More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA04610 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA04610  isocitrate dehydrogenase, putative  100 
 
 
379 aa  772    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.673993  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  67.9 
 
 
385 aa  531  1e-149  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42313  mitochondrial isocitrate dehydrogenase (NAD+) subunit 2  68.13 
 
 
367 aa  479  1e-134  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00286555  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  54.22 
 
 
331 aa  360  2e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  49.1 
 
 
335 aa  351  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.87 
 
 
331 aa  348  6e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  47.89 
 
 
348 aa  342  5e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  48.35 
 
 
336 aa  337  9.999999999999999e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  48.19 
 
 
334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05790  isocitrate dehydrogenase subunit 1, mitochondrial precursor (Broad)  45.17 
 
 
439 aa  332  6e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.420111 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  51.2 
 
 
348 aa  331  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  46.71 
 
 
335 aa  325  6e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  46.99 
 
 
336 aa  325  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  47.31 
 
 
336 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  47.31 
 
 
336 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  49.55 
 
 
333 aa  324  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  47.31 
 
 
336 aa  324  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  46.71 
 
 
336 aa  323  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  45.96 
 
 
361 aa  323  3e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  47.01 
 
 
335 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  47.01 
 
 
335 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  46.41 
 
 
335 aa  323  4e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  47.01 
 
 
335 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  47.01 
 
 
335 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  46.71 
 
 
336 aa  322  6e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  49.1 
 
 
334 aa  321  9.999999999999999e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  47.49 
 
 
340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  46.11 
 
 
335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  46.71 
 
 
336 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  46.71 
 
 
335 aa  317  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  46.43 
 
 
335 aa  317  3e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  45.95 
 
 
336 aa  316  4e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91057  isocitrate dehydrogenase  46.26 
 
 
362 aa  315  6e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.433771 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  46.71 
 
 
336 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  46.08 
 
 
335 aa  311  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  47.01 
 
 
336 aa  309  5e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02060  isocitrate dehydrogenase (NAD+), putative  43.41 
 
 
378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  44.88 
 
 
335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  44.17 
 
 
364 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  42.34 
 
 
359 aa  300  2e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  42.62 
 
 
359 aa  300  2e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  46.87 
 
 
335 aa  300  3e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2029  isocitrate dehydrogenase  45.54 
 
 
487 aa  299  4e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  46.87 
 
 
335 aa  299  4e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  42.46 
 
 
359 aa  298  7e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  47.46 
 
 
335 aa  298  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  44.58 
 
 
335 aa  294  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  47.66 
 
 
342 aa  293  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  46.39 
 
 
334 aa  290  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.21 
 
 
361 aa  288  8e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  45.99 
 
 
345 aa  276  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0079  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  39.85 
 
 
389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3335  isocitrate dehydrogenase  42.9 
 
 
482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2190  isocitrate dehydrogenase  42.52 
 
 
485 aa  272  9e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  45.24 
 
 
338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0444  isocitrate dehydrogenase  42.94 
 
 
478 aa  269  8e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4313  isocitrate dehydrogenase  41.72 
 
 
456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0560117 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1101  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  47.79 
 
 
344 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1295  isocitrate dehydrogenase  41.54 
 
 
480 aa  265  8.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0769313  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1557  isocitrate dehydrogenase  43.92 
 
 
480 aa  264  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1134  isocitrate dehydrogenase  41.54 
 
 
481 aa  263  4e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.404972 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0890  isocitrate dehydrogenase  43.2 
 
 
482 aa  259  4e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1114  isocitrate dehydrogenase  44.81 
 
 
482 aa  258  1e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0665  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  44.05 
 
 
344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0791  isocitrate dehydrogenase  42.01 
 
 
472 aa  251  2e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4079  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.92 
 
 
343 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1984  isocitrate dehydrogenase  43.35 
 
 
483 aa  250  3e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.569508  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.73 
 
 
334 aa  245  6.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0172  isocitrate dehydrogenase  42.14 
 
 
471 aa  241  1e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2411  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  43.79 
 
 
345 aa  239  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2380  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  43.62 
 
 
344 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.88 
 
 
336 aa  236  4e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.39 
 
 
333 aa  236  7e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4250  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.03 
 
 
343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  38.23 
 
 
330 aa  233  3e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  38.23 
 
 
330 aa  232  1e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.58 
 
 
326 aa  231  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  35.82 
 
 
337 aa  231  2e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  38.23 
 
 
330 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  38.1 
 
 
331 aa  225  8e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  39.53 
 
 
336 aa  223  4e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  40.18 
 
 
323 aa  223  4e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  36.2 
 
 
330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1073  isocitrate dehydrogenase (NADP)  37.43 
 
 
337 aa  220  3e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.606358  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  37.72 
 
 
335 aa  219  7.999999999999999e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.14 
 
 
331 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  38.55 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  38.17 
 
 
339 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  38.17 
 
 
339 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  37.87 
 
 
339 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  37.91 
 
 
337 aa  210  3e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.8 
 
 
335 aa  209  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0547  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  35.7 
 
 
425 aa  206  6e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0549  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  36.49 
 
 
375 aa  206  8e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.229929  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  36.65 
 
 
377 aa  205  9e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.96 
 
 
360 aa  203  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_006686  CND03850  isocitrate dehydrogenase, putative  36.89 
 
 
370 aa  203  5e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0623  isocitrate dehydrogenase (NADP)  35.2 
 
 
342 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.91 
 
 
332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1379  isocitrate dehydrogenase  36.34 
 
 
343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>