More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1378 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1840  isocitrate dehydrogenase  71.29 
 
 		 419 aa  650    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1378  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent  100 
 
 		 422 aa  865    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0132  isocitrate dehydrogenase  70.57 
 
 		 419 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0486  isocitrate dehydrogenase  70.57 
 
 		 419 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0849  isocitrate dehydrogenase  70.57 
 
 		 418 aa  632  1e-180  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0956  isocitrate dehydrogenase  70.57 
 
 		 419 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0812619  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2756  isocitrate dehydrogenase  69.95 
 
 		 416 aa  631  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1015  isocitrate dehydrogenase  70.57 
 
 		 419 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.575855  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1108  isocitrate dehydrogenase  70.57 
 
 		 419 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000441125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0960  isocitrate dehydrogenase  70.57 
 
 		 419 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.607193  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0565  isocitrate dehydrogenase  70.33 
 
 		 418 aa  633  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000686773  decreased coverage  0.000103322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30190  isocitrate dehydrogenase  70.57 
 
 		 418 aa  630  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0683  isocitrate dehydrogenase  70.57 
 
 		 419 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205602  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3169  isocitrate dehydrogenase  70.1 
 
 		 418 aa  629  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000957877  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1349  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  69.21 
 
 		 427 aa  627  1e-179  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0878  isocitrate dehydrogenase  70.33 
 
 		 418 aa  630  1e-179  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0759  isocitrate dehydrogenase  70.33 
 
 		 419 aa  629  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00264456  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1288  isocitrate dehydrogenase [NADP]  69.45 
 
 		 428 aa  630  1e-179  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0797  isocitrate dehydrogenase  69.86 
 
 		 418 aa  628  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000273834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2895  isocitrate dehydrogenase  70.67 
 
 		 416 aa  630  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.328131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2584  isocitrate dehydrogenase  70.57 
 
 		 418 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.261253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3661  isocitrate dehydrogenase  70.67 
 
 		 420 aa  628  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3616  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  70.33 
 
 		 418 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.133268  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4011  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  69.86 
 
 		 418 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  0.120573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1822  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  69.86 
 
 		 418 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.083178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2752  isocitrate dehydrogenase  69.95 
 
 		 416 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.687266  normal  0.825547 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2349  isocitrate dehydrogenase  69.95 
 
 		 416 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297968  normal  0.244469 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1562  isocitrate dehydrogenase  70.5 
 
 		 419 aa  627  1e-178  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2769  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  70.19 
 
 		 417 aa  625  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0196883 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1930  isocitrate dehydrogenase  69.71 
 
 		 417 aa  627  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2297  isocitrate dehydrogenase  70.26 
 
 		 419 aa  625  1e-178  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351069  normal  0.0198285 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2468  isocitrate dehydrogenase  68.75 
 
 		 417 aa  622  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240334  normal  0.106657 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2396  isocitrate dehydrogenase (NADP)  69.62 
 
 		 418 aa  623  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286181  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2490  isocitrate dehydrogenase  69.47 
 
 		 416 aa  621  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3415  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  69.38 
 
 		 418 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3593  isocitrate dehydrogenase (NADP)  69.62 
 
 		 418 aa  623  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2761  isocitrate dehydrogenase  69.95 
 
 		 417 aa  622  1e-177  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0660078  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2942  isocitrate dehydrogenase  69.47 
 
 		 417 aa  622  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0770  isocitrate dehydrogenase  69.86 
 
 		 418 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000236369 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2649  isocitrate dehydrogenase  69.3 
 
 		 419 aa  622  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2245  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  69.23 
 
 		 417 aa  619  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000403811  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2549  isocitrate dehydrogenase  69.38 
 
 		 418 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0115447  hitchhiker  0.0000544039 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5856  isocitrate dehydrogenase  69.38 
 
 		 418 aa  617  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261017  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2443  isocitrate dehydrogenase  69.14 
 
 		 418 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000919661 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1913  isocitrate dehydrogenase  69.38 
 
 		 418 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1723  isocitrate dehydrogenase  69.57 
 
 		 417 aa  614  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2848  isocitrate dehydrogenase  69.57 
 
 		 417 aa  614  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1615  isocitrate dehydrogenase  69.57 
 
