More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00470 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00470  citrate lyase beta subunit  100 
 
 		 296 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1409  HpcH/HpaI aldolase  56 
 
 		 279 aa  253  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000390566 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1313  putative citrate lyase beta subunit  58.58 
 
 		 275 aa  247  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  53.16 
 
 		 282 aa  246  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12520  citrate lyase beta subunit citE  55.26 
 
 		 273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2925  HpcH/HpaI aldolase  58.61 
 
 		 310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.253914  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3317  Citrate (pro-3S)-lyase  52.42 
 
 		 280 aa  241  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1391  HpcH/HpaI aldolase  52.36 
 
 		 277 aa  239  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375922  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1361  HpcH/HpaI aldolase  47.1 
 
 		 295 aa  236  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2104  HpcH/HpaI aldolase  58.06 
 
 		 285 aa  233  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.87307  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  50.38 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06890  citrate lyase beta subunit  53.52 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3848  HpcH/HpaI aldolase  60.57 
 
 		 296 aa  229  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  50.19 
 
 		 271 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3627  HpcH/HpaI aldolase  49.25 
 
 		 272 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858993  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3632  HpcH/HpaI aldolase  49.25 
 
 		 272 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3700  HpcH/HpaI aldolase  49.25 
 
 		 272 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  42.86 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  38.81 
 
 		 278 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  41.88 
 
 		 276 aa  148  9e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  40.66 
 
 		 281 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4374  HpcH/HpaI aldolase  40.29 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  41.78 
 
 		 293 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  38.27 
 
 		 282 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  39.26 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  35.82 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  42.59 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1535  Citryl-CoA lyase  40.57 
 
 		 283 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  37.91 
 
 		 292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  37.91 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  37.05 
 
 		 283 aa  139  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  36.59 
 
 		 282 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  31.47 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  39.69 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  33.1 
 
 		 282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  40.08 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0092  HpcH/HpaI aldolase  38.28 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  43.18 
 
 		 276 aa  136  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  36.36 
 
 		 285 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  41.47 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  36 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3436  HpcH/HpaI aldolase  41.97 
 
 		 278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  38.21 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0268  Citryl-CoA lyase  36.43 
 
 		 292 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  35.4 
 
 		 285 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  36.47 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  38.15 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  35.87 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  38.69 
 
 		 286 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  37.81 
 
 		 274 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  37.96 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  38.26 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  32.22 
 
 		 282 aa  126  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2324  Citrate (pro-3S)-lyase  42.93 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  30.58 
 
 		 289 aa  126  6e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  41.44 
 
 		 267 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  41.44 
 
 		 267 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  36.84 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5821  HpcH/HpaI aldolase  34.71 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.577572  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  38.21 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  40.22 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  38.43 
 
 		 271 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  33.58 
 
 		 276 aa  123  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  40.15 
 
 		 297 aa  122  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  35.98 
 
 		 274 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  41.16 
 
 		 275 aa  122  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  38.49 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  38.49 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  38.79 
 
 		 283 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  36.84 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  38.41 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1878  HpcH/HpaI aldolase  40.5 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.820651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  38.11 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  41.67 
 
 		 266 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  33.33 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  31.91 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  35.09 
 
 		 305 aa  119  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  35.09 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  38.75 
 
 		 274 aa  119  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  39.08 
 
 		 279 aa  119  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  40.43 
 
 		 295 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  34.67 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  38.38 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  38.6 
 
 		 270 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  35.23 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  32.13 
 
 		 306 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  32.13 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  40.36 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  38.43 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  35.69 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  40.22 
 
 		 271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  41.37 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4079  HpcH/HpaI aldolase  37.05 
 
 		 283 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  37.5 
 
 		 273 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1255  Citrate (pro-3S)-lyase  36.46 
 
 		 289 aa  112  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327749  normal  0.0181011 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  29.57 
 
 		 269 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  26.24 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0293  HpcH/HpaI aldolase  41.4 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2705  citrate lyase  34.16 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  37.5 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>