227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5586 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5586  hypothetical protein  100 
 
 		 803 aa  1613    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6340  hypothetical protein  37.92 
 
 		 772 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  27.62 
 
 		 827 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  28.17 
 
 		 996 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 850 aa  122  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  25.57 
 
 		 962 aa  120  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  25.93 
 
 		 797 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  25.15 
 
 		 834 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  31.03 
 
 		 993 aa  110  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  25.5 
 
 		 946 aa  110  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  31.21 
 
 		 1025 aa  109  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  25.66 
 
 		 983 aa  108  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  25.44 
 
 		 919 aa  108  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  28.47 
 
 		 1027 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  31.47 
 
 		 1008 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  26.03 
 
 		 790 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  32.53 
 
 		 964 aa  105  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  24.34 
 
 		 965 aa  104  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  26.59 
 
 		 1088 aa  104  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  25.96 
 
 		 931 aa  104  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8120  NB-ARC domain protein  32.15 
 
 		 978 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  31.95 
 
 		 1022 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  36.84 
 
 		 990 aa  102  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  34.6 
 
 		 992 aa  101  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  25.9 
 
 		 971 aa  100  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  30.45 
 
 		 981 aa  100  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  34.95 
 
 		 1001 aa  99.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  28.62 
 
 		 715 aa  99  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  29.15 
 
 		 1030 aa  98.2  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  30.45 
 
 		 930 aa  96.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  27.04 
 
 		 913 aa  97.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4985  Tetratricopeptide TPR_4  27.8 
 
 		 687 aa  96.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.688243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  24.82 
 
 		 941 aa  96.3  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  26.86 
 
 		 1108 aa  95.5  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.7 
 
 		 742 aa  95.5  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2780  transcriptional regulator, XRE family  31.4 
 
 		 782 aa  94.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  27.27 
 
 		 990 aa  94  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  33.65 
 
 		 1014 aa  94  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  27.14 
 
 		 995 aa  93.6  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  26.81 
 
 		 992 aa  94  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1666  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 462 aa  94  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  30.42 
 
 		 788 aa  93.2  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  29.86 
 
 		 1003 aa  93.2  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  36.72 
 
 		 1025 aa  92.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  25.81 
 
 		 806 aa  91.3  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  28.31 
 
 		 908 aa  90.9  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  30.34 
 
 		 1003 aa  90.1  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  25 
 
 		 1017 aa  90.5  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  30.48 
 
 		 783 aa  90.1  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  26.65 
 
 		 1004 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  24.96 
 
 		 967 aa  90.1  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  25.66 
 
 		 1010 aa  89  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  32.35 
 
 		 1138 aa  89  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  30.82 
 
 		 982 aa  89  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  23.09 
 
 		 970 aa  88.6  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  26.87 
 
 		 915 aa  88.2  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 		 775 aa  88.2  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  30.28 
 
 		 814 aa  87.8  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  28.72 
 
 		 1024 aa  86.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  25.45 
 
 		 1022 aa  85.5  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  29.93 
 
 		 1030 aa  85.1  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  31.29 
 
 		 921 aa  84.7  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  23.3 
 
 		 956 aa  84.7  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  32.85 
 
 		 934 aa  84.7  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5286  transcriptional regulator, XRE family  26.05 
 
 		 810 aa  84.3  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 755 aa  83.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  27.09 
 
 		 907 aa  83.2  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  30.7 
 
 		 1034 aa  83.2  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 1048 aa  82.4  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  31.39 
 
 		 989 aa  82.8  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 1071 aa  82  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  30.04 
 
 		 950 aa  82  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  30.51 
 
 		 1054 aa  81.6  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  33.96 
 
 		 910 aa  80.9  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  24.18 
 
 		 741 aa  80.5  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34600  putative transcriptional regulator  29.45 
 
 		 896 aa  80.5  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.240739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  28.95 
 
 		 928 aa  80.5  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  26.77 
 
 		 940 aa  80.5  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 907 aa  80.1  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1806  transcriptional regulator, SARP family  29.9 
 
 		 1060 aa  80.1  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287202  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  28.06 
 
 		 921 aa  79.3  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  30.04 
 
 		 770 aa  78.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  30 
 
 		 792 aa  78.2  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  25.47 
 
 		 928 aa  77.4  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  29.29 
 
 		 775 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6871  hypothetical protein  30.49 
 
 		 854 aa  77  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  28.99 
 
 		 937 aa  76.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  30.7 
 
 		 612 aa  75.5  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  30.77 
 
 		 965 aa  75.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  30.81 
 
 		 994 aa  75.1  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  35.62 
 
 		 1033 aa  74.7  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0225  transcriptional regulator, XRE family  27.82 
 
 		 792 aa  74.7  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  29.52 
 
 		 1020 aa  74.7  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 654 aa  73.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  24.66 
 
 		 1011 aa  73.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2767  hypothetical protein  28.24 
 
 		 715 aa  73.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0532773  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  30.07 
 
 		 838 aa  72.8  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  29.56 
 
 		 621 aa  72  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  24.64 
 
 		 993 aa  72  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  24.16 
 
 		 1021 aa  71.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>