More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1781 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  100 
 
 
336 aa  682    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  73.41 
 
 
336 aa  511  1e-144  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  52.98 
 
 
335 aa  346  4e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  49.4 
 
 
337 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2064  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.71 
 
 
325 aa  318  9e-86  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0833  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.3 
 
 
325 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1605  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.4 
 
 
325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1815  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.79 
 
 
325 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000286516 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.15 
 
 
335 aa  276  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  44.02 
 
 
334 aa  275  9e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.86 
 
 
336 aa  265  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  43.99 
 
 
331 aa  264  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  41.59 
 
 
348 aa  263  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  43.79 
 
 
330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  42.82 
 
 
331 aa  256  5e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  43.49 
 
 
330 aa  256  6e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  43.49 
 
 
330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  43.07 
 
 
330 aa  251  1e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  41.59 
 
 
336 aa  246  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  42.95 
 
 
364 aa  244  9.999999999999999e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  41.98 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.64 
 
 
326 aa  243  5e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.81 
 
 
333 aa  242  6e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2762  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.83 
 
 
326 aa  242  7.999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  40.52 
 
 
335 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  41.09 
 
 
336 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.21 
 
 
339 aa  240  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.19 
 
 
331 aa  240  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  41.59 
 
 
336 aa  240  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  41.74 
 
 
335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  41.74 
 
 
335 aa  239  4e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  40.46 
 
 
339 aa  239  4e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  42.18 
 
 
336 aa  239  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.07 
 
 
326 aa  239  5.999999999999999e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.71 
 
 
334 aa  238  9e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  40.17 
 
 
339 aa  238  9e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  41.89 
 
 
336 aa  238  9e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  41.89 
 
 
336 aa  238  9e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  40.52 
 
 
335 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  40.52 
 
 
335 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  40.52 
 
 
335 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  41 
 
 
336 aa  238  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  40.52 
 
 
335 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  41 
 
 
336 aa  238  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  41.59 
 
 
336 aa  237  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  40.71 
 
 
335 aa  237  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  40.99 
 
 
340 aa  236  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  40.52 
 
 
337 aa  236  4e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  38.71 
 
 
335 aa  236  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  41 
 
 
335 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.6 
 
 
361 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.82 
 
 
348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.27 
 
 
362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  40.12 
 
 
335 aa  232  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.53 
 
 
332 aa  231  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  40.79 
 
 
335 aa  231  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  41.72 
 
 
336 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0898  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.87 
 
 
327 aa  230  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  41.3 
 
 
335 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.45 
 
 
360 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  39.94 
 
 
385 aa  229  4e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  39.02 
 
 
359 aa  229  6e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0777  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.35 
 
 
345 aa  229  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  39.31 
 
 
359 aa  229  7e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  42.17 
 
 
334 aa  228  8e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  39.88 
 
 
359 aa  228  1e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.75 
 
 
361 aa  228  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.91 
 
 
334 aa  228  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.59 
 
 
333 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.45 
 
 
343 aa  228  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3616  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.96 
 
 
360 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.79276  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.53 
 
 
331 aa  223  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2029  isocitrate dehydrogenase  39.38 
 
 
487 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  42.81 
 
 
335 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.3 
 
 
338 aa  220  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  38.57 
 
 
360 aa  219  3.9999999999999997e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39 
 
 
342 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.62 
 
 
358 aa  219  5e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  38.17 
 
 
323 aa  218  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.44 
 
 
370 aa  217  2e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0665  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  37.61 
 
 
344 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1101  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.3 
 
 
344 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2611  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.36 
 
 
360 aa  215  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0404939  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2488  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.22 
 
 
377 aa  215  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2572  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.36 
 
 
360 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2617  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.36 
 
 
360 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  36.44 
 
 
377 aa  213  2.9999999999999995e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0794  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.03 
 
 
357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.86487  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.13 
 
 
363 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04610  isocitrate dehydrogenase, putative  39.53 
 
 
379 aa  210  4e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.673993  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42313  mitochondrial isocitrate dehydrogenase (NAD+) subunit 2  37.97 
 
 
367 aa  209  7e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00286555  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1797  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.98 
 
 
329 aa  209  7e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0870  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  38.08 
 
 
332 aa  208  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1846  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.93 
 
 
350 aa  208  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1557  isocitrate dehydrogenase  38.94 
 
 
480 aa  207  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  43.12 
 
 
338 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.43 
 
 
357 aa  207  2e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1601  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.93 
 
 
352 aa  206  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0498293 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.31 
 
 
348 aa  206  5e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4313  isocitrate dehydrogenase  39.31 
 
 
456 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0560117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>