More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4042 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  100 
 
 
348 aa  712    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  58.66 
 
 
336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  55.93 
 
 
334 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  54.65 
 
 
335 aa  393  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  54.57 
 
 
335 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  53.01 
 
 
336 aa  379  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  54.57 
 
 
335 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.18 
 
 
331 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  53.96 
 
 
335 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  53.29 
 
 
334 aa  376  1e-103  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  53.66 
 
 
336 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  53.05 
 
 
336 aa  371  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  51.52 
 
 
361 aa  368  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  53.35 
 
 
336 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  53.35 
 
 
336 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  53.35 
 
 
336 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  53.35 
 
 
336 aa  368  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  53.66 
 
 
335 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  52.13 
 
 
335 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  53.35 
 
 
335 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  53.35 
 
 
336 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  53.66 
 
 
335 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  53.66 
 
 
335 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  53.35 
 
 
336 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  52.73 
 
 
333 aa  365  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  53.66 
 
 
335 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  51.18 
 
 
340 aa  359  4e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  49.24 
 
 
335 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  50.15 
 
 
331 aa  355  5.999999999999999e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  51.37 
 
 
348 aa  354  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  49.24 
 
 
335 aa  353  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  47.89 
 
 
385 aa  346  3e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  49.01 
 
 
359 aa  346  3e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  48.74 
 
 
359 aa  346  3e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  50.75 
 
 
335 aa  345  8.999999999999999e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  48.46 
 
 
359 aa  342  7e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  50.15 
 
 
335 aa  339  2.9999999999999998e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  50.15 
 
 
335 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  49.17 
 
 
364 aa  338  9.999999999999999e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  50.3 
 
 
334 aa  334  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  50.6 
 
 
335 aa  333  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  47.35 
 
 
361 aa  332  7.000000000000001e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04610  isocitrate dehydrogenase, putative  47.89 
 
 
379 aa  331  1e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.673993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  50.9 
 
 
345 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  49.24 
 
 
336 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42313  mitochondrial isocitrate dehydrogenase (NAD+) subunit 2  45.92 
 
 
367 aa  323  2e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00286555  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  49.24 
 
 
342 aa  322  8e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  48.38 
 
 
338 aa  318  7.999999999999999e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1101  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  51.38 
 
 
344 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2029  isocitrate dehydrogenase  47.29 
 
 
487 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91057  isocitrate dehydrogenase  45.48 
 
 
362 aa  304  1.0000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.433771 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0079  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  43.3 
 
 
389 aa  301  8.000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05790  isocitrate dehydrogenase subunit 1, mitochondrial precursor (Broad)  46.57 
 
 
439 aa  301  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.420111 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0665  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  48.8 
 
 
344 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.06 
 
 
335 aa  293  2e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.4 
 
 
334 aa  292  7e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.34 
 
 
333 aa  291  1e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4079  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  47.94 
 
 
343 aa  287  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1134  isocitrate dehydrogenase  45.37 
 
 
481 aa  286  2.9999999999999996e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.404972 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4250  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  48.09 
 
 
343 aa  285  7e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1557  isocitrate dehydrogenase  44.64 
 
 
480 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3335  isocitrate dehydrogenase  44.84 
 
 
482 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2411  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  46.31 
 
 
345 aa  278  9e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02060  isocitrate dehydrogenase (NAD+), putative  42.09 
 
 
378 aa  277  2e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2380  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  46.47 
 
 
344 aa  277  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.02 
 
 
336 aa  276  3e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  43.71 
 
 
330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0444  isocitrate dehydrogenase  41.76 
 
 
478 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  43.41 
 
 
330 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1295  isocitrate dehydrogenase  43.28 
 
 
480 aa  272  6e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0769313  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2190  isocitrate dehydrogenase  44.19 
 
 
485 aa  271  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  43.94 
 
 
331 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  43.11 
 
 
330 aa  269  7e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4313  isocitrate dehydrogenase  42.81 
 
 
456 aa  266  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0560117 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  43.49 
 
 
330 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.17 
 
 
326 aa  264  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.59 
 
 
336 aa  263  3e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1114  isocitrate dehydrogenase  42.9 
 
 
482 aa  259  6e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0890  isocitrate dehydrogenase  40.45 
 
 
482 aa  257  2e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.98 
 
 
339 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.69 
 
 
339 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.69 
 
 
339 aa  255  8e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  38.3 
 
 
337 aa  255  8e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0172  isocitrate dehydrogenase  37.72 
 
 
471 aa  253  5.000000000000001e-66  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1984  isocitrate dehydrogenase  40.99 
 
 
483 aa  250  3e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.569508  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.06 
 
 
337 aa  249  5e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.9 
 
 
370 aa  248  1e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0791  isocitrate dehydrogenase  39.89 
 
 
472 aa  245  6e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.54 
 
 
335 aa  246  6e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1073  isocitrate dehydrogenase (NADP)  39.47 
 
 
337 aa  243  3e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.606358  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  40.91 
 
 
323 aa  243  5e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.12 
 
 
331 aa  242  7e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.72 
 
 
362 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.23 
 
 
338 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.42 
 
 
326 aa  238  1e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1453  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  47.77 
 
 
246 aa  237  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0623  isocitrate dehydrogenase (NADP)  37.31 
 
 
342 aa  236  4e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0699  isocitrate dehydrogenase  34.68 
 
 
412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144889  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2939  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  38.44 
 
 
434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  40.73 
 
 
360 aa  231  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>