More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3205 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3205  dehydrogenase, isocitrate/isopropylmalate family  100 
 
 		 396 aa  811    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0643665  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3071  3-isopropylmalate dehydrogenase  85.61 
 
 		 396 aa  704    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  54.08 
 
 		 615 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  53.53 
 
 		 615 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.05 
 
 		 370 aa  312  5.999999999999999e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2964  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.58 
 
 		 403 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  35.81 
 
 		 339 aa  249  4e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  35.91 
 
 		 339 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  36.36 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  37.02 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1368  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.86 
 
 		 420 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.53 
 
 		 362 aa  229  6e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.13 
 
 		 338 aa  228  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  35.97 
 
 		 343 aa  227  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  36.04 
 
 		 336 aa  223  6e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  36.04 
 
 		 336 aa  223  6e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  36.04 
 
 		 336 aa  223  6e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  36.31 
 
 		 331 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.46 
 
 		 360 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  36.39 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  37.13 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  35.77 
 
 		 335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  35.5 
 
 		 335 aa  220  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  34.32 
 
 		 330 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  34.59 
 
 		 330 aa  219  5e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  34.59 
 
 		 330 aa  219  5e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  38.63 
 
 		 323 aa  219  6e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  35.5 
 
 		 335 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.5 
 
 		 334 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  35.77 
 
 		 335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  35.77 
 
 		 335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  35.77 
 
 		 335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  35.77 
 
 		 335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  36.29 
 
 		 361 aa  216  8e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  36.14 
 
 		 336 aa  216  8e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  37.7 
 
 		 335 aa  215  9e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  35.14 
 
 		 336 aa  215  9e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  35.23 
 
 		 335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1632  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.53 
 
 		 375 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.341727  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1339  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.53 
 
 		 375 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  35.41 
 
 		 334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  36.14 
 
 		 335 aa  212  7e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.63 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.23 
 
 		 331 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  35.77 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.53 
 
 		 332 aa  210  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.31 
 
 		 326 aa  210  4e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  36.39 
 
 		 336 aa  209  7e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  34.59 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.46 
 
 		 349 aa  209  9e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  34.85 
 
 		 335 aa  208  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.05 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  36.54 
 
 		 334 aa  206  5e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  37.23 
 
 		 340 aa  205  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1797  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.08 
 
 		 329 aa  205  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2146  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.26 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.26 
 
 		 335 aa  203  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  35.58 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.76 
 
 		 348 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  35.58 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  34.51 
 
 		 335 aa  200  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  33.24 
 
 		 333 aa  199  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.84 
 
 		 371 aa  197  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  37.27 
 
 		 326 aa  197  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6279  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.8 
 
 		 363 aa  197  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000172683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2804  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.63 
 
 		 359 aa  196  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  35.12 
 
 		 335 aa  194  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.37 
 
 		 353 aa  193  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1230  tartrate dehydrogenase  36.1 
 
 		 352 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  34.23 
 
 		 336 aa  193  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.51 
 
 		 357 aa  193  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.51 
 
 		 357 aa  193  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  35.52 
 
 		 336 aa  192  7e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.41 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  37.06 
 
 		 334 aa  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  32 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0637  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.73 
 
 		 322 aa  190  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253022  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  31.73 
 
 		 359 aa  190  4e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  33.16 
 
 		 337 aa  189  5e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  31.81 
 
 		 359 aa  188  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0609  3-isopropylmalate dehydrogenase  31.83 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35358  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.89 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1914  tartrate dehydrogenase  36.97 
 
 		 352 aa  187  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  33.76 
 
 		 377 aa  186  4e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1585  tartrate dehydrogenase  36.84 
 
 		 358 aa  186  7e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.48 
 
 		 364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  35.34 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.42 
 
 		 355 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.04 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  33.68 
 
 		 361 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  31.23 
 
 		 348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1612  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.05 
 
 		 370 aa  183  6e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  33.69 
 
 		 335 aa  182  7e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14420  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  36.72 
 
 		 356 aa  182  9.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  32.99 
 
 		 354 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2762  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.31 
 
 		 326 aa  182  9.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  33.68 
 
 		 375 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0235  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.16 
 
 		 336 aa  181  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1454  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.86 
 
 		 354 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.16 
 
 		 346 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>