More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3304 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
331 aa  664    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.62 
 
 
360 aa  362  4e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.55 
 
 
362 aa  356  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.19 
 
 
332 aa  348  5e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.21 
 
 
335 aa  341  8e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.84 
 
 
334 aa  334  1e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.03 
 
 
333 aa  326  4.0000000000000003e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.88 
 
 
337 aa  293  3e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  44.14 
 
 
339 aa  289  4e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.54 
 
 
339 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  45.78 
 
 
330 aa  286  2e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.94 
 
 
339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  45.48 
 
 
330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  45.48 
 
 
330 aa  286  4e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  46.18 
 
 
360 aa  285  8e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  45.92 
 
 
335 aa  282  5.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  47.26 
 
 
334 aa  282  7.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.69 
 
 
343 aa  281  1e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03850  isocitrate dehydrogenase, putative  44.6 
 
 
370 aa  277  1e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  46.08 
 
 
331 aa  278  1e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.58 
 
 
333 aa  277  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  45.87 
 
 
336 aa  276  5e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  43.81 
 
 
323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.42 
 
 
331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  45.9 
 
 
335 aa  272  6e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  45.59 
 
 
335 aa  270  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.84 
 
 
326 aa  271  2e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  44.38 
 
 
340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  45.59 
 
 
335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  43.07 
 
 
335 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  43.07 
 
 
335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  43.84 
 
 
330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  43.03 
 
 
336 aa  266  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  41.87 
 
 
336 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  43.85 
 
 
377 aa  265  5.999999999999999e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  42.47 
 
 
336 aa  265  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  41.87 
 
 
336 aa  265  8e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  42.17 
 
 
335 aa  264  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.12 
 
 
338 aa  265  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.01 
 
 
370 aa  264  2e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.34 
 
 
331 aa  264  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  41.87 
 
 
336 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  41.87 
 
 
336 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  41.87 
 
 
336 aa  263  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2762  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.33 
 
 
326 aa  261  8e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  41.87 
 
 
335 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  41.87 
 
 
335 aa  261  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  41.87 
 
 
335 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  41.87 
 
 
335 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  41.87 
 
 
335 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  44.88 
 
 
336 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  44.68 
 
 
334 aa  259  4e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  42.47 
 
 
336 aa  259  4e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  41.74 
 
 
335 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  41.44 
 
 
335 aa  258  7e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.02 
 
 
334 aa  258  1e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  40.95 
 
 
335 aa  256  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.55 
 
 
325 aa  253  3e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.65 
 
 
336 aa  252  5.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0870  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  44.94 
 
 
332 aa  252  7e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  40.12 
 
 
337 aa  252  7e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0637  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.82 
 
 
322 aa  250  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253022  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.94 
 
 
326 aa  250  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1797  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.69 
 
 
329 aa  249  5e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2146  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.12 
 
 
321 aa  249  6e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1101  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.67 
 
 
344 aa  247  2e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  38.66 
 
 
361 aa  245  9e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  43.24 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0898  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.11 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  40.12 
 
 
348 aa  242  7e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.99 
 
 
348 aa  242  7e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.35 
 
 
335 aa  239  5e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0235  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.75 
 
 
336 aa  238  1e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  37.68 
 
 
359 aa  237  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  37.68 
 
 
359 aa  237  2e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1134  isocitrate dehydrogenase  40.12 
 
 
481 aa  236  4e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.404972 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  37.96 
 
 
359 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4079  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.11 
 
 
343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1295  isocitrate dehydrogenase  39.82 
 
 
480 aa  232  5e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0769313  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  42.12 
 
 
338 aa  232  6e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.95 
 
 
342 aa  232  7.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.42 
 
 
336 aa  232  7.000000000000001e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0665  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  45.65 
 
 
344 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2064  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.62 
 
 
325 aa  229  4e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.189691 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  38.82 
 
 
385 aa  229  6e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.5 
 
 
361 aa  226  5.0000000000000005e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1605  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.15 
 
 
325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1557  isocitrate dehydrogenase  38.34 
 
 
480 aa  225  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4250  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.11 
 
 
343 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  40.53 
 
 
336 aa  223  3e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0833  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.46 
 
 
325 aa  223  3e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.11 
 
 
345 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2029  isocitrate dehydrogenase  40.19 
 
 
487 aa  223  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2190  isocitrate dehydrogenase  38.73 
 
 
485 aa  222  6e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.62 
 
 
357 aa  222  6e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1320  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.78 
 
 
343 aa  222  6e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2411  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  41.07 
 
 
345 aa  221  9e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2380  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  41.32 
 
 
344 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1073  isocitrate dehydrogenase (NADP)  37.95 
 
 
337 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.606358  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1815  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.85 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000286516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>