More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0785 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1241  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  95.8 
 
 		 454 aa  886    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0785  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  100 
 
 		 453 aa  922    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2348  isocitrate dehydrogenase  69.18 
 
 		 432 aa  639    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2235  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  70.02 
 
 		 437 aa  640    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1050  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  76.79 
 
 		 600 aa  701    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2186  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  70.02 
 
 		 437 aa  642    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2323  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  70.02 
 
 		 437 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.051263  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1625  isocitrate dehydrogenase (NADP)  69.8 
 
 		 437 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0866166  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0782  isocitrate dehydrogenase  68.17 
 
 		 423 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2678  isocitrate dehydrogenase  67.04 
 
 		 424 aa  608  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0378  isocitrate dehydrogenase  66.59 
 
 		 422 aa  604  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3277  isocitrate dehydrogenase  67.19 
 
 		 430 aa  597  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4724  isocitrate dehydrogenase  65.61 
 
 		 435 aa  586  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4719  isocitrate dehydrogenase  65.61 
 
 		 430 aa  586  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4487  isocitrate dehydrogenase  65.61 
 
 		 435 aa  586  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4322  isocitrate dehydrogenase  65.61 
 
 		 435 aa  586  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4334  isocitrate dehydrogenase  65.61 
 
 		 435 aa  586  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4703  isocitrate dehydrogenase  65.61 
 
 		 430 aa  586  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4708  isocitrate dehydrogenase  65.61 
 
 		 430 aa  586  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166005 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4838  isocitrate dehydrogenase  65.61 
 
 		 430 aa  586  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4423  isocitrate dehydrogenase  65.38 
 
 		 430 aa  585  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0535  isocitrate dehydrogenase  65.61 
 
 		 430 aa  585  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0195794 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1038  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  61.73 
 
 		 465 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000173439  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6591  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  63.18 
 
 		 421 aa  568  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102471  normal  0.856757 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1257  isocitrate dehydrogenase  63.81 
 
 		 422 aa  565  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1785  isocitrate dehydrogenase  63.57 
 
 		 422 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.576701  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1751  isocitrate dehydrogenase  63.57 
 
 		 422 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.85951  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1401  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  64.41 
 
 		 426 aa  557  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1166  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  62.78 
 
 		 420 aa  551  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1684  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.39 
 
 		 425 aa  539  9.999999999999999e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0452  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  58.33 
 
 		 470 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173819  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1505  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent  60.18 
 
 		 424 aa  534  1e-150  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0469387 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1880  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  57.92 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2245  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.55 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000403811  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01134  isocitrate dehydrogenase  58.33 
 
 		 416 aa  502  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2511  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  58.33 
 
 		 416 aa  502  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.173116  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0486  isocitrate dehydrogenase  57.89 
 
 		 419 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1598  isocitrate dehydrogenase  58.33 
 
 		 416 aa  502  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606037 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2756  isocitrate dehydrogenase  58.48 
 
 		 416 aa  504  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0683  isocitrate dehydrogenase  57.89 
 
 		 419 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205602  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1108  isocitrate dehydrogenase  57.89 
 
 		 419 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000441125  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01142  hypothetical protein  58.33 
 
 		 416 aa  502  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1989  isocitrate dehydrogenase  58.33 
 
 		 416 aa  502  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0770  isocitrate dehydrogenase  60.14 
 
 		 418 aa  502  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000236369 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1299  isocitrate dehydrogenase  58.33 
 
 		 416 aa  502  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0960  isocitrate dehydrogenase  57.89 
 
 		 419 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.607193  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0132  isocitrate dehydrogenase  57.89 
 
 		 419 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1288  isocitrate dehydrogenase [NADP]  59.46 
 
 		 428 aa  502  1e-141  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1015  isocitrate dehydrogenase  57.89 
 
 		 419 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.575855  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1355  isocitrate dehydrogenase  58.56 
 
 		 416 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.485597 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0956  isocitrate dehydrogenase  58.02 
 
