More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1453 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1453  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
246 aa  504  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  69.92 
 
 
361 aa  353  2e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  65.45 
 
 
359 aa  347  1e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  64.63 
 
 
359 aa  343  1e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  65.04 
 
 
359 aa  343  2e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  60.16 
 
 
335 aa  301  5.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  58.94 
 
 
334 aa  291  6e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0079  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  54.58 
 
 
389 aa  289  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  57.55 
 
 
364 aa  289  3e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  58.94 
 
 
336 aa  283  1.0000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  60.16 
 
 
336 aa  283  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.02 
 
 
331 aa  281  5.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  52.85 
 
 
361 aa  270  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  52.05 
 
 
340 aa  261  8e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  55.24 
 
 
336 aa  259  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  50.82 
 
 
331 aa  252  3e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  50 
 
 
334 aa  250  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  52.26 
 
 
348 aa  247  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  49.18 
 
 
333 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  49.19 
 
 
334 aa  239  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  48.78 
 
 
338 aa  237  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  47.77 
 
 
348 aa  237  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  48.99 
 
 
335 aa  237  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  48.79 
 
 
335 aa  236  3e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1101  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  47.52 
 
 
344 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  48.39 
 
 
335 aa  234  8e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  45.93 
 
 
335 aa  227  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  45.12 
 
 
335 aa  222  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  44.53 
 
 
335 aa  218  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  43.32 
 
 
335 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  43.32 
 
 
336 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  43.32 
 
 
336 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  43.32 
 
 
336 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  43.55 
 
 
336 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  43.6 
 
 
336 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  44.72 
 
 
335 aa  211  5.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  44.94 
 
 
335 aa  211  7e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  44.94 
 
 
335 aa  211  7e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  43.55 
 
 
336 aa  211  7e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  44.94 
 
 
335 aa  211  7e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  44.94 
 
 
335 aa  211  7e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  43.15 
 
 
336 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  42.98 
 
 
336 aa  211  9e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  43.95 
 
 
335 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  42.91 
 
 
335 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  42.51 
 
 
335 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  49.39 
 
 
345 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  41.87 
 
 
385 aa  205  6e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0021  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  43.43 
 
 
417 aa  204  9e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0444  isocitrate dehydrogenase  45.9 
 
 
478 aa  201  7e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1134  isocitrate dehydrogenase  45.49 
 
 
481 aa  201  8e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.404972 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  47.35 
 
 
342 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2190  isocitrate dehydrogenase  45.53 
 
 
485 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04610  isocitrate dehydrogenase, putative  40.65 
 
 
379 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.673993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1557  isocitrate dehydrogenase  45.08 
 
 
480 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0665  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  45.04 
 
 
344 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3335  isocitrate dehydrogenase  46.72 
 
 
482 aa  195  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91057  isocitrate dehydrogenase  41.98 
 
 
362 aa  194  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.433771 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2029  isocitrate dehydrogenase  43.27 
 
 
487 aa  192  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2330  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  42.65 
 
 
420 aa  192  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.827266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1295  isocitrate dehydrogenase  44.67 
 
 
480 aa  192  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0769313  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0101  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  39.93 
 
 
380 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42313  mitochondrial isocitrate dehydrogenase (NAD+) subunit 2  41.2 
 
 
367 aa  190  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00286555  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1985  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  38.75 
 
 
385 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865956  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4313  isocitrate dehydrogenase  45.31 
 
 
456 aa  189  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0560117 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2939  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  41.18 
 
 
434 aa  188  5.999999999999999e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0782  isocitrate dehydrogenase  46.32 
 
 
423 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0547  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  40.79 
 
 
425 aa  187  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05790  isocitrate dehydrogenase subunit 1, mitochondrial precursor (Broad)  41.46 
 
 
439 aa  187  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.420111 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1401  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  42.28 
 
 
426 aa  186  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1166  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  40.22 
 
 
420 aa  186  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0579  isocitrate dehydrogenase (NADP)  41.7 
 
 
438 aa  186  3e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0281  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  41.09 
 
 
425 aa  185  5e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.398355  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1257  isocitrate dehydrogenase  43.29 
 
 
422 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1739  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  39.48 
 
 
382 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02060  isocitrate dehydrogenase (NAD+), putative  40.96 
 
 
378 aa  183  3e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0378  isocitrate dehydrogenase  43.72 
 
 
422 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3896  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  39.93 
 
 
411 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1842  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  40.81 
 
 
439 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.282265 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1984  isocitrate dehydrogenase  43.44 
 
 
483 aa  181  7e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.569508  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0439  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  39.47 
 
 
386 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.364858  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1880  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  39.48 
 
 
415 aa  181  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2411  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  44.9 
 
 
345 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2678  isocitrate dehydrogenase  45.02 
 
 
424 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2464  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  39.78 
 
 
380 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4724  isocitrate dehydrogenase  45.02 
 
 
435 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3476  isocitrate dehydrogenase (NADP)  39.48 
 
 
382 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.99614  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1684  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  40.58 
 
 
425 aa  180  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22491  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1751  isocitrate dehydrogenase  42.68 
 
 
422 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.85951  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1785  isocitrate dehydrogenase  42.68 
 
 
422 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.576701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4719  isocitrate dehydrogenase  45.02 
 
 
430 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4838  isocitrate dehydrogenase  45.02 
 
 
430 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4703  isocitrate dehydrogenase  45.02 
 
 
430 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4250  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  45.49 
 
 
343 aa  179  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4708  isocitrate dehydrogenase  45.02 
 
 
430 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166005 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4487  isocitrate dehydrogenase  45.02 
 
 
435 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4322  isocitrate dehydrogenase  45.02 
 
 
435 aa  179  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4334  isocitrate dehydrogenase  45.02 
 
 
435 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2380  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  44.67 
 
 
344 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3277  isocitrate dehydrogenase  44.59 
 
 
430 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>