More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0427 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  96.38 
 
 
359 aa  714    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  100 
 
 
359 aa  733    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  96.1 
 
 
359 aa  713    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  67.69 
 
 
361 aa  508  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  59.61 
 
 
335 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0079  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  55.81 
 
 
389 aa  414  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  55.43 
 
 
334 aa  412  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  57.66 
 
 
336 aa  411  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  55.87 
 
 
336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  57.02 
 
 
361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  56.7 
 
 
364 aa  403  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  52.22 
 
 
336 aa  363  3e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  52.55 
 
 
331 aa  360  2e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.8 
 
 
331 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  49.72 
 
 
340 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  50 
 
 
334 aa  347  3e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  51.36 
 
 
333 aa  345  5e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1453  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  65.04 
 
 
246 aa  343  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  48.46 
 
 
348 aa  342  8e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  48.21 
 
 
335 aa  325  7e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  48.21 
 
 
335 aa  325  8.000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  48.49 
 
 
348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3896  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.71 
 
 
411 aa  320  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  48.51 
 
 
335 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0021  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  45.45 
 
 
417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  43.18 
 
 
335 aa  310  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  46.87 
 
 
334 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  43.45 
 
 
335 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  44.1 
 
 
335 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  44.1 
 
 
335 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  45.24 
 
 
336 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  45.24 
 
 
336 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  45.24 
 
 
336 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  45.24 
 
 
336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  42.9 
 
 
385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  42.64 
 
 
586 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2939  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  43.52 
 
 
434 aa  303  4.0000000000000003e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  42.9 
 
 
335 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  44.38 
 
 
336 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  44.35 
 
 
336 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1257  isocitrate dehydrogenase  43.67 
 
 
422 aa  301  1e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  44.44 
 
 
336 aa  301  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  44.94 
 
 
335 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  44.94 
 
 
335 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  44.94 
 
 
335 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  44.94 
 
 
335 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  43.82 
 
 
335 aa  300  3e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  42.38 
 
 
589 aa  297  1e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  44.44 
 
 
335 aa  297  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1785  isocitrate dehydrogenase  43.18 
 
 
422 aa  296  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.576701  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1751  isocitrate dehydrogenase  43.18 
 
 
422 aa  296  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.85951  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  48.35 
 
 
342 aa  295  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  43.73 
 
 
338 aa  293  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  45.54 
 
 
336 aa  291  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0782  isocitrate dehydrogenase  42.54 
 
 
423 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0378  isocitrate dehydrogenase  42.54 
 
 
422 aa  290  3e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1261  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  42.42 
 
 
414 aa  288  8e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332531  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1881  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  42.89 
 
 
407 aa  287  2e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.328566  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1401  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  43.67 
 
 
426 aa  287  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1649  isocitrate dehydrogenase  43 
 
 
416 aa  286  5e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0964571  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  47.04 
 
 
345 aa  286  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2330  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  42.34 
 
 
420 aa  285  5.999999999999999e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.827266 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04610  isocitrate dehydrogenase, putative  42.46 
 
 
379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.673993  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1908  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  40.93 
 
 
413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1506  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  41.9 
 
 
425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0579  isocitrate dehydrogenase (NADP)  42.71 
 
 
438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1288  isocitrate dehydrogenase [NADP]  43.01 
 
 
428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2396  isocitrate dehydrogenase (NADP)  42.42 
 
 
418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286181  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3119  isocitrate dehydrogenase (NADP)  41.65 
 
 
413 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0547  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  42.89 
 
 
425 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2584  isocitrate dehydrogenase  42.42 
 
 
418 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.261253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30190  isocitrate dehydrogenase  42.42 
 
 
418 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0281  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  42.16 
 
 
425 aa  282  6.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.398355  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1339  isocitrate dehydrogenase  42.16 
 
 
416 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.697532  normal  0.0115036 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2128  isocitrate dehydrogenase  42.16 
 
 
416 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573381 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2678  isocitrate dehydrogenase  41.28 
 
 
424 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1349  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  42.75 
 
 
427 aa  281  9e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1317  isocitrate dehydrogenase  42.16 
 
 
416 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1355  isocitrate dehydrogenase  42.16 
 
 
416 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.485597 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1946  isocitrate dehydrogenase  41.9 
 
 
416 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3335  isocitrate dehydrogenase  43.54 
 
 
482 aa  279  5e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.743871 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01134  isocitrate dehydrogenase  41.9 
 
 
416 aa  279  6e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3593  isocitrate dehydrogenase (NADP)  41.9 
 
 
418 aa  279  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1989  isocitrate dehydrogenase  41.9 
 
 
416 aa  279  6e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1299  isocitrate dehydrogenase  41.9 
 
 
416 aa  279  6e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01142  hypothetical protein  41.9 
 
 
416 aa  279  6e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1872  isocitrate dehydrogenase  42.16 
 
 
417 aa  279  6e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.138329  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2060  isocitrate dehydrogenase  41.9 
 
 
417 aa  279  7e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.714189  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2348  isocitrate dehydrogenase  40.8 
 
 
432 aa  278  8e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1598  isocitrate dehydrogenase  41.9 
 
 
416 aa  278  9e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000606037 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2511  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  41.9 
 
 
416 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.173116  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0854  isocitrate dehydrogenase (NADP)  42.27 
 
 
413 aa  278  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.515822 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2157  isocitrate dehydrogenase  41.65 
 
 
417 aa  278  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0640579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2025  isocitrate dehydrogenase  41.39 
 
 
417 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.11175 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1985  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  38.8 
 
 
385 aa  278  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865956  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2848  isocitrate dehydrogenase  41.48 
 
 
417 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.476023 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1945  isocitrate dehydrogenase  41.39 
 
 
417 aa  278  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1723  isocitrate dehydrogenase  41.48 
 
 
417 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1615  isocitrate dehydrogenase  41.48 
 
 
417 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1256  isocitrate dehydrogenase  41.65 
 
 
416 aa  277  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00899143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>