More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2324 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2324  Citrate (pro-3S)-lyase  100 
 
 
347 aa  661    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  62.61 
 
 
288 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  61.33 
 
 
293 aa  226  6e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  55.26 
 
 
276 aa  187  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  41.21 
 
 
294 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  38.64 
 
 
292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  38.64 
 
 
292 aa  144  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  44.62 
 
 
287 aa  136  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  42.08 
 
 
293 aa  135  8e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  37 
 
 
296 aa  133  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  40.1 
 
 
306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1313  putative citrate lyase beta subunit  43.75 
 
 
275 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  39.59 
 
 
306 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  36.82 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  40.41 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  36.84 
 
 
282 aa  127  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  36.84 
 
 
289 aa  127  4.0000000000000003e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  38.38 
 
 
290 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  39.8 
 
 
306 aa  126  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  39.05 
 
 
280 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  39.05 
 
 
280 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  39.05 
 
 
280 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  39.05 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00470  citrate lyase beta subunit  43.01 
 
 
296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  36.59 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  39.68 
 
 
267 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2925  HpcH/HpaI aldolase  37.5 
 
 
310 aa  119  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.253914  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2320  citrate lyase, beta subunit  36.59 
 
 
301 aa  119  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3632  HpcH/HpaI aldolase  39.15 
 
 
272 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  42.71 
 
 
276 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  36.5 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.488048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3627  HpcH/HpaI aldolase  39.15 
 
 
272 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3700  HpcH/HpaI aldolase  39.15 
 
 
272 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0065  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  37.31 
 
 
289 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3317  Citrate (pro-3S)-lyase  40.41 
 
 
280 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0067  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  37.31 
 
 
289 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0065  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  37.31 
 
 
289 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0066  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  37.31 
 
 
289 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  37.98 
 
 
274 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  35.86 
 
 
406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1754  citrate lyase, beta subunit  35.78 
 
 
291 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42542  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0064  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  36.79 
 
 
289 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  37.89 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  38.32 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06890  citrate lyase beta subunit  44.67 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2027  citrate lyase, beta subunit  35.29 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  41.18 
 
 
286 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  34.12 
 
 
285 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  38.78 
 
 
302 aa  113  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  38.78 
 
 
305 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  34.12 
 
 
285 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  40.84 
 
 
280 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  40.84 
 
 
280 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  34.47 
 
 
269 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  35.78 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  41.32 
 
 
282 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  40.84 
 
 
280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  33.18 
 
 
285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  37.11 
 
 
287 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  37.84 
 
 
277 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  38.1 
 
 
270 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0325  citrate lyase, beta subunit  37.88 
 
 
291 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  38.71 
 
 
270 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  33.33 
 
 
284 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  41.26 
 
 
291 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  37.82 
 
 
271 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  35.16 
 
 
292 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  29.43 
 
 
325 aa  105  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03577  citrate lyase beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13030)  36.15 
 
 
323 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  36.14 
 
 
302 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.14 
 
 
302 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.14 
 
 
302 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1361  HpcH/HpaI aldolase  36.57 
 
 
295 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.14 
 
 
302 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  33.52 
 
 
308 aa  103  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  35.94 
 
 
279 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  35.43 
 
 
279 aa  103  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  33.69 
 
 
291 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  36.7 
 
 
301 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12520  citrate lyase beta subunit citE  36.36 
 
 
273 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  34.38 
 
 
276 aa  102  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0722  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  36.14 
 
 
302 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  33.16 
 
 
291 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00584  citrate lyase, citryl-ACP lyase (beta) subunit  36.14 
 
 
302 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3009  citrate lyase, beta subunit  36.14 
 
 
302 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0667  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.14 
 
 
302 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0635  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.14 
 
 
302 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00573  hypothetical protein  36.14 
 
 
302 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3028  citrate lyase, beta subunit  36.14 
 
 
302 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0638  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.14 
 
 
302 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  38.42 
 
 
279 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0704  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.14 
 
 
302 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0530  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.14 
 
 
302 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  39.67 
 
 
289 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  34.95 
 
 
274 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  31.34 
 
 
284 aa  100  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  35.47 
 
 
282 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  32.3 
 
 
320 aa  100  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  35.29 
 
 
282 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1391  HpcH/HpaI aldolase  39.58 
 
 
277 aa  99.8  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>