More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0452 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1038  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  68.58 
 
 		 465 aa  687    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000173439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0452  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  100 
 
 		 470 aa  969    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173819  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1950  isocitrate dehydrogenase (NADP)  60.04 
 
 		 481 aa  588  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0378  isocitrate dehydrogenase  63.71 
 
 		 422 aa  578  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0782  isocitrate dehydrogenase  62.91 
 
 		 423 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2348  isocitrate dehydrogenase  62.91 
 
 		 432 aa  574  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2678  isocitrate dehydrogenase  62.63 
 
 		 424 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1401  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.55 
 
 		 426 aa  555  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4724  isocitrate dehydrogenase  62.37 
 
 		 435 aa  553  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4487  isocitrate dehydrogenase  62.37 
 
 		 435 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4322  isocitrate dehydrogenase  62.37 
 
 		 435 aa  553  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4334  isocitrate dehydrogenase  62.37 
 
 		 435 aa  553  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3277  isocitrate dehydrogenase  62.83 
 
 		 430 aa  552  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1785  isocitrate dehydrogenase  60 
 
 		 422 aa  551  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.576701  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2186  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.3 
 
 		 437 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4703  isocitrate dehydrogenase  62.83 
 
 		 430 aa  550  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4838  isocitrate dehydrogenase  62.83 
 
 		 430 aa  550  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1751  isocitrate dehydrogenase  60 
 
 		 422 aa  551  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.85951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4708  isocitrate dehydrogenase  62.83 
 
 		 430 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166005 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4719  isocitrate dehydrogenase  62.83 
 
 		 430 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4423  isocitrate dehydrogenase  62.39 
 
 		 430 aa  547  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0535  isocitrate dehydrogenase  62.39 
 
 		 430 aa  546  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0195794 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1257  isocitrate dehydrogenase  59.26 
 
 		 422 aa  544  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0785  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  58.33 
 
 		 453 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2323  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.87 
 
 		 437 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.051263  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1166  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  58.89 
 
 		 420 aa  540  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2235  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.87 
 
 		 437 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1241  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  57.93 
 
 		 454 aa  537  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4831  isocitrate dehydrogenase  55.02 
 
 		 473 aa  532  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0262562 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1719  isocitrate dehydrogenase  57.65 
 
 		 475 aa  531  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2071  isocitrate dehydrogenase  56.3 
 
 		 475 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00869667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0161  isocitrate dehydrogenase  54.62 
 
 		 474 aa  528  1e-149  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0700483 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1625  isocitrate dehydrogenase (NADP)  58.69 
 
 		 437 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0866166  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6591  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  57.39 
 
 		 421 aa  528  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102471  normal  0.856757 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4014  isocitrate dehydrogenase  54.49 
 
 		 475 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1170  isocitrate dehydrogenase  52.94 
 
 		 474 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3969  isocitrate dehydrogenase  54.28 
 
 		 475 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20451  isocitrate dehydrogenase  52.94 
 
 		 474 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1215  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  54.01 
 
 		 473 aa  524  1e-147  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0191  isocitrate dehydrogenase  53.36 
 
 		 474 aa  523  1e-147  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2396  isocitrate dehydrogenase (NADP)  57.11 
 
 		 418 aa  521  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286181  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18051  isocitrate dehydrogenase  52.41 
 
 		 474 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17881  isocitrate dehydrogenase  52.2 
 
 		 474 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0854  isocitrate dehydrogenase (NADP)  55.2 
 
 		 413 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.515822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3593  isocitrate dehydrogenase (NADP)  56.48 
 
 		 418 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1688  isocitrate dehydrogenase  53.14 
 
 		 474 aa  518  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2245  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  55.65 
 
 		 417 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000403811  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0313  isocitrate dehydrogenase  55.08 
 
 		 475 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0708281 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17831  isocitrate dehydrogenase  52.29 
 
 		 474 aa  518  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30190  isocitrate dehydrogenase  56.26 
 
 		 418 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17171  isocitrate dehydrogenase  52.25 
 
