More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1688 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_1215  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  69.85 
 
 
473 aa  696    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0313  isocitrate dehydrogenase  69.92 
 
 
475 aa  709    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0708281 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3969  isocitrate dehydrogenase  70.34 
 
 
475 aa  710    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2071  isocitrate dehydrogenase  68.01 
 
 
475 aa  696    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00869667  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4014  isocitrate dehydrogenase  70.34 
 
 
475 aa  711    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1170  isocitrate dehydrogenase  75.11 
 
 
474 aa  779    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18051  isocitrate dehydrogenase  96.2 
 
 
474 aa  946    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4831  isocitrate dehydrogenase  70.91 
 
 
473 aa  713    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0262562 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0191  isocitrate dehydrogenase  74.05 
 
 
474 aa  758    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0161  isocitrate dehydrogenase  75.53 
 
 
474 aa  773    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0700483 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1688  isocitrate dehydrogenase  100 
 
 
474 aa  980    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1719  isocitrate dehydrogenase  71.61 
 
 
475 aa  715    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17171  isocitrate dehydrogenase  77.22 
 
 
474 aa  788    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.271508  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20451  isocitrate dehydrogenase  75.32 
 
 
474 aa  782    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0071  isocitrate dehydrogenase  67.73 
 
 
472 aa  687    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17831  isocitrate dehydrogenase  90.51 
 
 
474 aa  908    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25761  isocitrate dehydrogenase  74.89 
 
 
474 aa  765    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17881  isocitrate dehydrogenase  96.62 
 
 
474 aa  949    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1950  isocitrate dehydrogenase (NADP)  55.84 
 
 
481 aa  554  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0452  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  53.14 
 
 
470 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1038  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  52.41 
 
 
465 aa  504  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000173439  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2348  isocitrate dehydrogenase  51.78 
 
 
432 aa  474  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1288  isocitrate dehydrogenase [NADP]  49.04 
 
 
428 aa  457  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1349  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.83 
 
 
427 aa  455  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0021  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.99 
 
 
417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1598  isocitrate dehydrogenase  49.25 
 
 
416 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000606037 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01134  isocitrate dehydrogenase  49.04 
 
 
416 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1562  isocitrate dehydrogenase  48.21 
 
 
419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1378  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent  49.36 
 
 
422 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1989  isocitrate dehydrogenase  49.04 
 
 
416 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2895  isocitrate dehydrogenase  50.55 
 
 
416 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.328131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1256  isocitrate dehydrogenase  49.04 
 
 
416 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00899143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1299  isocitrate dehydrogenase  49.04 
 
 
416 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01142  hypothetical protein  49.04 
 
 
416 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2467  isocitrate dehydrogenase  49.04 
 
 
416 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1315  isocitrate dehydrogenase  49.04 
 
 
416 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2511  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.83 
 
 
416 aa  444  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.173116  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1317  isocitrate dehydrogenase  48.83 
 
 
416 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2297  isocitrate dehydrogenase  48 
 
 
419 aa  445  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351069  normal  0.0198285 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1355  isocitrate dehydrogenase  48.83 
 
 
416 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.485597 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2128  isocitrate dehydrogenase  49.04 
 
 
416 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573381 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1946  isocitrate dehydrogenase  49.04 
 
 
416 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1339  isocitrate dehydrogenase  49.04 
 
 
416 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.697532  normal  0.0115036 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1649  isocitrate dehydrogenase  48.4 
 
 
416 aa  439  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0964571  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2756  isocitrate dehydrogenase  48.2 
 
 
416 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0854  isocitrate dehydrogenase (NADP)  47.67 
 
 
413 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.515822 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0782  isocitrate dehydrogenase  49.89 
 
 
423 aa  438  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2896  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.72 
 
 
416 aa  435  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0310087  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1840  isocitrate dehydrogenase  48.2 
 
 
419 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2245  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  46.19 
 
 
417 aa  437  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000403811  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3661  isocitrate dehydrogenase  48.21 
 
