More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_25761 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2071  isocitrate dehydrogenase  70.76 
 
 		 475 aa  714    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00869667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1170  isocitrate dehydrogenase  76.58 
 
 		 474 aa  781    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20451  isocitrate dehydrogenase  76.37 
 
 		 474 aa  780    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25761  isocitrate dehydrogenase  100 
 
 		 474 aa  981    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4831  isocitrate dehydrogenase  74.1 
 
 		 473 aa  747    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0262562 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0191  isocitrate dehydrogenase  89.03 
 
 		 474 aa  889    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0161  isocitrate dehydrogenase  90.08 
 
 		 474 aa  896    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0700483 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1688  isocitrate dehydrogenase  74.89 
 
 		 474 aa  765    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1719  isocitrate dehydrogenase  77.33 
 
 		 475 aa  762    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17881  isocitrate dehydrogenase  74.89 
 
 		 474 aa  766    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0313  isocitrate dehydrogenase  71.19 
 
 		 475 aa  724    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0708281 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17831  isocitrate dehydrogenase  73.42 
 
 		 474 aa  753    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1215  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  71.13 
 
 		 473 aa  732    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0071  isocitrate dehydrogenase  69.21 
 
 		 472 aa  705    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17171  isocitrate dehydrogenase  75.74 
 
 		 474 aa  773    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.271508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3969  isocitrate dehydrogenase  73.31 
 
 		 475 aa  742    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4014  isocitrate dehydrogenase  73.09 
 
 		 475 aa  739    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18051  isocitrate dehydrogenase  74.47 
 
 		 474 aa  762    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1950  isocitrate dehydrogenase (NADP)  57.48 
 
 		 481 aa  550  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0452  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  53.35 
 
 		 470 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1038  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  53.8 
 
 		 465 aa  513  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000173439  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2348  isocitrate dehydrogenase  51.77 
 
 		 432 aa  475  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1378  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent  50.42 
 
 		 422 aa  449  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0782  isocitrate dehydrogenase  51.71 
 
 		 423 aa  448  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2896  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.57 
 
 		 416 aa  446  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0310087  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2678  isocitrate dehydrogenase  50.64 
 
 		 424 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2186  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  51.06 
 
 		 437 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0021  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.89 
 
 		 417 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1562  isocitrate dehydrogenase  49.69 
 
 		 419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2511  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.63 
 
 		 416 aa  442  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.173116  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1257  isocitrate dehydrogenase  51.11 
 
 		 422 aa  442  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2025  isocitrate dehydrogenase  49.16 
 
 		 417 aa  442  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.11175 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1785  isocitrate dehydrogenase  51.98 
 
 		 422 aa  443  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.576701  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1315  isocitrate dehydrogenase  48.63 
 
 		 416 aa  442  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1598  isocitrate dehydrogenase  48.63 
 
 		 416 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606037 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1751  isocitrate dehydrogenase  51.98 
 
 		 422 aa  443  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.85951  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1256  isocitrate dehydrogenase  48.63 
 
 		 416 aa  442  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00899143  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2467  isocitrate dehydrogenase  48.63 
 
 		 416 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2297  isocitrate dehydrogenase  49.48 
 
 		 419 aa  445  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351069  normal  0.0198285 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01134  isocitrate dehydrogenase  48.41 
 
 		 416 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2128  isocitrate dehydrogenase  48.84 
 
 		 416 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573381 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1840  isocitrate dehydrogenase  49.15 
 
 		 419 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2245  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  47.03 
 
 		 417 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000403811  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1989  isocitrate dehydrogenase  48.41 
 
 		 416 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1355  isocitrate dehydrogenase  49.05 
 
 		 416 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.485597 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1946  isocitrate dehydrogenase  48.84 
 
 		 416 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1339  isocitrate dehydrogenase  48.84 
 
 		 416 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.697532  normal  0.0115036 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01142  hypothetical protein  48.41 
 
 		 416 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1299  isocitrate dehydrogenase  48.41 
 