 		 417 aa  614  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2572  isocitrate dehydrogenase  69.14 
 
 		 418 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2524  isocitrate dehydrogenase  69.38 
 
 		 418 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140161  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2572  isocitrate dehydrogenase  68.82 
 
 		 419 aa  616  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0647268  decreased coverage  0.00287604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1261  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  70.81 
 
 		 414 aa  612  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1299  isocitrate dehydrogenase  68.12 
 
 		 416 aa  607  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01134  isocitrate dehydrogenase  68.12 
 
 		 416 aa  607  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2025  isocitrate dehydrogenase  68.84 
 
 		 417 aa  607  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.11175 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01142  hypothetical protein  68.12 
 
 		 416 aa  607  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1989  isocitrate dehydrogenase  68.12 
 
 		 416 aa  607  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2511  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  67.63 
 
 		 416 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.173116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2467  isocitrate dehydrogenase  67.87 
 
 		 416 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1264  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  67.22 
 
 		 418 aa  605  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1315  isocitrate dehydrogenase  67.87 
 
 		 416 aa  606  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1598  isocitrate dehydrogenase  68.12 
 
 		 416 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606037 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1256  isocitrate dehydrogenase  67.87 
 
 		 416 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00899143  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1946  isocitrate dehydrogenase  68.12 
 
 		 416 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1355  isocitrate dehydrogenase  67.87 
 
 		 416 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.485597 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2128  isocitrate dehydrogenase  68.12 
 
 		 416 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573381 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1317  isocitrate dehydrogenase  67.87 
 
 		 416 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1339  isocitrate dehydrogenase  68.12 
 
 		 416 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.697532  normal  0.0115036 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2157  isocitrate dehydrogenase  67.15 
 
 		 417 aa  598  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0640579  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0854  isocitrate dehydrogenase (NADP)  67.7 
 
 		 413 aa  598  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.515822 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1872  isocitrate dehydrogenase  67.15 
 
 		 417 aa  598  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.138329  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1945  isocitrate dehydrogenase  67.63 
 
 		 417 aa  597  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1649  isocitrate dehydrogenase  66.91 
 
 		 416 aa  594  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0964571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2060  isocitrate dehydrogenase  66.91 
 
 		 417 aa  592  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.714189  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3119  isocitrate dehydrogenase (NADP)  67.07 
 
 		 413 aa  588  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2896  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  67.47 
 
 		 416 aa  587  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0310087  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2139  isocitrate dehydrogenase (NADP)  67.39 
 
 		 413 aa  585  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000111217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0314  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  66.03 
 
 		 419 aa  585  1e-166  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.839134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0618  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  66.75 
 
 		 421 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.384588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1401  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  64.44 
 
 		 426 aa  551  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1166  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  64.34 
 
 		 420 aa  550  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1505  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent  63.38 
 
 		 424 aa  543  1e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0469387 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2348  isocitrate dehydrogenase  61.29 
 
 		 432 aa  531  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1684  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  61.74 
 
 		 425 aa  529  1e-149  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0782  isocitrate dehydrogenase  60.42 
 
 		 423 aa  528  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2678  isocitrate dehydrogenase  59.67 
 
 		 424 aa  524  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0424  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.3 
 
 		 428 aa  518  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0586  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  58.99 
 
 		 430 aa  519  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0378  isocitrate dehydrogenase  61.37 
 
 		 422 aa  518  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2323  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  58.73 
 
 		 437 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.051263  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2235  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  58.73 
 
 		 437 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4487  isocitrate dehydrogenase  59.72 
 
 		 435 aa  501  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4322  isocitrate dehydrogenase  59.72 
 
 		 435 aa  501  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4334  isocitrate dehydrogenase  59.72 
 
 		 435 aa  501  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4703  isocitrate dehydrogenase  59.72 
 
 		 430 aa  501  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4838  isocitrate dehydrogenase  59.72 
 
 		 430 aa  501  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4719  isocitrate dehydrogenase  59.72 
 
 		 430 aa  501  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2186  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  57.97 
 
 		 437 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0535  isocitrate dehydrogenase  59.72 
 
 		 430 aa  502  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0195794 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4423  isocitrate dehydrogenase  59.48 
 
 		 430 aa  501  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>