 
420 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.158813 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2678  isocitrate dehydrogenase  50 
 
 
424 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1264  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.67 
 
 
418 aa  438  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2572  isocitrate dehydrogenase  46.95 
 
 
419 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0647268  decreased coverage  0.00287604 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0956  isocitrate dehydrogenase  47.58 
 
 
419 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0812619  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2060  isocitrate dehydrogenase  47.87 
 
 
417 aa  432  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.714189  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2186  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.31 
 
 
437 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0486  isocitrate dehydrogenase  47.58 
 
 
419 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0683  isocitrate dehydrogenase  47.58 
 
 
419 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205602  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0849  isocitrate dehydrogenase  46.82 
 
 
418 aa  432  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0960  isocitrate dehydrogenase  47.58 
 
 
419 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.607193  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1108  isocitrate dehydrogenase  47.58 
 
 
419 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000441125  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1723  isocitrate dehydrogenase  48.72 
 
 
417 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1615  isocitrate dehydrogenase  48.72 
 
 
417 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2396  isocitrate dehydrogenase (NADP)  47.88 
 
 
418 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286181  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0797  isocitrate dehydrogenase  47.16 
 
 
418 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000273834  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1015  isocitrate dehydrogenase  47.58 
 
 
419 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.575855  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1945  isocitrate dehydrogenase  48.72 
 
 
417 aa  432  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1401  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.53 
 
 
426 aa  432  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0132  isocitrate dehydrogenase  47.58 
 
 
419 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2025  isocitrate dehydrogenase  48.72 
 
 
417 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.11175 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2649  isocitrate dehydrogenase  46.53 
 
 
419 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2848  isocitrate dehydrogenase  48.72 
 
 
417 aa  433  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.476023 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2490  isocitrate dehydrogenase  47.35 
 
 
416 aa  431  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1872  isocitrate dehydrogenase  48.3 
 
 
417 aa  431  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.138329  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0878  isocitrate dehydrogenase  46.82 
 
 
418 aa  431  1e-119  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2752  isocitrate dehydrogenase  47.56 
 
 
416 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.687266  normal  0.825547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2942  isocitrate dehydrogenase  47.88 
 
 
417 aa  430  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2349  isocitrate dehydrogenase  47.56 
 
 
416 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297968  normal  0.244469 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2157  isocitrate dehydrogenase  48.09 
 
 
417 aa  431  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0640579  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3169  isocitrate dehydrogenase  46.95 
 
 
418 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000957877  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1261  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.51 
 
 
414 aa  428  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332531  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2584  isocitrate dehydrogenase  47.03 
 
 
418 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.261253  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2468  isocitrate dehydrogenase  47.03 
 
 
417 aa  427  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240334  normal  0.106657 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1930  isocitrate dehydrogenase  47.97 
 
 
417 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0759  isocitrate dehydrogenase  46.95 
 
 
419 aa  428  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00264456  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1751  isocitrate dehydrogenase  49.89 
 
 
422 aa  427  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.85951  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1785  isocitrate dehydrogenase  49.89 
 
 
422 aa  427  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.576701  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30190  isocitrate dehydrogenase  47.03 
 
 
418 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1257  isocitrate dehydrogenase  48.71 
 
 
422 aa  423  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2235  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.2 
 
 
437 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3593  isocitrate dehydrogenase (NADP)  46.61 
 
 
418 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0565  isocitrate dehydrogenase  46.61 
 
 
418 aa  423  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000686773  decreased coverage  0.000103322 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2323  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.2 
 
 
437 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.051263  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0770  isocitrate dehydrogenase  46.74 
 
 
418 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000236369 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0378  isocitrate dehydrogenase  50 
 
 
422 aa  425  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2769  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.55 
 
 
417 aa  425  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0196883 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1822  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  46.4 
 
 
418 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.083178 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1625  isocitrate dehydrogenase (NADP)  47.46 
 
 
437 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0866166  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2761  isocitrate dehydrogenase  47.03 
 
 
417 aa  420  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0660078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>