 		 416 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0378  isocitrate dehydrogenase  51.07 
 
 		 422 aa  440  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1317  isocitrate dehydrogenase  49.05 
 
 		 416 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2848  isocitrate dehydrogenase  48.73 
 
 		 417 aa  436  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476023 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2235  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.68 
 
 		 437 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2756  isocitrate dehydrogenase  50.22 
 
 		 416 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2649  isocitrate dehydrogenase  48.01 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1930  isocitrate dehydrogenase  49.04 
 
 		 417 aa  436  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1723  isocitrate dehydrogenase  48.73 
 
 		 417 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1615  isocitrate dehydrogenase  48.73 
 
 		 417 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2323  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.68 
 
 		 437 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.051263  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0878  isocitrate dehydrogenase  47.05 
 
 		 418 aa  433  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0849  isocitrate dehydrogenase  47.05 
 
 		 418 aa  433  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1625  isocitrate dehydrogenase (NADP)  50.11 
 
 		 437 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0866166  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2060  isocitrate dehydrogenase  47.89 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.714189  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2572  isocitrate dehydrogenase  47.58 
 
 		 419 aa  433  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0647268  decreased coverage  0.00287604 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3277  isocitrate dehydrogenase  51.72 
 
 		 430 aa  431  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2349  isocitrate dehydrogenase  49.56 
 
 		 416 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297968  normal  0.244469 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2752  isocitrate dehydrogenase  49.56 
 
 		 416 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.687266  normal  0.825547 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4703  isocitrate dehydrogenase  51.5 
 
 		 430 aa  428  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4423  isocitrate dehydrogenase  51.07 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2490  isocitrate dehydrogenase  49.56 
 
 		 416 aa  428  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4724  isocitrate dehydrogenase  51.5 
 
 		 435 aa  428  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4487  isocitrate dehydrogenase  51.5 
 
 		 435 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4322  isocitrate dehydrogenase  51.5 
 
 		 435 aa  428  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4334  isocitrate dehydrogenase  51.5 
 
 		 435 aa  428  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4708  isocitrate dehydrogenase  51.5 
 
 		 430 aa  428  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166005 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1401  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.37 
 
 		 426 aa  428  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2769  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.83 
 
 		 417 aa  428  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0196883 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4838  isocitrate dehydrogenase  51.5 
 
 		 430 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4719  isocitrate dehydrogenase  51.5 
 
 		 430 aa  428  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0797  isocitrate dehydrogenase  48.68 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000273834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0535  isocitrate dehydrogenase  51.29 
 
 		 430 aa  427  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0195794 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0486  isocitrate dehydrogenase  48.89 
 
 		 419 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0132  isocitrate dehydrogenase  48.89 
 
 		 419 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1108  isocitrate dehydrogenase  48.89 
 
 		 419 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000441125  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0565  isocitrate dehydrogenase  47.48 
 
 		 418 aa  425  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000686773  decreased coverage  0.000103322 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1015  isocitrate dehydrogenase  48.89 
 
 		 419 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.575855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0956  isocitrate dehydrogenase  48.89 
 
 		 419 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0812619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6591  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.03 
 
 		 421 aa  422  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102471  normal  0.856757 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0960  isocitrate dehydrogenase  48.89 
 
 		 419 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.607193  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3169  isocitrate dehydrogenase  48.02 
 
 		 418 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000957877  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0683  isocitrate dehydrogenase  48.89 
 
 		 419 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205602  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0424  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.82 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0586  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.82 
 
 		 430 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0770  isocitrate dehydrogenase  48.23 
 
 		 418 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000236369 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3119  isocitrate dehydrogenase (NADP)  47.87 
 
 		 413 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0785  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.76 
 
 		 453 aa  418  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1505  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent  47.48 
 
 		 424 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0469387 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3896  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  49.22 
 
 		 411 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1241  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.13 
 
 		 454 aa  413  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1684  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  48.29 
 
 		 425 aa  414  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22491  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>