More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1950 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1950  isocitrate dehydrogenase (NADP)  100 
 
 		 481 aa  998    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2071  isocitrate dehydrogenase  60.34 
 
 		 475 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00869667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0452  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.04 
 
 		 470 aa  588  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173819  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0313  isocitrate dehydrogenase  59.7 
 
 		 475 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0708281 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4831  isocitrate dehydrogenase  58.97 
 
 		 473 aa  580  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0262562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3969  isocitrate dehydrogenase  59.7 
 
 		 475 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0071  isocitrate dehydrogenase  58.97 
 
 		 472 aa  575  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4014  isocitrate dehydrogenase  59.7 
 
 		 475 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1719  isocitrate dehydrogenase  61.19 
 
 		 475 aa  573  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1038  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.23 
 
 		 465 aa  571  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000173439  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20451  isocitrate dehydrogenase  56.99 
 
 		 474 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1170  isocitrate dehydrogenase  57.14 
 
 		 474 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1215  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  57.26 
 
 		 473 aa  561  1.0000000000000001e-159  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17831  isocitrate dehydrogenase  56.9 
 
 		 474 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18051  isocitrate dehydrogenase  56.48 
 
 		 474 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17171  isocitrate dehydrogenase  57.2 
 
 		 474 aa  561  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.271508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17881  isocitrate dehydrogenase  55.84 
 
 		 474 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0161  isocitrate dehydrogenase  56.48 
 
 		 474 aa  553  1e-156  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0700483 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1688  isocitrate dehydrogenase  55.84 
 
 		 474 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25761  isocitrate dehydrogenase  57.48 
 
 		 474 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0191  isocitrate dehydrogenase  55.96 
 
 		 474 aa  546  1e-154  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2348  isocitrate dehydrogenase  59.22 
 
 		 432 aa  531  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0782  isocitrate dehydrogenase  57.39 
 
 		 423 aa  501  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2678  isocitrate dehydrogenase  57.86 
 
 		 424 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1401  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  55.67 
 
 		 426 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2186  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  55.79 
 
 		 437 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2235  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  54.94 
 
 		 437 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0021  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  52.24 
 
 		 417 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2323  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  54.94 
 
 		 437 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.051263  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0785  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  53.24 
 
 		 453 aa  491  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1241  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  53.14 
 
 		 454 aa  488  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1050  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  52.33 
 
 		 600 aa  487  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01134  isocitrate dehydrogenase  54.45 
 
 		 416 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2511  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  54.23 
 
 		 416 aa  482  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.173116  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01142  hypothetical protein  54.45 
 
 		 416 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1989  isocitrate dehydrogenase  54.45 
 
 		 416 aa  483  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2467  isocitrate dehydrogenase  54.45 
 
 		 416 aa  483  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1315  isocitrate dehydrogenase  54.45 
 
 		 416 aa  483  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1598  isocitrate dehydrogenase  54.66 
 
 		 416 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606037 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1256  isocitrate dehydrogenase  54.45 
 
 		 416 aa  483  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00899143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1299  isocitrate dehydrogenase  54.45 
 
 		 416 aa  483  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  51.86 
 
 		 586 aa  481  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1257  isocitrate dehydrogenase  54.3 
 
 		 422 aa  478  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2896  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  52.05 
 
 		 416 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0310087  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2245  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  51.83 
 
 		 417 aa  480  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000403811  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1625  isocitrate dehydrogenase (NADP)  53.55 
 
 		 437 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0866166  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1317  isocitrate dehydrogenase  53.36 
 
 		 416 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4011  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  52.89 
 
 		 418 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  0.120573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3616  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  52.68 
 
 		 418 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.133268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1355  isocitrate dehydrogenase  53.36 
 
 		 416 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.485597 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1946  isocitrate dehydrogenase  53.58 
 
 		 416 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1339  isocitrate dehydrogenase  53.58 
 
