More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1908 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1908  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  100 
 
 		 413 aa  848    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3896  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  66.58 
 
 		 411 aa  551  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2678  isocitrate dehydrogenase  60.61 
 
 		 424 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0782  isocitrate dehydrogenase  61.32 
 
 		 423 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0021  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  61.93 
 
 		 417 aa  511  1e-144  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1401  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  62.53 
 
 		 426 aa  508  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2348  isocitrate dehydrogenase  60.29 
 
 		 432 aa  504  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  58.62 
 
 		 589 aa  503  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1840  isocitrate dehydrogenase  60.53 
 
 		 419 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0378  isocitrate dehydrogenase  59.41 
 
 		 422 aa  495  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1257  isocitrate dehydrogenase  57.38 
 
 		 422 aa  492  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4487  isocitrate dehydrogenase  59.43 
 
 		 435 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4322  isocitrate dehydrogenase  59.43 
 
 		 435 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4334  isocitrate dehydrogenase  59.43 
 
 		 435 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4703  isocitrate dehydrogenase  59.67 
 
 		 430 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0854  isocitrate dehydrogenase (NADP)  60.93 
 
 		 413 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.515822 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4838  isocitrate dehydrogenase  59.67 
 
 		 430 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0535  isocitrate dehydrogenase  59.43 
 
 		 430 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0195794 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4708  isocitrate dehydrogenase  59.67 
 
 		 430 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166005 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  58.91 
 
 		 586 aa  494  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3277  isocitrate dehydrogenase  59.67 
 
 		 430 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4719  isocitrate dehydrogenase  59.67 
 
 		 430 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2467  isocitrate dehydrogenase  61.46 
 
 		 416 aa  489  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4724  isocitrate dehydrogenase  59.2 
 
 		 435 aa  490  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1256  isocitrate dehydrogenase  61.46 
 
 		 416 aa  489  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00899143  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1751  isocitrate dehydrogenase  56.9 
 
 		 422 aa  488  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.85951  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1315  isocitrate dehydrogenase  61.46 
 
 		 416 aa  489  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1785  isocitrate dehydrogenase  56.9 
 
 		 422 aa  488  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.576701  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4423  isocitrate dehydrogenase  59.2 
 
 		 430 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01134  isocitrate dehydrogenase  60.98 
 
 		 416 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2511  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  60.98 
 
 		 416 aa  486  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.173116  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2025  isocitrate dehydrogenase  60.24 
 
 		 417 aa  484  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.11175 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01142  hypothetical protein  60.98 
 
 		 416 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2756  isocitrate dehydrogenase  59.21 
 
 		 416 aa  484  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1989  isocitrate dehydrogenase  60.98 
 
 		 416 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1598  isocitrate dehydrogenase  60.98 
 
 		 416 aa  486  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000606037 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1299  isocitrate dehydrogenase  60.98 
 
 		 416 aa  486  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1945  isocitrate dehydrogenase  60 
 
 		 417 aa  482  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2157  isocitrate dehydrogenase  60.69 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0640579  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2060  isocitrate dehydrogenase  59.76 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.714189  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1615  isocitrate dehydrogenase  60.24 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1723  isocitrate dehydrogenase  60.24 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2323  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  57.62 
 
 		 437 aa  481  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.051263  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2848  isocitrate dehydrogenase  60.24 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476023 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1872  isocitrate dehydrogenase  60.69 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.138329  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2235  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  57.62 
 
 		 437 aa  481  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1339  isocitrate dehydrogenase  61.04 
 
 		 416 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.697532  normal  0.0115036 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2128  isocitrate dehydrogenase  61.04 
 
 		 416 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573381 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1355  isocitrate dehydrogenase  60.79 
 
 		 416 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.485597 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1946  isocitrate dehydrogenase  60.79 
 
 		 416 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1317  isocitrate dehydrogenase  60.79 
 
 		 416 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2245  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  57.56 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000403811  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2942  isocitrate dehydrogenase  58.78 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0797  isocitrate dehydrogenase  59.36 
 
 		 418 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000273834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3661  isocitrate dehydrogenase  60 
 
 		 420 aa  475  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158813 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2396  isocitrate dehydrogenase (NADP)  58.54 
 
 		 418 aa  477  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286181  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2895  isocitrate dehydrogenase  58.48 
 
 		 416 aa  477  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.328131 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1684  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.28 
 
 		 425 aa  475  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1930  isocitrate dehydrogenase  58.72 
 
 		 417 aa  474  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2186  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  55.61 
 
 		 437 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1649  isocitrate dehydrogenase  59.27 
 
 		 416 aa  473  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0964571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2297  isocitrate dehydrogenase  58.55 
 
 		 419 aa  473  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351069  normal  0.0198285 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1378  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent  57.42 
 
 		 422 aa  474  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3476  isocitrate dehydrogenase (NADP)  59.63 
 
 		 382 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.99614  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1625  isocitrate dehydrogenase (NADP)  56.8 
 
 		 437 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0866166  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0785  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  55.84 
 
 		 453 aa  473  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2584  isocitrate dehydrogenase  58.54 
 
 		 418 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.261253  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1562  isocitrate dehydrogenase  58.8 
 
 		 419 aa  474  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3616  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  58.62 
 
 		 418 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.133268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1166  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  58.74 
 
 		 420 aa  472  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30190  isocitrate dehydrogenase  58.54 
 
 		 418 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1288  isocitrate dehydrogenase [NADP]  58.72 
 
 		 428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3169  isocitrate dehydrogenase  58.37 
 
 		 418 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000957877  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4011  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  58.13 
 
 		 418 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  0.120573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2649  isocitrate dehydrogenase  57.32 
 
 		 419 aa  471  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0486  isocitrate dehydrogenase  58.37 
 
 		 419 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0132  isocitrate dehydrogenase  58.37 
 
 		 419 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0956  isocitrate dehydrogenase  58.23 
 
 		 419 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0812619  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1050  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  54.59 
 
 		 600 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1108  isocitrate dehydrogenase  58.37 
 
 		 419 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000441125  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2468  isocitrate dehydrogenase  57.32 
 
 		 417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240334  normal  0.106657 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0960  isocitrate dehydrogenase  58.37 
 
 		 419 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.607193  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0770  isocitrate dehydrogenase  58.87 
 
 		 418 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000236369 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1015  isocitrate dehydrogenase  58.37 
 
 		 419 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.575855  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1822  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  58.13 
 
 		 418 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.083178 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0565  isocitrate dehydrogenase  57.07 
 
 		 418 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000686773  decreased coverage  0.000103322 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0683  isocitrate dehydrogenase  58.37 
 
 		 419 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205602  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2572  isocitrate dehydrogenase  58.15 
 
 		 419 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0647268  decreased coverage  0.00287604 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1349  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  58.48 
 
 		 427 aa  467  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3415  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  57.64 
 
 		 418 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2490  isocitrate dehydrogenase  57.25 
 
 		 416 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1739  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  58.7 
 
 		 382 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0759  isocitrate dehydrogenase  57.99 
 
 		 419 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00264456  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2761  isocitrate dehydrogenase  58.23 
 
 		 417 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0660078  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1950  isocitrate dehydrogenase (NADP)  51.86 
 
 		 481 aa  467  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1264  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  56.51 
 
 		 418 aa  465  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1241  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  55.14 
 
 		 454 aa  467  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2464  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  60 
 
 		 380 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2769  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  59.35 
 
 		 417 aa  463  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0196883 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2752  isocitrate dehydrogenase  57 
 
 		 416 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.687266  normal  0.825547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>