 		 474 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.271508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25761  isocitrate dehydrogenase  53.35 
 
 		 474 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2584  isocitrate dehydrogenase  56.05 
 
 		 418 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.261253  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4011  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  56.26 
 
 		 418 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  0.120573 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1684  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  56.51 
 
 		 425 aa  514  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1822  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  56.26 
 
 		 418 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.083178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3616  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  56.26 
 
 		 418 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.133268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1723  isocitrate dehydrogenase  57.3 
 
 		 417 aa  511  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01134  isocitrate dehydrogenase  56.87 
 
 		 416 aa  510  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2511  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  56.65 
 
 		 416 aa  508  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.173116  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01142  hypothetical protein  56.87 
 
 		 416 aa  510  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2756  isocitrate dehydrogenase  55.34 
 
 		 416 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2025  isocitrate dehydrogenase  56.44 
 
 		 417 aa  511  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.11175 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1989  isocitrate dehydrogenase  56.87 
 
 		 416 aa  510  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1315  isocitrate dehydrogenase  56.65 
 
 		 416 aa  508  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1945  isocitrate dehydrogenase  57.3 
 
 		 417 aa  510  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2848  isocitrate dehydrogenase  57.3 
 
 		 417 aa  511  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3415  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  55.84 
 
 		 418 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2157  isocitrate dehydrogenase  56.87 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0640579  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1256  isocitrate dehydrogenase  56.65 
 
 		 416 aa  508  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00899143  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1598  isocitrate dehydrogenase  56.65 
 
 		 416 aa  509  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606037 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2895  isocitrate dehydrogenase  55.56 
 
 		 416 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.328131 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1615  isocitrate dehydrogenase  57.3 
 
 		 417 aa  511  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2467  isocitrate dehydrogenase  56.65 
 
 		 416 aa  508  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0071  isocitrate dehydrogenase  53.64 
 
 		 472 aa  510  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1872  isocitrate dehydrogenase  56.87 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.138329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1299  isocitrate dehydrogenase  56.87 
 
 		 416 aa  510  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2443  isocitrate dehydrogenase  55.63 
 
 		 418 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000919661 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2549  isocitrate dehydrogenase  55.63 
 
 		 418 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0115447  hitchhiker  0.0000544039 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1562  isocitrate dehydrogenase  55.11 
 
 		 419 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0849  isocitrate dehydrogenase  55.63 
 
 		 418 aa  505  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1946  isocitrate dehydrogenase  56.65 
 
 		 416 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2297  isocitrate dehydrogenase  55.32 
 
 		 419 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351069  normal  0.0198285 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5856  isocitrate dehydrogenase  55.63 
 
 		 418 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261017  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1505  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent  55.46 
 
 		 424 aa  507  9.999999999999999e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0469387 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1913  isocitrate dehydrogenase  55.63 
 
 		 418 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2572  isocitrate dehydrogenase  55.63 
 
 		 418 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2524  isocitrate dehydrogenase  55.63 
 
 		 418 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140161  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0565  isocitrate dehydrogenase  55.2 
 
 		 418 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000686773  decreased coverage  0.000103322 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1015  isocitrate dehydrogenase  54.14 
 
 		 419 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.575855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0132  isocitrate dehydrogenase  54.14 
 
 		 419 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2060  isocitrate dehydrogenase  56.65 
 
 		 417 aa  504  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.714189  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0878  isocitrate dehydrogenase  55.63 
 
 		 418 aa  504  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1649  isocitrate dehydrogenase  56.01 
 
 		 416 aa  501  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0964571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0759  isocitrate dehydrogenase  54.56 
 
 		 419 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00264456  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0683  isocitrate dehydrogenase  54.14 
 
 		 419 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205602  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1339  isocitrate dehydrogenase  56.44 
 
 		 416 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.697532  normal  0.0115036 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1840  isocitrate dehydrogenase  54.35 
 
 		 419 aa  504  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2942  isocitrate dehydrogenase  54.37 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1930  isocitrate dehydrogenase  54.58 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>