More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0699 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0699  isocitrate dehydrogenase  100 
 
 		 412 aa  841    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144889  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2348  isocitrate dehydrogenase  56.9 
 
 		 432 aa  482  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0782  isocitrate dehydrogenase  57.73 
 
 		 423 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2678  isocitrate dehydrogenase  56.94 
 
 		 424 aa  475  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6591  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  56.35 
 
 		 421 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102471  normal  0.856757 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0378  isocitrate dehydrogenase  56.14 
 
 		 422 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1257  isocitrate dehydrogenase  56.12 
 
 		 422 aa  467  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1751  isocitrate dehydrogenase  56.04 
 
 		 422 aa  462  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.85951  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1785  isocitrate dehydrogenase  56.04 
 
 		 422 aa  462  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.576701  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1244  isocitrate dehydrogenase  56.2 
 
 		 391 aa  461  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.484015  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1166  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  55.93 
 
 		 420 aa  450  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2697  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  54.68 
 
 		 419 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3277  isocitrate dehydrogenase  56.28 
 
 		 430 aa  443  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1401  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  55.15 
 
 		 426 aa  441  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0535  isocitrate dehydrogenase  55.8 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0195794 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4724  isocitrate dehydrogenase  57.47 
 
 		 435 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4487  isocitrate dehydrogenase  57.47 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4322  isocitrate dehydrogenase  57.47 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4334  isocitrate dehydrogenase  57.47 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4719  isocitrate dehydrogenase  55.8 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4838  isocitrate dehydrogenase  55.8 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4703  isocitrate dehydrogenase  55.8 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4423  isocitrate dehydrogenase  55.8 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2186  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  51.18 
 
 		 437 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4708  isocitrate dehydrogenase  55.8 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166005 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2235  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  50.71 
 
 		 437 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2323  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  50.71 
 
 		 437 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.051263  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1505  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent  54.52 
 
 		 424 aa  432  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0469387 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1684  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  53.9 
 
 		 425 aa  434  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0785  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  50.11 
 
 		 453 aa  433  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1880  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  52.43 
 
 		 415 aa  431  1e-119  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1241  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  50.11 
 
 		 454 aa  430  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0586  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  53.49 
 
 		 430 aa  425  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0424  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  53.49 
 
 		 428 aa  425  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1625  isocitrate dehydrogenase (NADP)  50.24 
 
 		 437 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0866166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1038  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.44 
 
 		 465 aa  420  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000173439  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2139  isocitrate dehydrogenase (NADP)  53.54 
 
 		 413 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000111217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1349  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  52.87 
 
 		 427 aa  412  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1050  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.97 
 
 		 600 aa  412  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1288  isocitrate dehydrogenase [NADP]  53.11 
 
 		 428 aa  414  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2895  isocitrate dehydrogenase  52.81 
 
 		 416 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.328131 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0618  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  50.49 
 
 		 421 aa  409  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.384588  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0878  isocitrate dehydrogenase  51.59 
 
 		 418 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0849  isocitrate dehydrogenase  51.59 
 
 		 418 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1264  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  51.09 
 
 		 418 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1930  isocitrate dehydrogenase  51.33 
 
 		 417 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0486  isocitrate dehydrogenase  51.56 
 
 		 419 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0132  isocitrate dehydrogenase  51.56 
 
 		 419 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0960  isocitrate dehydrogenase  51.56 
 
 		 419 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.607193  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2756  isocitrate dehydrogenase  51.83 
 
 		 416 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0854  isocitrate dehydrogenase (NADP)  50.12 
 
 		 413 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.515822 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1108  isocitrate dehydrogenase  51.56 
 
 		 419 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000441125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0683  isocitrate dehydrogenase  51.56 
 
 		 419 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205602  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1015  isocitrate dehydrogenase  51.56 
 
 		 419 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.575855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1739  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  48.86 
 
 		 382 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1840  isocitrate dehydrogenase  50.6 
 
 		 419 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0956  isocitrate dehydrogenase  51.82 
 
 		 419 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0812619  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0565  isocitrate dehydrogenase  51.59 
 
 		 418 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000686773  decreased coverage  0.000103322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3661  isocitrate dehydrogenase  50.12 
 
 		 420 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158813 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2245  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  50.49 
 
 		 417 aa  397  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000403811  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0759  isocitrate dehydrogenase  52.2 
 
 		 419 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00264456  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2942  isocitrate dehydrogenase  51.08 
 
 		 417 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1881  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  50.25 
 
 		 407 aa  396  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.328566  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1261  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  52.93 
 
 		 414 aa  395  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1562  isocitrate dehydrogenase  50.97 
 
 		 419 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2297  isocitrate dehydrogenase  50.73 
 
 		 419 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351069  normal  0.0198285 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  50.61 
 
 		 586 aa  395  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0452  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  46.37 
 
 		 470 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173819  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01134  isocitrate dehydrogenase  49.88 
 
 		 416 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2511  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.88 
 
 		 416 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.173116  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1315  isocitrate dehydrogenase  49.64 
 
 		 416 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1256  isocitrate dehydrogenase  49.64 
 
 		 416 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00899143  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3119  isocitrate dehydrogenase (NADP)  52.21 
 
 		 413 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1989  isocitrate dehydrogenase  49.88 
 
 		 416 aa  393  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1598  isocitrate dehydrogenase  50.12 
 
 		 416 aa  394  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606037 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01142  hypothetical protein  49.88 
 
 		 416 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0797  isocitrate dehydrogenase  50.74 
 
 		 418 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000273834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1299  isocitrate dehydrogenase  49.88 
 
 		 416 aa  393  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2649  isocitrate dehydrogenase  50.12 
 
 		 419 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3896  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  50.39 
 
 		 411 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2467  isocitrate dehydrogenase  49.64 
 
 		 416 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2572  isocitrate dehydrogenase  51.34 
 
 		 419 aa  395  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0647268  decreased coverage  0.00287604 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2490  isocitrate dehydrogenase  52.07 
 
 		 416 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1378  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent  49.02 
 
 		 422 aa  391  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5856  isocitrate dehydrogenase  50.61 
 
 		 418 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261017  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2549  isocitrate dehydrogenase  50.61 
 
 		 418 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0115447  hitchhiker  0.0000544039 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2761  isocitrate dehydrogenase  50.86 
 
 		 417 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0660078  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0439  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  46.53 
 
 		 386 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.364858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1913  isocitrate dehydrogenase  50.61 
 
 		 418 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1908  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  51.55 
 
 		 413 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2572  isocitrate dehydrogenase  50.61 
 
 		 418 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2524  isocitrate dehydrogenase  50.61 
 
 		 418 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140161  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3169  isocitrate dehydrogenase  50.98 
 
 		 418 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000957877  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2443  isocitrate dehydrogenase  50.61 
 
 		 418 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000919661 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.77 
 
 		 589 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1317  isocitrate dehydrogenase  49.28 
 
 		 416 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1355  isocitrate dehydrogenase  49.28 
 
 		 416 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.485597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2769  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.63 
 
 		 417 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0196883 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2468  isocitrate dehydrogenase  51.09 
 
 		 417 aa  386  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240334  normal  0.106657 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1649  isocitrate dehydrogenase  49.64 
 
 		 416 aa  385  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0964571  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>