More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1361 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1361  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 295 aa  597  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3317  Citrate (pro-3S)-lyase  59.21 
 
 		 280 aa  298  6e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  53.93 
 
 		 271 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  53.56 
 
 		 267 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  51.3 
 
 		 282 aa  258  9e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12520  citrate lyase beta subunit citE  52.01 
 
 		 273 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3632  HpcH/HpaI aldolase  52.21 
 
 		 272 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3627  HpcH/HpaI aldolase  52.21 
 
 		 272 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3700  HpcH/HpaI aldolase  52.21 
 
 		 272 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2925  HpcH/HpaI aldolase  54.72 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.253914  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1391  HpcH/HpaI aldolase  49.64 
 
 		 277 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375922  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1409  HpcH/HpaI aldolase  49.82 
 
 		 279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000390566 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06890  citrate lyase beta subunit  50 
 
 		 292 aa  215  5.9999999999999996e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2104  HpcH/HpaI aldolase  50 
 
 		 285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.87307  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00470  citrate lyase beta subunit  47.74 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3848  HpcH/HpaI aldolase  51.32 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1313  putative citrate lyase beta subunit  46.47 
 
 		 275 aa  188  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  40.78 
 
 		 281 aa  142  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  37.5 
 
 		 276 aa  142  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  37.18 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  34.56 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  34.33 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  32.74 
 
 		 275 aa  129  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4374  HpcH/HpaI aldolase  34.91 
 
 		 278 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  34.48 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  33.96 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  37.99 
 
 		 274 aa  125  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  34.69 
 
 		 277 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  37.99 
 
 		 274 aa  125  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  32.71 
 
 		 276 aa  125  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  34.97 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  34.91 
 
 		 283 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  35.4 
 
 		 288 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1535  Citryl-CoA lyase  37.37 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  32.35 
 
 		 270 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  34.28 
 
 		 274 aa  122  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1878  HpcH/HpaI aldolase  35.4 
 
 		 279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.820651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  31.7 
 
 		 269 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.3 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  33.11 
 
 		 292 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  33.58 
 
 		 275 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  33.11 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  34.74 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  33.95 
 
 		 282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.74 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  35.79 
 
 		 271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.74 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.74 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  37.5 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.74 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  35.29 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  31.76 
 
 		 305 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  31.76 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  36.23 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  30.6 
 
 		 282 aa  112  8.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  30.8 
 
 		 279 aa  112  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  35.59 
 
 		 290 aa  112  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  29.5 
 
 		 269 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  33.81 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  32.74 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  31.6 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.517185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  33.46 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  29.56 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0092  HpcH/HpaI aldolase  33.56 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  31.67 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  35.56 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  32.6 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  33.21 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2324  Citrate (pro-3S)-lyase  36.57 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  32.73 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0268  Citryl-CoA lyase  32.08 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  34.01 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  31.94 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  36.7 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  31.25 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5821  HpcH/HpaI aldolase  31.85 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.577572  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  32.37 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  32.37 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  28.42 
 
 		 296 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  33.59 
 
 		 277 aa  102  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  32.45 
 
 		 302 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  32.74 
 
 		 274 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2705  citrate lyase  30.74 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00584  citrate lyase, citryl-ACP lyase (beta) subunit  32.29 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3009  citrate lyase, beta subunit  32.29 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00573  hypothetical protein  32.29 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0667  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.29 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0530  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.29 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3028  citrate lyase, beta subunit  32.29 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0704  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.29 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1708  citrate lyase beta chain  31.75 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  34.07 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0638  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.29 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  30.45 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0635  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.29 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  30.58 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3436  HpcH/HpaI aldolase  31.1 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.33 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  32.46 
 
 		 267 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  31.41 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>