290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2742 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2742  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 
287 aa  579  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00490393 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3032  HpcH/HpaI aldolase  94.77 
 
 
289 aa  544  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  68.73 
 
 
277 aa  388  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4282  HpcH/HpaI aldolase  59.65 
 
 
280 aa  352  4e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.174407 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00870  citrate lyase beta subunit  50.35 
 
 
321 aa  272  5.000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0531316  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  49.82 
 
 
307 aa  270  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5584  HpcH/HpaI aldolase  51.14 
 
 
310 aa  269  5e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.331432  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5204  HpcH/HpaI aldolase  51.14 
 
 
310 aa  269  5e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5292  HpcH/HpaI aldolase  51.14 
 
 
310 aa  269  5e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  50.37 
 
 
283 aa  268  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2378  HpcH/HpaI aldolase  49.81 
 
 
306 aa  267  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.0302108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4009  HpcH/HpaI aldolase  49.81 
 
 
306 aa  264  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  decreased coverage  0.00557053 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4467  HpcH/HpaI aldolase  50.19 
 
 
307 aa  259  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.99201  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0204  HpcH/HpaI aldolase  50.18 
 
 
311 aa  256  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.446132  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0181  HpcH/HpaI aldolase  48.67 
 
 
281 aa  254  9e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19950  citrate lyase beta subunit  48.03 
 
 
281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.251575  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2654  HpcH/HpaI aldolase  42.42 
 
 
267 aa  191  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  39.22 
 
 
276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  32.32 
 
 
269 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  34.07 
 
 
275 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  35.47 
 
 
277 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  34.2 
 
 
291 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  34.32 
 
 
279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  34.23 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  33.84 
 
 
291 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  33.88 
 
 
279 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  35.32 
 
 
274 aa  122  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  30.19 
 
 
270 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  35.32 
 
 
274 aa  122  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  32.1 
 
 
271 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  32.83 
 
 
267 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  32.83 
 
 
267 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  33.09 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  33.61 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  31.82 
 
 
268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  30.14 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  30.22 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  34.85 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  30.71 
 
 
294 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  33.57 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  36.03 
 
 
275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  35.06 
 
 
275 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  34.34 
 
 
273 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  29.96 
 
 
294 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  30.6 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  29.41 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  35.51 
 
 
289 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  33.7 
 
 
297 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  31.94 
 
 
274 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  33.48 
 
 
271 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  35.77 
 
 
290 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  32.48 
 
 
272 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  35.29 
 
 
289 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  36.1 
 
 
275 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  26.46 
 
 
293 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  35.66 
 
 
290 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  32.12 
 
 
295 aa  99  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  34.04 
 
 
289 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  32.07 
 
 
275 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  32.62 
 
 
277 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  31.23 
 
 
281 aa  97.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  29.87 
 
 
282 aa  96.7  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  26.71 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  34.05 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  37.17 
 
 
266 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  27.68 
 
 
274 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  29.41 
 
 
310 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1039  HpcH/HpaI aldolase  31.7 
 
 
271 aa  89.7  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2641  Citryl-CoA lyase  29.93 
 
 
295 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7288  citrate lyase  29.25 
 
 
295 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.380781 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  29.08 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  29.08 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  28.98 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1689  HpcH/HpaI aldolase  36.96 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.69146  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1261  putative citrate lyase  33.91 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3029  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  33.91 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4079  HpcH/HpaI aldolase  29.64 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  27.83 
 
 
379 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  31.78 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  31.78 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  31.78 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  31.78 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0268  Citryl-CoA lyase  29.63 
 
 
292 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283754  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  26.42 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  27.04 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  27.04 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2226  citrate lyase beta subunit  32.91 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.709952  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  27.68 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  28.96 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  27.97 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  29.08 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  28.22 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  29 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  29.68 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.17 
 
 
280 aa  79  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  30.17 
 
 
280 aa  79  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  27.18 
 
 
287 aa  79  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  29.18 
 
 
318 aa  79  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  32.63 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  29.09 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>