 		 419 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0812619  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1315  isocitrate dehydrogenase  58.11 
 
 		 416 aa  500  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0565  isocitrate dehydrogenase  58.2 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000686773  decreased coverage  0.000103322 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2549  isocitrate dehydrogenase  59.02 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0115447  hitchhiker  0.0000544039 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2467  isocitrate dehydrogenase  58.11 
 
 		 416 aa  500  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0854  isocitrate dehydrogenase (NADP)  59.01 
 
 		 413 aa  499  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.515822 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5856  isocitrate dehydrogenase  59.02 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261017  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1946  isocitrate dehydrogenase  58.56 
 
 		 416 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3169  isocitrate dehydrogenase  59.01 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000957877  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0759  isocitrate dehydrogenase  58.57 
 
 		 419 aa  498  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00264456  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1881  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  61.63 
 
 		 407 aa  501  1e-140  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.328566  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0797  isocitrate dehydrogenase  58.78 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000273834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1349  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.23 
 
 		 427 aa  500  1e-140  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1256  isocitrate dehydrogenase  58.11 
 
 		 416 aa  500  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00899143  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1913  isocitrate dehydrogenase  59.02 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2572  isocitrate dehydrogenase  59.02 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2524  isocitrate dehydrogenase  59.02 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140161  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1317  isocitrate dehydrogenase  58.56 
 
 		 416 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2128  isocitrate dehydrogenase  58.56 
 
 		 416 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573381 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2443  isocitrate dehydrogenase  59.02 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000919661 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1339  isocitrate dehydrogenase  58.56 
 
 		 416 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.697532  normal  0.0115036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4011  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  58.65 
 
 		 418 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  0.120573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2490  isocitrate dehydrogenase  57.81 
 
 		 416 aa  497  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0878  isocitrate dehydrogenase  57.8 
 
 		 418 aa  495  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0849  isocitrate dehydrogenase  57.8 
 
 		 418 aa  495  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2396  isocitrate dehydrogenase (NADP)  58.78 
 
 		 418 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286181  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1822  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  58.65 
 
 		 418 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.083178 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1649  isocitrate dehydrogenase  58.11 
 
 		 416 aa  497  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0964571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2349  isocitrate dehydrogenase  57.81 
 
 		 416 aa  494  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297968  normal  0.244469 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2025  isocitrate dehydrogenase  57.75 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.11175 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2752  isocitrate dehydrogenase  57.81 
 
 		 416 aa  494  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.687266  normal  0.825547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3616  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.82 
 
 		 418 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.133268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3415  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.58 
 
 		 418 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2895  isocitrate dehydrogenase  58.04 
 
 		 416 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.328131 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1723  isocitrate dehydrogenase  57.98 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1562  isocitrate dehydrogenase  58.52 
 
 		 419 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2848  isocitrate dehydrogenase  57.98 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3661  isocitrate dehydrogenase  58.97 
 
 		 420 aa  494  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158813 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1615  isocitrate dehydrogenase  57.98 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1945  isocitrate dehydrogenase  57.53 
 
 		 417 aa  491  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2584  isocitrate dehydrogenase  58.33 
 
 		 418 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.261253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2297  isocitrate dehydrogenase  58.3 
 
 		 419 aa  491  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351069  normal  0.0198285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3593  isocitrate dehydrogenase (NADP)  57.88 
 
 		 418 aa  490  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2942  isocitrate dehydrogenase  57.08 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1950  isocitrate dehydrogenase (NADP)  53.24 
 
 		 481 aa  491  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30190  isocitrate dehydrogenase  58.33 
 
 		 418 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1261  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  58.5 
 
 		 414 aa  491  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332531  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2468  isocitrate dehydrogenase  56.85 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240334  normal  0.106657 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2572  isocitrate dehydrogenase  57.75 
 
 		 419 aa  488  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0647268  decreased coverage  0.00287604 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1930  isocitrate dehydrogenase  56.92 
 
 		 417 aa  488  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>