 		 416 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.697532  normal  0.0115036 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1872  isocitrate dehydrogenase  54.23 
 
 		 417 aa  477  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.138329  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1751  isocitrate dehydrogenase  53.61 
 
 		 422 aa  478  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.85951  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1166  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  53.88 
 
 		 420 aa  477  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1785  isocitrate dehydrogenase  53.61 
 
 		 422 aa  478  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.576701  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2128  isocitrate dehydrogenase  53.58 
 
 		 416 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573381 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0535  isocitrate dehydrogenase  56.74 
 
 		 430 aa  474  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0195794 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4724  isocitrate dehydrogenase  56.13 
 
 		 435 aa  473  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1822  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  52.68 
 
 		 418 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.083178 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4487  isocitrate dehydrogenase  56.13 
 
 		 435 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4322  isocitrate dehydrogenase  56.13 
 
 		 435 aa  472  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4334  isocitrate dehydrogenase  56.13 
 
 		 435 aa  472  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3661  isocitrate dehydrogenase  52.56 
 
 		 420 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158813 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4703  isocitrate dehydrogenase  56.52 
 
 		 430 aa  473  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4708  isocitrate dehydrogenase  56.52 
 
 		 430 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2297  isocitrate dehydrogenase  52.78 
 
 		 419 aa  473  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351069  normal  0.0198285 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4838  isocitrate dehydrogenase  56.52 
 
 		 430 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3415  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  52.89 
 
 		 418 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1562  isocitrate dehydrogenase  52.99 
 
 		 419 aa  474  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4719  isocitrate dehydrogenase  56.52 
 
 		 430 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4423  isocitrate dehydrogenase  56.74 
 
 		 430 aa  474  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2025  isocitrate dehydrogenase  53.46 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.11175 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1945  isocitrate dehydrogenase  53.9 
 
 		 417 aa  472  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1015  isocitrate dehydrogenase  51.91 
 
 		 419 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.575855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0960  isocitrate dehydrogenase  51.91 
 
 		 419 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.607193  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0486  isocitrate dehydrogenase  51.91 
 
 		 419 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0683  isocitrate dehydrogenase  51.91 
 
 		 419 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205602  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1649  isocitrate dehydrogenase  53.15 
 
 		 416 aa  471  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0964571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1108  isocitrate dehydrogenase  51.91 
 
 		 419 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000441125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3593  isocitrate dehydrogenase (NADP)  52.03 
 
 		 418 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2157  isocitrate dehydrogenase  53.68 
 
 		 417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0640579  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1615  isocitrate dehydrogenase  53.03 
 
 		 417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2895  isocitrate dehydrogenase  52.89 
 
 		 416 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.328131 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0132  isocitrate dehydrogenase  51.91 
 
 		 419 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2848  isocitrate dehydrogenase  53.03 
 
 		 417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1723  isocitrate dehydrogenase  53.03 
 
 		 417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2060  isocitrate dehydrogenase  53.25 
 
 		 417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.714189  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  50 
 
 		 589 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0956  isocitrate dehydrogenase  51.7 
 
 		 419 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0812619  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2396  isocitrate dehydrogenase (NADP)  51.92 
 
 		 418 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286181  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2549  isocitrate dehydrogenase  52.03 
 
 		 418 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0115447  hitchhiker  0.0000544039 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0878  isocitrate dehydrogenase  51.6 
 
 		 418 aa  468  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0849  isocitrate dehydrogenase  51.39 
 
 		 418 aa  467  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2756  isocitrate dehydrogenase  51.82 
 
 		 416 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0759  isocitrate dehydrogenase  51.91 
 
 		 419 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00264456  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0797  isocitrate dehydrogenase  52.58 
 
 		 418 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000273834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1908  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  51.86 
 
 		 413 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2524  isocitrate dehydrogenase  52.03 
 
 		 418 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140161  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2572  isocitrate dehydrogenase  51.71 
 
 		 419 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0647268  decreased coverage  0.00287604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>