
 
276 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  34.98 
 
 
268 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  35.57 
 
 
274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  38.04 
 
 
266 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  35.34 
 
 
290 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  34.47 
 
 
271 aa  116  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  31.68 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  34.45 
 
 
278 aa  109  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  32.31 
 
 
267 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  32.31 
 
 
267 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  33.19 
 
 
289 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  30.97 
 
 
279 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  31.56 
 
 
270 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  33.21 
 
 
273 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  33.61 
 
 
286 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  29.15 
 
 
293 aa  106  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  32.58 
 
 
271 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  33.06 
 
 
283 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  33.9 
 
 
275 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  32.1 
 
 
278 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  33.7 
 
 
297 aa  102  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  31.11 
 
 
272 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  29.17 
 
 
274 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  33.78 
 
 
295 aa  99.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  33.98 
 
 
281 aa  98.6  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  31.5 
 
 
289 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  28.74 
 
 
292 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  28.74 
 
 
292 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1653  putative citrate lyase, beta subunit  30.71 
 
 
293 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1932  putative citrate lyase, beta subunit  30.71 
 
 
293 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0608  putative citrate lyase, beta subunit  30.71 
 
 
293 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.46771  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1725  putative citrate lyase, beta subunit  30.71 
 
 
293 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  29.46 
 
 
280 aa  93.6  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  29.46 
 
 
280 aa  93.6  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  31.39 
 
 
289 aa  93.2  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  29.46 
 
 
280 aa  92.8  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1689  HpcH/HpaI aldolase  34.71 
 
 
268 aa  91.3  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.69146  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  29.37 
 
 
267 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  30.48 
 
 
289 aa  90.5  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  31.97 
 
 
292 aa  90.1  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1719  HpcH/HpaI aldolase  34 
 
 
281 aa  90.1  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.422564 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2222  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.71 
 
 
293 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0703  citrate lyase, beta subunit, putative  30.71 
 
 
293 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  31.76 
 
 
277 aa  89  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  31.47 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  29.37 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.11 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  29.37 
 
 
289 aa  87.8  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  33.33 
 
 
276 aa  88.2  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.11 
 
 
280 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.11 
 
 
280 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.11 
 
 
280 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2921  HpcH/HpaI aldolase  32 
 
 
280 aa  87  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  29.28 
 
 
282 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  30.3 
 
 
303 aa  85.9  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  29.75 
 
 
274 aa  85.9  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  32.4 
 
 
292 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  31.23 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  30.63 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  32.4 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2305  hypothetical protein  30.29 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.500849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  32.72 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00470  citrate lyase beta subunit  32.58 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  30.2 
 
 
310 aa  84  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  31.05 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  31.69 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>